EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002620 (Gene tree)
Gene ID: 100401517
Gene Symbol: TRIT1
Alias: FLJ20061|IPT
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 44605 bases
Position: chrNTIC01036611.1:81598434-81643038
Accession: 100401517
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000064126	IPPT	PF01715.17	1.3e-64	1	1
ENSCJAP00000004895	IPPT	PF01715.17	1.9e-64	1	1
ENSCJAP00000004860	IPPT	PF01715.17	3.7e-61	1	1
ENSCJAP00000004874	IPPT	PF01715.17	5.3e-57	1	1
ENSCJAP00000004871	IPPT	PF01715.17	1.4e-31	1	1
ENSCJAP00000004855	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	5.8e-06	1	1
ENSCJAP00000004871	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.7e-05	1	1
ENSCJAP00000004874	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.1e-05	1	1
ENSCJAP00000004895	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.2e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000005162	TRIT1-201	2788	-	ENSCJAP00000004895	467 (aa)	XP_002750692	U3FSI0
ENSCJAT00000071410	TRIT1-202	1436	-	ENSCJAP00000064126	392 (aa)	-	A0A2R8PHT6
ENSCJAT00000005141	TRIT1-203	1326	-	ENSCJAP00000004874	441 (aa)	-	F6XBV9
ENSCJAT00000005126	TRIT1-205	1074	-	ENSCJAP00000004860	357 (aa)	-	F6XZI2
ENSCJAT00000005121	TRIT1-206	492	-	ENSCJAP00000004855	163 (aa)	-	F6Y054
ENSCJAT00000005138	TRIT1-204	1158	-	ENSCJAP00000004871	385 (aa)	-	F6XBX7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc01100	Metabolic pathways	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	95.717	ENSG00000043514	TRIT1	99	97.041	Homo_sapiens
ENSCJAG00000002620	TRIT1	92	65.373	ENSAPOG00000020918	trit1	93	62.731	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.651	ENSAMEG00000004342	TRIT1	100	88.651	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	65.732	ENSACIG00000017409	trit1	89	63.208	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	92	65.373	ENSAOCG00000009850	trit1	87	64.286	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000002620	TRIT1	92	65.373	ENSAPEG00000001481	trit1	87	64.286	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	63.580	ENSATEG00000005426	trit1	86	61.743	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	75	67.213	ENSAPLG00000011421	TRIT1	95	67.568	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	73.292	ENSACAG00000002280	TRIT1	88	69.816	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	97.859	ENSANAG00000030732	TRIT1	100	97.859	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	63.077	ENSACLG00000004920	trit1	93	58.352	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	61.561	ENSAMXG00000010959	trit1	97	59.111	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	89.079	ENSBTAG00000013832	TRIT1	100	89.079	Bos_taurus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	87	37.736	WBGene00001740	gro-1	95	34.279	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.248	ENSCAFG00000003048	TRIT1	100	88.248	Canis_familiaris
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	87.052	ENSCAFG00020003875	TRIT1	100	87.052	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	87.419	ENSCHIG00000013259	TRIT1	99	87.207	Capra_hircus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	90.349	ENSTSYG00000004363	TRIT1	100	89.870	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	80.625	ENSCAPG00000017001	TRIT1	93	85.515	Cavia_aperea
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	85.653	ENSCPOG00000012820	TRIT1	100	85.653	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	96.825	ENSCCAG00000031271	TRIT1	100	96.825	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	94.678	ENSCATG00000034344	TRIT1	100	94.678	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000002620	TRIT1	99	86.266	ENSCLAG00000009828	TRIT1	99	86.266	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	90.625	ENSCSAG00000001137	TRIT1	100	94.404	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	88.132	ENSCHOG00000000435	TRIT1	100	87.794	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000002620	TRIT1	92	61.538	ENSCPBG00000000908	-	100	68.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000002620	TRIT1	85	67.647	ENSCSAVG00000002050	-	75	67.647	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	94.004	ENSCANG00000043008	TRIT1	100	94.004	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	87.580	ENSCGRG00001001894	Trit1	100	87.580	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	83.125	ENSCGRG00000007059	Trit1	91	87.531	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	61.774	ENSCSEG00000009574	trit1	88	60.922	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000002620	TRIT1	52	56.522	ENSCVAG00000000422	trit1	95	59.091	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	76	61.290	ENSCVAG00000016675	trit1	74	60.494	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	61.094	ENSDARG00000032876	trit1	98	62.577	Danio_rerio
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	87.908	ENSDNOG00000001994	TRIT1	100	77.652	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	91	86.319	ENSDORG00000012449	Trit1	97	81.406	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000002620	TRIT1	83	68.421	FBgn0043799	CG31381	77	68.421	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000002620	TRIT1	94	89.881	ENSETEG00000008733	TRIT1	99	87.707	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	57.012	ENSEBUG00000012845	trit1	93	54.524	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	86.875	ENSEASG00005000884	-	100	88.688	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	88.485	ENSECAG00000010597	TRIT1	92	88.211	Equus_caballus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	77.101	ENSEEUG00000009269	TRIT1	100	66.526	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	55.692	ENSELUG00000017278	trit1	84	56.265	Esox_lucius
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	89.451	ENSFCAG00000006029	TRIT1	100	89.079	Felis_catus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	81	76.817	ENSFALG00000000532	TRIT1	94	77.005	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	85.673	ENSFDAG00000003098	TRIT1	99	82.227	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	54.062	ENSFHEG00000022274	trit1	83	79.412	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	60.172	ENSGMOG00000006522	trit1	99	60.321	Gadus_morhua
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	73.410	ENSGALG00000003851	TRIT1	94	73.380	Gallus_gallus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	63.438	ENSGAFG00000018636	trit1	98	62.313	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000002620	TRIT1	95	62.899	ENSGACG00000008493	trit1	99	60.690	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	81	78.276	ENSGAGG00000000522	TRIT1	95	76.883	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	95.503	ENSGGOG00000010070	TRIT1	100	95.503	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	63.692	ENSHBUG00000018999	trit1	93	58.797	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	78.808	ENSHGLG00000009564	-	100	78.112	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	87.805	ENSHGLG00000010308	-	99	87.582	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002620	TRIT1	82	84.328	ENSHGLG00100018159	-	99	68.407	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002620	TRIT1	99	87.609	ENSHGLG00100015382	-	99	87.609	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	63.873	ENSHCOG00000006755	trit1	95	57.322	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000002620	TRIT1	94	60.802	ENSIPUG00000021822	trit1	93	60.802	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	89.507	ENSSTOG00000006446	TRIT1	97	89.507	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	83.333	ENSJJAG00000000316	-	100	83.333	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	91.837	ENSJJAG00000000300	-	99	80.556	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	64.815	ENSKMAG00000021788	trit1	86	64.059	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	61.494	ENSLBEG00000024262	trit1	89	61.253	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	64.589	ENSLACG00000013861	TRIT1	89	65.376	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000002620	TRIT1	92	62.500	ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.545	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.009	ENSLAFG00000016876	TRIT1	100	88.009	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	94.678	ENSMFAG00000001316	TRIT1	100	94.678	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	94.678	ENSMMUG00000016220	TRIT1	100	94.678	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	94.678	ENSMNEG00000023137	TRIT1	100	94.678	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	94.678	ENSMLEG00000035296	TRIT1	100	94.678	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	62.769	ENSMAMG00000005868	trit1	90	60.839	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	62.769	ENSMZEG00005011506	trit1	93	58.129	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000002620	TRIT1	81	76.125	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	75.538	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.437	ENSMAUG00000000399	Trit1	100	88.437	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	91.648	ENSMICG00000016294	TRIT1	100	91.649	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	87.152	ENSMOCG00000008173	Trit1	100	87.152	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000002620	TRIT1	83	64.094	ENSMMOG00000021140	trit1	96	59.179	Mola_mola
ENSCJAG00000002620	TRIT1	93	82.335	ENSMODG00000017650	TRIT1	98	77.412	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	61.538	ENSMALG00000017843	trit1	89	59.906	Monopterus_albus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.223	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	100	88.223	Mus_caroli
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.651	ENSMUSG00000028653	Trit1	100	88.651	Mus_musculus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	87.366	MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.366	Mus_pahari
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.437	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	100	88.437	Mus_spretus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	88.889	ENSMPUG00000014291	TRIT1	100	88.889	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	87.118	ENSMLUG00000000334	TRIT1	99	86.910	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	52	62.500	ENSNBRG00000020509	trit1	97	64.773	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	95.931	ENSNLEG00000012038	TRIT1	100	95.931	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	70.156	ENSMEUG00000005217	TRIT1	99	69.565	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	71.795	ENSOPRG00000003205	-	62	83.333	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	87.246	ENSODEG00000006117	TRIT1	99	83.404	Octodon_degus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	96	61.605	ENSONIG00000015407	trit1	99	56.604	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	80	75.958	ENSOANG00000002779	TRIT1	96	74.868	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	89.868	ENSOCUG00000002054	TRIT1	99	89.914	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	66.462	ENSORLG00000005802	trit1	92	62.824	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	66.154	ENSORLG00020005519	trit1	92	62.588	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	65.538	ENSORLG00015018715	trit1	92	62.353	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	64.000	ENSOMEG00000006569	trit1	95	62.045	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000002620	TRIT1	97	87.719	ENSOGAG00000009571	TRIT1	100	87.821	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000002620	TRIT1	98	88.453	ENSOARG00000020140	TRIT1	99	88.009	Ovis_aries
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