EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002845 (Gene tree)
Gene ID: 100896943
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16363 bases
Position: chrNTIC01008890.1:41785963-41802325
Accession: 100896943
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000061394	MMR_HSR1	PF01926.23	5.7e-08	1	1
ENSCJAP00000005172	MMR_HSR1	PF01926.23	8.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000005451	SRPRB-201	3437	-	ENSCJAP00000005172	271 (aa)	XP_003735115	F7IEY6
ENSCJAT00000080572	SRPRB-202	1564	-	ENSCJAP00000061394	230 (aa)	XP_017821346	A0A2R8PDK3

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000002845's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000002845's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	95.941	ENSG00000144867	SRPRB	99	97.484	Homo_sapiens
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	99.262	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	99.262	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	91.513	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	91.513	Bos_taurus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.775	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	90.775	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	90.406	Capra_hircus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	90.037	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	83.764	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	83.764	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	97.048	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	97.048	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	97.048	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	85.978	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	85.978	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	79.336	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	79.336	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	90.037	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000002845	SRPRB	95	90.698	ENSCGRG00000014367	Srprb	99	90.698	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	91.144	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	91.144	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	86	86.638	ENSDORG00000000764	Srprb	85	89.041	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	92.251	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	92.251	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	92.251	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	92.251	Equus_caballus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	90.406	Felis_catus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.037	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	96.679	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	96.679	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	90.037	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	90.037	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	83.764	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	97.048	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	97.048	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	97.048	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	97.048	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	97.048	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	90.406	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	92.989	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	92.989	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	96	84.556	ENSMODG00000018493	SRPRB	97	84.556	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.299	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	89.299	Mus_caroli
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.299	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	89.299	Mus_musculus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	89.668	Mus_pahari
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.299	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	89.299	Mus_spretus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	90.406	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	88.930	ENSNGAG00000024311	-	100	88.930	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	96.310	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	96.310	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.299	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	89.299	Octodon_degus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	92.989	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	92.989	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	92.620	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	92.620	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000002845	SRPRB	85	90.000	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	93.151	Ovis_aries
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	95.941	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	95.941	Pan_paniscus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	90.406	Panthera_pardus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.775	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.775	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	95.941	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	95.941	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	96.310	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	96.310	Papio_anubis
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	91.513	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	91.513	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	95.572	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	95.572	Pongo_abelii
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	81.919	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	81.919	Procavia_capensis
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	90.037	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	96.679	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	96.679	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	96.679	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	96.679	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000002845	SRPRB	87	97.015	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	97.015	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.668	Sorex_araneus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.668	Sus_scrofa
ENSCJAG00000002845	SRPRB	93	90.514	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	83.395	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	83.395	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.406	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	90.406	Ursus_americanus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	90.037	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.775	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	90.775	Vulpes_vulpes