EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000004729 (Gene tree)
Gene ID: 100398879
Gene Symbol: CTIF
Alias: KIAA0427
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 250245 bases
Position: chrNTIC01003335.1:85037965-85288209
Accession: 23925
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000008615	MIF4G	PF02854.19	6.4e-28	1	1
ENSCJAP00000051443	MIF4G	PF02854.19	6.5e-28	1	1
ENSCJAP00000008602	MIF4G	PF02854.19	6.8e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000009111	CTIF-203	1806	-	ENSCJAP00000008615	601 (aa)	-	F7IHP3
ENSCJAT00000009098	CTIF-202	1806	-	ENSCJAP00000008602	601 (aa)	-	F7IJX9
ENSCJAT00000062175	CTIF-201	5671	-	ENSCJAP00000051443	601 (aa)	-	F7BJJ4

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000004729's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000004729's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	97.837	ENSG00000134030	CTIF	100	97.938	Homo_sapiens
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	58.442	ENSAPOG00000020192	ctif	99	57.955	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000004729	CTIF	87	95.229	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	95.229	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	52.436	ENSACIG00000017099	ctif	99	53.295	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.857	ENSAOCG00000014275	ctif	99	53.779	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	54.388	ENSAPEG00000016975	ctif	99	56.112	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.752	ENSATEG00000016752	ctif	99	56.112	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	75.387	ENSACAG00000018006	CTIF	100	75.542	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.336	ENSANAG00000024925	CTIF	100	98.336	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.965	ENSACLG00000005956	ctif	99	56.241	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000004729	CTIF	97	58.205	ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.617	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.346	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	92.346	Bos_taurus
ENSCJAG00000004729	CTIF	97	95.043	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	95.008	Canis_familiaris
ENSCJAG00000004729	CTIF	97	94.872	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	94.842	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	91.860	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	91.860	Capra_hircus
ENSCJAG00000004729	CTIF	90	84.104	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	84.104	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	85.548	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	85.173	Cavia_aperea
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	90.375	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	90.375	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	99.168	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	99.168	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.170	ENSCATG00000038134	CTIF	100	98.170	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.688	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	93.688	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.786	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	95.786	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	82.013	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	82.013	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.336	ENSCANG00000030916	CTIF	100	98.336	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	91.514	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	91.514	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	85.346	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	85.346	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000004729	CTIF	60	61.662	ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	52.814	ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.022	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	54.096	ENSDARG00000090617	ctif	100	56.657	Danio_rerio
ENSCJAG00000004729	CTIF	72	92.610	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	92.610	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.346	ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.346	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	94.842	ENSEASG00005016094	CTIF	100	94.842	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.008	ENSECAG00000020473	CTIF	100	95.008	Equus_caballus
ENSCJAG00000004729	CTIF	90	83.734	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	83.734	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	61.624	ENSELUG00000008733	ctif	99	61.120	Esox_lucius
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.175	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	95.175	Felis_catus
ENSCJAG00000004729	CTIF	97	82.192	ENSFALG00000008943	CTIF	100	81.167	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	91.817	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	91.817	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.974	ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.772	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	79.803	ENSGALG00000035912	-	100	79.803	Gallus_gallus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.027	ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.550	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000004729	CTIF	68	78.186	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	77.916	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.170	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	98.170	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.112	ENSHBUG00000018092	ctif	99	56.388	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.511	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	93.511	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.344	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	93.344	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.574	ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.557	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	55.344	ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.455	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.511	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	93.511	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	90.645	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	90.645	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.550	ENSKMAG00000014651	ctif	99	54.586	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	60.621	ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.175	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	62.464	ENSLOCG00000011697	ctif	100	63.504	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	83.520	ENSLAFG00000016335	CTIF	100	98.876	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.502	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	98.502	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.170	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	98.170	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.170	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	98.170	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.669	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	98.669	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.848	ENSMAMG00000014741	ctif	99	56.204	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	88	52.623	ENSMZEG00005019767	ctif	90	52.941	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000004729	CTIF	88	54.917	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	54.917	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.013	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	92.013	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.175	ENSMICG00000010167	CTIF	100	95.175	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.013	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	92.013	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.026	ENSMMOG00000000831	ctif	99	53.690	Mola_mola
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	81.063	ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.063	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000004729	CTIF	84	53.935	ENSMALG00000020553	ctif	99	54.127	Monopterus_albus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	89.389	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	89.389	Mus_caroli
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	89.263	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.263	Mus_musculus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	91.528	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	91.528	Mus_pahari
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	89.103	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	100	89.103	Mus_spretus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.175	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	95.175	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.677	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	93.677	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	94.010	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	94.010	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.259	ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.535	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.003	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	98.003	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	78.571	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	78.571	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	88.353	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	88.353	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	89.550	ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.550	Octodon_degus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	62.197	ENSONIG00000007750	ctif	99	62.359	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000004729	CTIF	85	69.312	ENSOANG00000001337	CTIF	100	69.312	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	90.516	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	90.516	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.488	ENSORLG00000005786	ctif	99	57.600	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.235	ENSORLG00020005385	ctif	99	57.649	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.340	ENSORLG00015011872	ctif	99	56.822	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.857	ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.215	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	94.676	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	94.676	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.679	ENSOARG00000003754	CTIF	100	92.679	Ovis_aries
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	97.837	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	97.837	Pan_paniscus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.008	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	95.008	Panthera_pardus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	94.842	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	94.842	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	97.671	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	97.671	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.669	ENSPANG00000017087	CTIF	100	98.669	Papio_anubis
ENSCJAG00000004729	CTIF	85	63.548	ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.078	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	79.070	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	79.070	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	49.640	ENSPMGG00000022958	ctif	99	49.062	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.525	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	92.525	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000004729	CTIF	76	86.245	ENSPCIG00000026247	CTIF	95	86.245	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	60.948	ENSPFOG00000009243	ctif	99	60.948	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.576	ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.895	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	53.488	ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.651	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	50.494	ENSPREG00000017326	ctif	99	52.676	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000004729	CTIF	85	97.441	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	97.441	Pongo_abelii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.035	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	93.035	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.864	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	93.864	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	59.935	ENSPNYG00000007879	ctif	99	60.586	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	56.313	ENSPNAG00000029174	ctif	100	57.642	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.013	ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.013	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.003	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	98.003	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.003	ENSRROG00000006039	CTIF	100	98.003	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	98.336	ENSSBOG00000028468	CTIF	100	98.336	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	80.565	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	80.565	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	63.056	ENSSFOG00015022594	ctif	100	63.798	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.650	ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.842	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000004729	CTIF	91	64.550	ENSSDUG00000016033	ctif	93	68.750	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000004729	CTIF	60	63.536	ENSSLDG00000007282	ctif	99	56.148	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	81.864	ENSSPUG00000014734	CTIF	100	82.529	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	58.795	ENSSPAG00000003721	ctif	99	58.521	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.511	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.511	Sus_scrofa
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	78.686	ENSTGUG00000000030	CTIF	100	78.686	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	61.047	ENSTNIG00000018763	ctif	99	60.353	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	73.544	ENSTBEG00000002613	CTIF	100	73.544	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	91.348	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	91.348	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000004729	CTIF	85	95.127	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	95.127	Ursus_americanus
ENSCJAG00000004729	CTIF	100	95.674	ENSUMAG00000002735	CTIF	100	95.674	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000004729	CTIF	67	80.519	ENSVPAG00000001497	-	75	80.519	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000004729	CTIF	97	94.872	ENSVVUG00000014347	CTIF	100	94.842	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000004729	CTIF	97	62.735	ENSXETG00000026836	ctif	99	62.500	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000004729	CTIF	63	57.431	ENSXCOG00000002477	ctif	91	55.687	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.535	ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.680	Xiphophorus_maculatus