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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002735 (Gene tree)
Gene ID: 100405688
Gene Symbol: SMARCA5
Alias: ISWI|hISWI|hSNF2H
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 5
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 47228 bases
Position: chrNTIC01033278.1:24353421-24400648
Accession: 100405688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000045900	ResIII	PF04851.15	9.7e-11	1	1
ENSCJAP00000045900	DEAD	PF00270.29	5.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000005356	SMARCA5-202	1029	-	ENSCJAP00000005083	342 (aa)	-	F7HSM0
ENSCJAT00000056538	SMARCA5-201	9028	-	ENSCJAP00000045900	1052 (aa)	XP_002745366	F6TP83

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	54	44.077	ENSCJAG00000002406	CHD1L	64	43.805
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	85.137	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	93	85.137

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.525	ENSG00000153147	SMARCA5	100	99.525	Homo_sapiens
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.859	ENSAMEG00000009585	SMARCA5	100	98.859	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	91	96.715	ENSAPLG00000009206	SMARCA5	100	96.715	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	93.913	ENSACAG00000003038	SMARCA5	99	93.913	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.810	ENSANAG00000019345	SMARCA5	100	99.810	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.289	ENSBTAG00000003399	SMARCA5	100	98.289	Bos_taurus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.669	ENSCAFG00000007525	SMARCA5	100	98.669	Canis_familiaris
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	98.643	ENSCAFG00020025641	SMARCA5	99	98.643	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	97.053	ENSCHIG00000016375	-	100	97.053	Capra_hircus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.764	ENSCHIG00000013730	-	100	98.764	Capra_hircus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	97	97.458	ENSTSYG00000009954	SMARCA5	99	99.597	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	99.070	ENSCAPG00000013747	SMARCA5	95	99.070	Cavia_aperea
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	97.909	ENSCPOG00000002259	SMARCA5	100	97.909	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	100.000	ENSCCAG00000027215	SMARCA5	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSCATG00000044917	SMARCA5	100	99.620	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	95.211	ENSCLAG00000006153	SMARCA5	100	99.295	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	99.897	ENSCSAG00000003448	SMARCA5	100	99.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	90	98.405	ENSCHOG00000011724	SMARCA5	90	98.405	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	98.195	ENSCPBG00000027535	SMARCA5	96	98.195	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.430	ENSCANG00000041629	SMARCA5	100	99.430	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	97.814	ENSCGRG00001012719	Smarca5	99	97.814	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	99.297	ENSCGRG00000001417	Smarca5	99	99.396	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	95.455	ENSDNOG00000009158	SMARCA5	97	95.878	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	90	90.717	ENSDORG00000003466	Smarca5	97	90.717	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	81.485	ENSEBUG00000014773	SMARCA5	96	85.847	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.049	ENSEASG00005001866	SMARCA5	100	99.049	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.049	ENSECAG00000002676	SMARCA5	100	99.049	Equus_caballus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	95.166	ENSEEUG00000013176	SMARCA5	100	95.166	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	89.485	ENSELUG00000014653	SMARCA5	99	89.485	Esox_lucius
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.859	ENSFCAG00000004544	SMARCA5	100	98.859	Felis_catus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	97.320	ENSFALG00000004987	SMARCA5	100	97.320	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	95.785	ENSFDAG00000021016	SMARCA5	100	99.496	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	85.043	ENSGMOG00000007519	SMARCA5	94	89.560	Gadus_morhua
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	97	95.976	ENSGALG00000009913	SMARCA5	96	97.490	Gallus_gallus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	88.393	ENSGACG00000017238	SMARCA5	95	90.686	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	97.137	ENSGAGG00000019882	SMARCA5	96	98.295	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.525	ENSGGOG00000012595	SMARCA5	100	99.525	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	97.909	ENSHGLG00000000816	-	99	97.909	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	89.275	ENSHGLG00000000317	-	95	89.659	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	98.211	ENSHGLG00100018421	-	100	99.396	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.670	ENSSTOG00000010683	SMARCA5	99	98.670	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	97.529	ENSJJAG00000014965	Smarca5	100	97.529	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	95.459	ENSLACG00000007091	SMARCA5	97	95.459	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	92.386	ENSLOCG00000008966	SMARCA5	96	92.386	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.669	ENSLAFG00000007795	SMARCA5	100	98.669	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSMFAG00000043649	SMARCA5	100	99.620	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSMMUG00000000829	SMARCA5	100	99.620	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSMNEG00000031916	SMARCA5	100	99.620	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSMLEG00000042393	SMARCA5	100	99.620	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	97.100	ENSMGAG00000003517	SMARCA5	99	97.100	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	99.496	ENSMAUG00000015902	Smarca5	98	99.496	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.049	ENSMICG00000003971	SMARCA5	100	99.049	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	97.624	ENSMOCG00000016986	-	99	97.624	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	95.924	ENSMODG00000000391	SMARCA5	95	98.996	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	97.814	ENSMUSG00000031715	Smarca5	100	97.814	Mus_musculus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.004	MGP_PahariEiJ_G0022862	Smarca5	100	98.004	Mus_pahari
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.859	ENSMLUG00000000468	SMARCA5	100	98.859	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.004	ENSNGAG00000000441	Smarca5	100	98.004	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSNLEG00000005383	SMARCA5	100	99.620	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	91.322	ENSMEUG00000001267	SMARCA5	100	91.322	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	85	98.429	ENSOPRG00000014427	SMARCA5	86	98.429	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	99.071	ENSOANG00000013921	SMARCA5	100	99.071	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	99.690	ENSOCUG00000013042	SMARCA5	100	99.690	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.049	ENSOGAG00000009702	SMARCA5	100	99.049	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	98.573	ENSOARG00000010589	SMARCA5	99	98.573	Ovis_aries
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.335	ENSPPAG00000028523	SMARCA5	100	99.335	Pan_paniscus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	97	93.359	ENSPPRG00000004925	SMARCA5	97	94.210	Panthera_pardus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	99.109	ENSPTIG00000020959	SMARCA5	97	99.109	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.430	ENSPTRG00000016472	SMARCA5	100	99.430	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.620	ENSPANG00000001175	SMARCA5	100	99.620	Papio_anubis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	93	91.104	ENSPKIG00000015885	SMARCA5	100	91.340	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	93	90.881	ENSPKIG00000015699	SMARCA5	98	89.835	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	95.988	ENSPSIG00000004177	SMARCA5	100	95.988	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	92	90.226	ENSPMGG00000012316	SMARCA5	100	90.226	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	97	97.839	ENSPEMG00000008060	Smarca5	99	97.839	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	69.216	ENSPMAG00000006011	SMARCA5	80	86.062	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	61	86.739	ENSPMAG00000008026	SMARCA5	99	86.739	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	95.648	ENSPCIG00000003926	SMARCA5	95	98.996	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.525	ENSPPYG00000015091	SMARCA5	100	99.525	Pongo_abelii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	86	90.541	ENSPCAG00000014230	SMARCA5	88	90.783	Procavia_capensis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	96.293	ENSPCOG00000026744	SMARCA5	100	96.293	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	99	98.573	ENSPVAG00000006482	SMARCA5	100	98.573	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	97	87.941	ENSPNAG00000027824	SMARCA5	97	90.249	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	99.397	ENSRNOG00000018149	Smarca5	100	99.397	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.430	ENSRBIG00000044644	SMARCA5	100	99.430	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	99.322	ENSRROG00000029591	SMARCA5	99	99.698	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	99.715	ENSSBOG00000036257	SMARCA5	100	99.715	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	98.993	ENSSHAG00000008464	SMARCA5	100	98.993	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	94	90.151	ENSSFOG00015013252	SMARCA5	97	90.151	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	94.169	ENSSPUG00000007604	SMARCA5	99	96.281	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.194	ENSSSCG00000009047	SMARCA5	100	98.194	Sus_scrofa
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	96	96.127	ENSTGUG00000002408	SMARCA5	99	96.127	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	98	98.837	ENSUAMG00000023495	SMARCA5	99	98.837	Ursus_americanus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	99.302	ENSUMAG00000015324	SMARCA5	97	99.302	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.289	ENSVPAG00000008982	SMARCA5	100	98.289	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	100	98.859	ENSVVUG00000017473	SMARCA5	100	98.859	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000002735	SMARCA5	95	88.867	ENSXETG00000017566	smarca5	95	93.228	Xenopus_tropicalis