EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000003720 (Gene tree)
Gene ID: 100402621
Gene Symbol: PUS1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6392 bases
Position: chrNTIC01000002.1:11572961-11579352
Accession: 15508
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000006746	PseudoU_synth_1	PF01416.20	3.8e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000007124	PUS1-201	1104	-	ENSCJAP00000006746	367 (aa)	-	F7EQ10

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.131	ENSG00000177192	PUS1	68	96.063	Homo_sapiens
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	68.182	ENSAPOG00000007254	pus1	60	68.504	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	85.393	ENSAMEG00000013715	PUS1	65	85.393	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.767	ENSACIG00000009169	pus1	62	69.412	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.380	ENSAOCG00000022207	pus1	60	69.685	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.380	ENSAPEG00000006039	pus1	65	69.685	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000003720	PUS1	71	68.199	ENSATEG00000020688	pus1	65	68.898	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	78.988	ENSACAG00000007367	PUS1	68	79.134	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.880	ENSANAG00000036192	PUS1	78	96.457	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.884	ENSACLG00000020868	pus1	65	70.472	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	70.312	ENSAMXG00000008710	pus1	59	70.356	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	86.891	ENSBTAG00000012990	PUS1	64	87.795	Bos_taurus
ENSCJAG00000003720	PUS1	71	40.364	WBGene00004248	pus-1	69	37.801	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	85.768	ENSCAFG00000006429	PUS1	64	87.008	Canis_familiaris
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	85.768	ENSCAFG00020010737	PUS1	59	87.008	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	86.517	ENSCHIG00000000487	PUS1	64	87.402	Capra_hircus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	88.390	ENSTSYG00000032605	PUS1	76	88.390	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	89.723	ENSCAPG00000006421	PUS1	79	89.764	Cavia_aperea
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	89.105	ENSCPOG00000001027	PUS1	75	89.147	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	96.063	ENSCCAG00000015879	PUS1	70	96.063	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.506	ENSCATG00000032870	PUS1	73	95.506	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	88.327	ENSCLAG00000011689	PUS1	74	88.327	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.131	ENSCSAG00000001879	PUS1	63	95.131	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	80.545	ENSCPBG00000024715	PUS1	72	80.709	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	43.191	ENSCING00000009426	-	67	43.701	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	43.701	ENSCSAVG00000003751	-	52	43.701	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	83.516	ENSCANG00000035561	PUS1	76	83.516	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	91.513	ENSCGRG00001019592	Pus1	74	91.860	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	91.513	ENSCGRG00000004048	Pus1	74	91.860	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	68.093	ENSCSEG00000003629	pus1	60	68.504	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	68.165	ENSCVAG00000001265	pus1	61	70.472	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	64.706	ENSDARG00000045562	pus1	91	66.798	Danio_rerio
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	84.091	ENSDNOG00000045576	PUS1	78	85.039	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	91.011	ENSDORG00000011455	Pus1	82	91.011	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	50.000	FBgn0038811	PUS1	62	50.000	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	84.585	ENSETEG00000019160	PUS1	62	84.585	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	40.580	ENSEBUG00000000368	-	51	40.580	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000003720	PUS1	71	88.506	ENSEASG00005016535	PUS1	59	88.583	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	88.258	ENSECAG00000006965	PUS1	64	88.976	Equus_caballus
ENSCJAG00000003720	PUS1	75	65.827	ENSELUG00000010424	pus1	65	68.504	Esox_lucius
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	84.644	ENSFCAG00000010780	PUS1	60	85.433	Felis_catus
ENSCJAG00000003720	PUS1	75	77.536	ENSFALG00000008273	PUS1	59	82.283	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	88.192	ENSFDAG00000012518	PUS1	62	90.551	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.380	ENSFHEG00000010504	pus1	62	69.685	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	66.667	ENSGMOG00000008143	pus1	65	66.929	Gadus_morhua
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	81.641	ENSGALG00000002354	PUS1	62	82.283	Gallus_gallus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.380	ENSGAFG00000006578	pus1	61	69.685	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000003720	PUS1	81	61.967	ENSGACG00000017566	pus1	90	63.014	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	75	74.729	ENSGAGG00000016730	-	73	79.134	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	94.382	ENSGGOG00000009178	PUS1	68	95.276	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.884	ENSHBUG00000001316	pus1	65	70.472	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	84.444	ENSHGLG00000016086	PUS1	75	86.822	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	84.074	ENSHGLG00100019362	PUS1	75	86.434	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.767	ENSHCOG00000014288	pus1	59	70.079	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000003720	PUS1	78	68.881	ENSIPUG00000010387	pus1	71	68.531	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	89.888	ENSSTOG00000011245	PUS1	63	89.888	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	88.192	ENSJJAG00000000088	Pus1	78	88.192	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	67.829	ENSKMAG00000012702	pus1	61	68.110	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	68.605	ENSLBEG00000002845	pus1	63	68.898	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	76.426	ENSLACG00000018598	PUS1	63	77.559	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	53.125	ENSLACG00000016044	-	77	53.755	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	75.092	ENSLOCG00000006127	pus1	64	79.051	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	71	84.291	ENSLAFG00000028731	PUS1	68	84.646	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.131	ENSMFAG00000041194	PUS1	73	95.131	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	94.465	ENSMMUG00000031463	PUS1	73	96.063	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.506	ENSMNEG00000002814	PUS1	73	95.506	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.506	ENSMLEG00000043560	PUS1	82	95.506	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	67.829	ENSMAMG00000007371	pus1	60	68.110	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.884	ENSMZEG00005017746	pus1	60	70.472	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	82.490	ENSMGAG00000001958	PUS1	77	83.071	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	91.144	ENSMAUG00000001482	Pus1	74	91.860	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000003720	PUS1	75	89.130	ENSMICG00000030980	PUS1	69	88.448	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	91.882	ENSMOCG00000022311	Pus1	74	92.636	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	66.292	ENSMMOG00000021022	pus1	65	68.110	Mola_mola
ENSCJAG00000003720	PUS1	71	80.000	ENSMODG00000015551	PUS1	57	80.709	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	64.234	ENSMALG00000013202	pus1	62	67.323	Monopterus_albus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	90.775	MGP_CAROLIEiJ_G0027551	Pus1	74	91.860	Mus_caroli
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	90.775	ENSMUSG00000029507	Pus1	74	91.860	Mus_musculus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	90.476	MGP_PahariEiJ_G0024133	Pus1	79	90.476	Mus_pahari
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	90.775	MGP_SPRETEiJ_G0028549	Pus1	74	91.860	Mus_spretus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	84.644	ENSMPUG00000002314	PUS1	64	85.827	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	84.644	ENSMLUG00000015790	PUS1	70	85.827	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	91.513	ENSNGAG00000012976	Pus1	78	91.513	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.498	ENSNBRG00000020502	pus1	68	70.079	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	94.757	ENSNLEG00000008505	PUS1	84	94.757	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000003720	PUS1	60	78.378	ENSMEUG00000002825	PUS1	59	78.899	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000003720	PUS1	61	88.889	ENSOPRG00000002701	-	57	90.323	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000003720	PUS1	75	86.496	ENSODEG00000008248	PUS1	82	86.496	Octodon_degus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.884	ENSONIG00000003803	pus1	72	70.196	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	79.457	ENSOANG00000010619	PUS1	58	79.134	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	90.909	ENSOCUG00000007310	PUS1	55	90.945	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	70.155	ENSORLG00000010787	pus1	61	70.079	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	70.543	ENSORLG00020011483	pus1	61	70.472	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	70.930	ENSORLG00015023012	pus1	65	70.866	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	69.380	ENSOMEG00000022655	pus1	60	69.291	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	92.126	ENSOGAG00000008720	PUS1	66	92.126	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	86.142	ENSOARG00000013316	PUS1	59	87.008	Ovis_aries
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	94.757	ENSPPAG00000040971	PUS1	68	95.669	Pan_paniscus
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	84.644	ENSPPRG00000015456	PUS1	64	85.433	Panthera_pardus
ENSCJAG00000003720	PUS1	69	85.433	ENSPTIG00000004201	PUS1	66	85.433	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	94.007	ENSPTRG00000005643	PUS1	68	95.276	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000003720	PUS1	73	95.131	ENSPANG00000000376	PUS1	73	95.131	Papio_anubis
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	72.374	ENSPKIG00000019369	pus1	58	72.332	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000003720	PUS1	75	75.725	ENSPSIG00000016432	PUS1	65	75.180	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000003720	PUS1	72	67.424	ENSPMGG00000004522	pus1	72	68.504	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000003720	PUS1	74	92.620	ENSPEMG00000013448	Pus1	75	93.023	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000003720	PUS1	70	57.031	ENSPMAG00000004636	pus1	77	57.480	Petromyzon_marinus
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ENSCJAG00000003720	PUS1	73	94.757	ENSPPYG00000005132	PUS1	60	96.063	Pongo_abelii
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