EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000002933 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2789 bases
Position: chrNTIC01034389.1:98671764-98674552
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000067711	RRM_1	PF00076.22	1.3e-12	1	1
ENSCJAP00000005309	RRM_1	PF00076.22	1.4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000069085	-	510	-	ENSCJAP00000067711	169 (aa)	-	A0A2R8PNN3
ENSCJAT00000005601	-	531	-	ENSCJAP00000005309	176 (aa)	-	F7ILW8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000002933	-	54	75.248	ENSCJAG00000038575	SRSF12	63	53.529
ENSCJAG00000002933	-	96	84.746	ENSCJAG00000010608	-	92	84.302
ENSCJAG00000002933	-	91	88.757	ENSCJAG00000044116	SRSF10	66	88.372

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSG00000188529	SRSF10	99	83.041	Homo_sapiens
ENSCJAG00000002933	-	91	86.550	ENSAMEG00000009869	SRSF10	66	86.207	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000002933	-	80	85.906	ENSAPLG00000005446	SRSF10	63	85.526	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000002933	-	91	83.041	ENSACAG00000005327	SRSF10	68	82.759	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000002933	-	99	82.418	ENSANAG00000029200	-	69	82.558	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002933	-	93	84.848	ENSANAG00000033569	-	91	88.679	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002933	-	91	77.640	ENSANAG00000033337	-	87	76.923	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000002933	-	89	86.585	ENSBTAG00000008072	SRSF10	90	82.927	Bos_taurus
ENSCJAG00000002933	-	89	84.810	ENSBTAG00000054307	-	77	84.810	Bos_taurus
ENSCJAG00000002933	-	88	82.716	ENSCAFG00000003095	-	64	82.036	Canis_familiaris
ENSCJAG00000002933	-	91	85.207	ENSCAFG00020020795	-	64	84.884	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000002933	-	80	85.315	ENSCHIG00000000308	-	88	85.315	Capra_hircus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSTSYG00000009439	-	99	83.041	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000002933	-	85	80.380	ENSCAPG00000014746	SRSF10	88	87.324	Cavia_aperea
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSCPOG00000034102	SRSF10	90	87.805	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSCCAG00000022497	SRSF10	94	87.730	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002933	-	79	73.759	ENSCCAG00000033919	-	71	70.213	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002933	-	89	75.641	ENSCCAG00000024936	-	88	72.436	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSCATG00000031598	SRSF10	99	83.041	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSCLAG00000015555	SRSF10	90	87.805	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000002933	-	81	87.586	ENSCHOG00000004836	-	95	86.957	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000002933	-	91	84.568	ENSCHOG00000007773	-	100	87.117	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000002933	-	91	86.550	ENSCPBG00000000469	SRSF10	66	86.207	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000002933	-	77	87.413	ENSCANG00000042227	-	99	81.879	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002933	-	81	85.517	ENSCANG00000037293	-	90	86.957	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002933	-	81	84.138	ENSCANG00000037461	-	63	84.615	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002933	-	90	82.036	ENSCANG00000041113	-	66	81.395	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002933	-	84	58.974	ENSCANG00000010607	-	60	54.487	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000002933	-	91	87.574	ENSCGRG00001017946	Srsf10	90	87.805	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000002933	-	91	76.331	ENSCGRG00000011531	Srsf10	66	87.413	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000002933	-	75	58.209	ENSDNOG00000048051	-	71	65.263	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002933	-	87	67.081	ENSDNOG00000048916	-	61	67.500	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSDORG00000024574	Srsf10	90	83.537	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000002933	-	91	86.982	ENSEASG00005004349	SRSF10	66	86.628	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSECAG00000023709	SRSF10	66	87.791	Equus_caballus
ENSCJAG00000002933	-	91	85.882	ENSEEUG00000014286	SRSF10	66	85.549	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000002933	-	91	87.574	ENSFCAG00000045556	SRSF10	99	82.456	Felis_catus
ENSCJAG00000002933	-	91	85.799	ENSFALG00000000505	SRSF10	66	85.465	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000002933	-	94	65.517	ENSFDAG00000021316	-	66	60.000	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002933	-	79	73.469	ENSFDAG00000005977	-	92	75.887	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002933	-	91	85.799	ENSFDAG00000019418	SRSF10	65	85.465	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000002933	-	91	86.982	ENSGALG00000004133	SRSF10	66	86.628	Gallus_gallus
ENSCJAG00000002933	-	60	73.394	ENSGAFG00000014771	srsf10b	58	67.890	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000002933	-	91	86.550	ENSGAGG00000005357	SRSF10	66	86.207	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000002933	-	92	69.136	ENSGGOG00000036220	-	64	59.740	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSGGOG00000000392	SRSF10	99	83.041	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002933	-	86	64.151	ENSGGOG00000042323	-	92	55.975	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000002933	-	89	73.333	ENSHGLG00000018327	-	62	71.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSHGLG00000010879	-	90	87.805	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000002933	-	91	85.799	ENSHGLG00100008152	-	65	85.465	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002933	-	89	73.333	ENSHGLG00100011571	-	61	71.154	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSSTOG00000000956	SRSF10	90	83.537	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSJJAG00000009074	Srsf10	90	83.537	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000002933	-	89	85.976	ENSJJAG00000014552	-	90	82.317	Jaculus_jaculus
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ENSCJAG00000002933	-	91	87.135	ENSLAFG00000026905	SRSF10	66	86.782	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSMFAG00000046011	SRSF10	99	83.041	Macaca_fascicularis
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ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSMNEG00000041500	SRSF10	90	87.805	Macaca_nemestrina
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ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSMLEG00000016013	SRSF10	99	83.041	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000002933	-	80	85.906	ENSMGAG00000005772	SRSF10	63	85.526	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSMAUG00000019452	Srsf10	90	87.805	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000002933	-	89	87.805	ENSMICG00000017029	-	93	87.805	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSMICG00000047638	SRSF10	84	93.103	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002933	-	72	77.612	ENSMICG00000037744	-	54	69.853	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000002933	-	91	85.799	ENSMOCG00000013656	Srsf10	65	85.465	Microtus_ochrogaster
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ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	MGP_CAROLIEiJ_G0026645	Srsf10	90	87.805	Mus_caroli
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSMUSG00000028676	Srsf10	90	87.805	Mus_musculus
ENSCJAG00000002933	-	58	84.906	MGP_PahariEiJ_G0028978	-	83	84.615	Mus_pahari
ENSCJAG00000002933	-	89	87.805	MGP_SPRETEiJ_G0027625	-	90	87.805	Mus_spretus
ENSCJAG00000002933	-	91	87.574	ENSMPUG00000015845	SRSF10	66	87.209	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000002933	-	91	87.574	ENSMLUG00000005293	-	68	87.209	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000002933	-	91	87.135	ENSMLUG00000028520	SRSF10	66	86.782	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSNGAG00000000067	Srsf10	90	83.537	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSNLEG00000027520	SRSF10	99	83.041	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSOPRG00000018613	SRSF10	66	87.791	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000002933	-	89	75.641	ENSODEG00000002658	-	78	72.436	Octodon_degus
ENSCJAG00000002933	-	91	85.207	ENSODEG00000018739	-	66	84.884	Octodon_degus
ENSCJAG00000002933	-	98	86.188	ENSODEG00000020016	-	66	86.047	Octodon_degus
ENSCJAG00000002933	-	98	86.188	ENSODEG00000019549	-	79	86.047	Octodon_degus
ENSCJAG00000002933	-	98	64.088	ENSODEG00000007110	-	68	62.791	Octodon_degus
ENSCJAG00000002933	-	81	87.586	ENSOCUG00000024013	-	84	86.957	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002933	-	90	73.494	ENSOCUG00000028110	-	90	71.084	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002933	-	81	86.207	ENSOCUG00000021782	-	84	85.507	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000002933	-	91	85.207	ENSOARG00000002384	-	62	84.884	Ovis_aries
ENSCJAG00000002933	-	81	84.138	ENSOARG00000015607	-	74	83.333	Ovis_aries
ENSCJAG00000002933	-	80	86.000	ENSOARG00000006984	-	59	85.621	Ovis_aries
ENSCJAG00000002933	-	91	84.615	ENSOARG00000000073	-	66	84.302	Ovis_aries
ENSCJAG00000002933	-	86	77.483	ENSPPAG00000007053	-	92	74.172	Pan_paniscus
ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSPPAG00000032557	SRSF10	95	87.730	Pan_paniscus
ENSCJAG00000002933	-	91	83.041	ENSPPRG00000001945	-	65	82.759	Panthera_pardus
ENSCJAG00000002933	-	91	87.574	ENSPPRG00000005806	SRSF10	99	82.456	Panthera_pardus
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ENSCJAG00000002933	-	87	78.710	ENSPTIG00000012013	-	81	78.481	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000002933	-	86	73.585	ENSPTRG00000051779	-	93	70.440	Pan_troglodytes
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ENSCJAG00000002933	-	91	88.166	ENSPCOG00000022379	SRSF10	99	83.041	Propithecus_coquereli
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ENSCJAG00000002933	-	89	87.805	ENSRNOG00000007992	Srsf10	100	87.805	Rattus_norvegicus
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ENSCJAG00000002933	-	91	79.290	ENSRBIG00000044085	-	97	77.848	Rhinopithecus_bieti
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