EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000005096 (Gene tree)
Gene ID: 100397373
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20602 bases
Position: chrNTIC01011113.1:9458027-9478628
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000009518	IBN_N	PF03810.19	8.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000010060	TNPO2-201	2694	-	ENSCJAP00000009518	897 (aa)	-	U3FQU8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000005096	TNPO2	99	84.392	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	84.392

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.889	ENSG00000105576	TNPO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.991	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	91.991	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	81	90.897	ENSAPOG00000013185	-	96	90.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	97.993	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	97.993	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000005096	TNPO2	86	92.477	ENSACIG00000009586	-	99	92.477	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	86	93.256	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	93.256	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.769	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	91.769	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.991	ENSAOCG00000010152	-	100	91.991	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.991	ENSAPEG00000013268	-	100	91.991	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.769	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	91.769	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.657	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	91.657	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.769	ENSATEG00000019171	-	100	91.769	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	95.546	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	95.546	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	98.774	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	91.880	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	85.762	ENSACLG00000020672	-	100	85.873	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.461	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	90.351	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.551	ENSBTAG00000011811	TNPO2	99	99.598	Bos_taurus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	98.774	Canis_familiaris
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.774	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	95.987	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	95.987	Capra_hircus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.662	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.662	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000005096	TNPO2	94	97.974	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	97.974	Cavia_aperea
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.328	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	98.328	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	100.000	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.889	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	99.889	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.331	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.331	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.885	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	98.885	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	95.768	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	95.768	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005096	TNPO2	96	98.843	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	98.843	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.777	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	99.777	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.777	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	99.777	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000005096	TNPO2	86	91.051	ENSCSEG00000011477	-	99	91.180	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	87.778	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	87.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.333	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	90.333	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	91.880	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	88.654	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	88.877	Danio_rerio
ENSCJAG00000005096	TNPO2	88	88.228	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	88.228	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	93.987	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	71.681	FBgn0024921	Tnpo	100	71.571	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000005096	TNPO2	92	91.509	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	91.509	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.551	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	98.551	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.662	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	98.662	Equus_caballus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	79	90.237	ENSELUG00000016542	-	98	83.505	Esox_lucius
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.328	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	91.328	Esox_lucius
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.666	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	99.666	Felis_catus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.443	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	99.443	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.556	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	90.556	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	97	91.379	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	91.379	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	84.727	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	84.727	Gadus_morhua
ENSCJAG00000005096	TNPO2	80	90.741	ENSGMOG00000014237	-	90	90.741	Gadus_morhua
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	91.880	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.889	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	90.889	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	95.880	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	95.880	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSHBUG00000018317	-	100	91.880	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	91.880	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.328	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	98.328	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	98.774	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.545	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	90.323	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSHCOG00000020440	-	100	91.880	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.212	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	91.212	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.546	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	91.546	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.666	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	99.666	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.666	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	99.666	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	89.632	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	89.632	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.769	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	91.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	91.880	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	92.214	ENSLBEG00000005301	-	100	92.214	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.190	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.190	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	93.103	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.443	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.889	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	99.889	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.889	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	99.889	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.889	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	99.889	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000005096	TNPO2	96	99.884	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	99.884	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.121	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	90.121	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.991	ENSMAMG00000011862	-	100	91.991	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	91.880	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	87.667	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSMZEG00005007408	-	100	91.880	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.885	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	98.885	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	98.774	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000005096	TNPO2	86	92.477	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	92.477	Mola_mola
ENSCJAG00000005096	TNPO2	86	87.808	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	87.549	Mola_mola
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	97.775	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	97.775	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	91.880	Monopterus_albus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.323	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	90.656	Monopterus_albus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.554	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	99.554	Mus_caroli
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.554	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	100.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.331	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	99.331	Mus_pahari
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.554	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	99.554	Mus_spretus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.774	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	98.774	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000005096	TNPO2	96	98.611	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	98.611	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.777	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	99.777	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	86.763	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	86.763	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.880	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	91.880	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.524	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	90.524	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.546	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	91.546	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.443	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	99.443	Octodon_degus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	92.214	ENSONIG00000017706	-	100	92.214	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	91.769	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	91.769	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	94.989	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	94.878	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	80.290	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	80.290	Oryctolagus_cuniculus
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ENSCJAG00000005096	TNPO2	56	90.800	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	Oryzias_latipes_hni
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