EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000004132 (Gene tree)
Gene ID: 100390940
Gene Symbol: AGO2
Alias: CASC7|EIF2C2|LINC00980|Q10|hAGO2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 108359 bases
Position: chrNTIC01007779.1:42190127-42298485
Accession: 3263
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000007592	PAZ	PF02170.22	1.2e-26	1	1
ENSCJAP00000007586	PAZ	PF02170.22	1.3e-26	1	1
ENSCJAP00000060282	PAZ	PF02170.22	1.3e-26	1	1
ENSCJAP00000065372	PAZ	PF02170.22	1.3e-26	1	1
ENSCJAP00000056892	PAZ	PF02170.22	1.3e-26	1	1
ENSCJAP00000059302	PAZ	PF02170.22	1.3e-26	1	1
ENSCJAP00000060066	PAZ	PF02170.22	1.4e-26	1	1
ENSCJAP00000060282	Piwi	PF02171.17	3.2e-115	1	1
ENSCJAP00000007586	Piwi	PF02171.17	3.2e-115	1	1
ENSCJAP00000065372	Piwi	PF02171.17	3.3e-115	1	1
ENSCJAP00000056892	Piwi	PF02171.17	3.3e-115	1	1
ENSCJAP00000059302	Piwi	PF02171.17	3.3e-115	1	1
ENSCJAP00000060066	Piwi	PF02171.17	3.4e-115	1	1
ENSCJAP00000007592	Piwi	PF02171.17	3.2e-93	1	2
ENSCJAP00000007592	Piwi	PF02171.17	3.2e-93	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000008020	AGO2-206	2577	-	ENSCJAP00000007586	858 (aa)	-	F6QND0
ENSCJAT00000072044	AGO2-204	2610	-	ENSCJAP00000056892	869 (aa)	-	A0A2R8MBG2
ENSCJAT00000072701	AGO2-201	2583	-	ENSCJAP00000065372	860 (aa)	-	U3DTC5
ENSCJAT00000008027	AGO2-202	2481	-	ENSCJAP00000007592	826 (aa)	-	F6QM52
ENSCJAT00000072537	AGO2-205	2640	-	ENSCJAP00000060066	879 (aa)	-	A0A2R8MI44
ENSCJAT00000080145	AGO2-203	2577	-	ENSCJAP00000060282	858 (aa)	-	A0A2R8N5J5
ENSCJAT00000077674	AGO2-207	2613	-	ENSCJAP00000059302	870 (aa)	-	A0A2R8PAK6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	79.653	ENSCJAG00000031580	AGO3	98	81.020
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	77.701	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	79.034
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	83.890	ENSCJAG00000032023	AGO1	98	83.890

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.884	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.445	ENSAPOG00000017586	ago2	96	93.445	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.649	ENSAMEG00000005019	AGO2	100	99.417	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000004132	AGO2	81	93.669	ENSACIG00000001179	ago2	96	93.669	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.921	ENSAOCG00000015307	ago2	96	93.921	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.921	ENSAPEG00000018425	ago2	96	93.921	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.388	ENSATEG00000000529	ago2	97	93.270	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.061	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	99.061	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	98.485	ENSACAG00000000167	AGO2	99	98.485	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.884	ENSANAG00000027399	AGO2	100	99.884	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000004132	AGO2	80	94.606	ENSACLG00000024684	ago2	98	94.606	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.160	ENSAMXG00000014587	ago2	99	92.632	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	100.000	ENSBTAG00000001579	AGO2	100	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	67.431	WBGene00000105	alg-1	87	67.431	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	66.783	WBGene00000106	alg-2	96	66.901	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000004132	AGO2	95	99.877	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	99.877	Canis_familiaris
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.419	ENSCAFG00020014198	AGO2	100	99.419	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	100.000	ENSCHIG00000010156	AGO2	100	100.000	Capra_hircus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.883	ENSTSYG00000007281	AGO2	100	99.878	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	84.400	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	84.460	Cavia_aperea
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	100.000	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	96.516	ENSCATG00000038820	AGO2	100	96.516	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.766	ENSCLAG00000001381	AGO2	100	99.534	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSCSAG00000009574	AGO2	95	99.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000004132	AGO2	82	84.633	ENSCHOG00000008938	-	84	84.633	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.182	ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.182	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	72.353	ENSCING00000007310	-	98	72.353	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	73.113	ENSCSAVG00000005282	-	99	79.104	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	96.131	ENSCANG00000030899	AGO2	99	96.131	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.070	ENSCGRG00001013557	Ago2	100	99.070	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.178	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	99.178	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.445	ENSCSEG00000012273	ago2	97	93.034	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	92.968	ENSCVAG00000008763	ago2	100	92.539	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	92.290	ENSDARG00000061268	ago2	98	91.832	Danio_rerio
ENSCJAG00000004132	AGO2	92	97.595	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	97.595	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	98.485	ENSDORG00000011242	Ago2	99	99.296	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	73.563	FBgn0262739	AGO1	90	74.443	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000004132	AGO2	93	57.263	ENSEBUG00000014681	ago2	99	57.263	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000004132	AGO2	80	86.192	ENSEBUG00000006807	-	100	86.192	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000004132	AGO2	94	86.757	ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000004132	AGO2	81	88.905	ENSEBUG00000014654	ago2	100	88.905	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000004132	AGO2	80	86.172	ENSEBUG00000008202	-	99	86.172	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000004132	AGO2	95	100.000	ENSEASG00005021922	AGO2	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.767	ENSECAG00000006078	AGO2	100	99.767	Equus_caballus
ENSCJAG00000004132	AGO2	74	99.301	ENSEEUG00000008564	-	74	99.301	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	92.857	ENSELUG00000019378	ago2	97	92.453	Esox_lucius
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.767	ENSFCAG00000002782	AGO2	100	99.767	Felis_catus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	98.945	ENSFALG00000002838	AGO2	99	98.945	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSFDAG00000004759	AGO2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000004132	AGO2	94	93.432	ENSFHEG00000016080	ago2	98	92.534	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	92.729	ENSGMOG00000013651	ago2	99	92.326	Gadus_morhua
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	98.264	ENSGALG00000040957	AGO2	100	98.264	Gallus_gallus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.270	ENSGAFG00000018026	ago2	97	93.683	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.262	ENSGACG00000006796	ago2	98	93.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.065	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSGGOG00000011412	AGO2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.617	ENSHBUG00000018515	ago2	99	93.617	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSHGLG00000005548	AGO2	99	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.765	ENSHGLG00100015994	-	99	99.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	88.953	ENSHGLG00100000694	-	99	88.561	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.921	ENSHCOG00000006200	ago2	99	93.617	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	91.860	ENSIPUG00000001018	ago2	99	92.136	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.184	ENSSTOG00000008113	AGO2	100	99.648	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	98.958	ENSJJAG00000018712	Ago2	100	98.958	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	91.977	ENSKMAG00000019999	ago2	99	92.798	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.445	ENSLBEG00000005112	ago2	97	93.144	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	88.249	ENSLACG00000001277	-	99	88.028	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.325	ENSLOCG00000007766	ago2	98	92.916	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.648	ENSLAFG00000012905	AGO2	100	99.179	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSMFAG00000015384	AGO2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSMMUG00000008045	AGO2	99	99.767	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.419	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	99.883	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSMLEG00000038874	AGO2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.499	ENSMAMG00000008662	ago2	99	91.548	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.921	ENSMZEG00005008998	ago2	98	94.606	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	98.944	ENSMGAG00000012942	AGO2	100	98.131	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	90.676	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	91.080	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.767	ENSMICG00000004427	AGO2	100	99.767	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.068	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	99.531	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000004132	AGO2	97	90.822	ENSMMOG00000020165	ago2	100	90.822	Mola_mola
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	98.492	ENSMODG00000000748	AGO2	100	98.492	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.683	ENSMALG00000020610	ago2	98	93.683	Monopterus_albus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.186	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	100	99.186	Mus_caroli
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.186	ENSMUSG00000036698	Ago2	100	99.186	Mus_musculus
ENSCJAG00000004132	AGO2	100	98.953	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	100	98.953	Mus_pahari
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.177	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	100	99.177	Mus_spretus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.765	ENSMPUG00000001930	AGO2	99	99.765	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000004132	AGO2	66	87.456	ENSMLUG00000004552	-	100	87.346	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.645	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	99.645	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000004132	AGO2	98	93.921	ENSNBRG00000006100	ago2	98	92.840	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	94.836	ENSNLEG00000001461	AGO2	98	94.743	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000004132	AGO2	87	88.889	ENSMEUG00000001395	AGO2	86	98.039	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	87.089	ENSOPRG00000008795	-	100	87.089	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	ENSODEG00000014145	AGO2	100	100.000	Octodon_degus
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