EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000004063 (Gene tree)
Gene ID: 100401220
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: ARCD1|ARP1
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12078 bases
Position: chrNTIC01022223.1:125602360-125614437
Accession: 100401220
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000007373	APOBEC_N	PF08210.11	4.3e-51	1	1
ENSCJAP00000060356	APOBEC_N	PF08210.11	4.3e-51	1	1
ENSCJAP00000007373	APOBEC_C	PF05240.14	3.9e-25	1	1
ENSCJAP00000060356	APOBEC_C	PF05240.14	3.9e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000007793	APOBEC2-202	1716	-	ENSCJAP00000007373	224 (aa)	XP_002746566	F6QZ00
ENSCJAT00000069554	APOBEC2-201	4429	-	ENSCJAP00000060356	224 (aa)	XP_002746566	F6QZ00

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	58	33.846	ENSCJAG00000015317	-	83	35.398
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	77	35.028	ENSCJAG00000018856	AICDA	86	31.792

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	96.875	ENSG00000124701	APOBEC2	100	96.875	Homo_sapiens
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	54.751	ENSAPOG00000019390	apobec2b	69	58.639	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	83.333	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	76	83.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	55.656	ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	55.729	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	96	54.378	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	57.732	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	55.251	ENSAOCG00000023355	apobec2b	69	59.162	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	55.251	ENSAPEG00000004591	apobec2b	69	59.162	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	96	54.378	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	57.732	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	54.545	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	59.686	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	55.505	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	84	82.632	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	76.636	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	73.298	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	77.222	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	99.107	ENSANAG00000026993	APOBEC2	100	99.107	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	80	52.778	ENSACLG00000026736	-	97	52.778	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	55.046	ENSACLG00000007634	APOBEC2	69	59.686	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	96	58.605	ENSAMXG00000015966	apobec2b	75	58.411	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	50.673	ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.106	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	91.518	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	72	91.518	Bos_taurus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.857	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	100	92.857	Canis_familiaris
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	93.304	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	100	93.304	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.857	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	100	92.857	Capra_hircus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	96.667	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	100	93.833	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	90.995	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	93	90.566	Cavia_aperea
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	90.995	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	93	90.566	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	99.554	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	100	99.554	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	95.536	ENSCATG00000010691	APOBEC2	100	95.536	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	89.035	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	93	91.509	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.768	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	100	97.768	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	80	95.556	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	95.556	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	83	81.283	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	95	77.725	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.321	ENSCANG00000035072	APOBEC2	100	97.321	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	93.304	ENSCGRG00001014983	Apobec2	100	93.304	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	93.304	ENSCGRG00000007835	Apobec2	100	93.304	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	57.014	ENSCSEG00000020201	apobec2a	80	57.488	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	57.592	ENSCSEG00000000690	-	69	57.592	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	56.306	ENSCVAG00000012342	apobec2b	75	59.420	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	95	57.604	ENSDARG00000113992	apobec2b	77	58.491	Danio_rerio
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	61.658	ENSDARG00000018881	apobec2a	76	59.809	Danio_rerio
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	66.376	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	100	65.502	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.140	ENSDORG00000006447	Apobec2	93	93.868	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	89.573	ENSETEG00000000624	APOBEC2	93	89.151	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	92.708	ENSEASG00005002937	APOBEC2	100	92.708	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.857	ENSECAG00000006576	APOBEC2	100	92.857	Equus_caballus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	88.839	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	88.839	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	56.771	ENSELUG00000003736	apobec2a	69	55.224	Esox_lucius
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	91.964	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	100	91.964	Felis_catus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	60.619	ENSFALG00000003910	APOBEC2	95	62.150	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	90.222	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	100	90.222	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	59.361	ENSFHEG00000005492	apobec2b	79	62.827	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	80	61.667	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	61.667	Gadus_morhua
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	56.021	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	56.021	Gadus_morhua
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	81.152	ENSGALG00000003226	APOBEC2	96	76.389	Gallus_gallus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	62.304	ENSGAFG00000007634	apobec2b	60	62.304	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	58.031	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	58.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	57.513	ENSGACG00000009663	apobec2b	83	57.513	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	83	80.749	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	76.887	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	94.783	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	100	94.783	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	55.505	ENSHBUG00000005993	apobec2b	69	60.209	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	54.054	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	58.549	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	90.521	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	93	90.094	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	90.521	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	93	90.094	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	89	56.281	ENSHCOG00000020319	apobec2a	78	56.281	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	60.104	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	71	60.104	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	93	58.019	ENSIPUG00000013784	Apobec2	78	58.019	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	52.968	ENSIPUG00000017355	apobec2a	54	57.949	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	93.304	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	100	93.304	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	89.286	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	89.286	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	54.299	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	60.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	53.125	ENSLBEG00000025214	apobec2a	82	56.650	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	52.968	ENSLBEG00000009422	-	66	58.115	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	93	66.507	ENSLACG00000015985	APOBEC2	89	66.507	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	90	61.692	ENSLOCG00000012415	apobec2b	71	61.692	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	95.261	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	100	94.196	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.768	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	100	97.768	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.768	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	100	97.768	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.768	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	100	97.768	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.768	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	100	97.768	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	56.561	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	68	60.733	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	98	56.561	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	60.309	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	55.046	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	69	59.686	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	53.604	ENSMZEG00005005240	-	94	54.651	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	81.152	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	80.663	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	93.304	ENSMAUG00000011016	Apobec2	100	93.304	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	91.964	ENSMICG00000043339	APOBEC2	100	91.964	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.857	ENSMOCG00000001904	Apobec2	100	92.857	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	52	46.552	ENSMMOG00000009531	-	67	46.154	Mola_mola
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	96	53.488	ENSMMOG00000008681	apobec2b	76	54.808	Mola_mola
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	86.607	ENSMODG00000013090	APOBEC2	95	88.995	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	58.763	ENSMALG00000020523	apobec2a	76	58.763	Monopterus_albus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	59.162	ENSMALG00000013779	APOBEC2	72	59.162	Monopterus_albus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	91.964	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	100	91.964	Mus_caroli
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	91.964	ENSMUSG00000040694	Apobec2	100	91.964	Mus_musculus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.411	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	92.411	Mus_pahari
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	91.469	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	91	91.469	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	90.952	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	100	88.261	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.857	ENSNGAG00000013717	Apobec2	100	92.857	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	54.054	ENSNBRG00000018806	apobec2b	61	59.686	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	86	59.375	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	59.375	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	97.321	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.321	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	86.607	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	95	88.571	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	90.351	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	100	91.667	Ochotona_princeps
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