EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000005387 (Gene tree)
Gene ID: 100412311
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: EFSEC|SELB|eEFSec
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 259641 bases
Position: chrNTIC01006668.1:66068948-66328588
Accession: 24614
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000009869	GTP_EFTU	PF00009.27	1.6e-25	1	1
ENSCJAP00000061053	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-25	1	1
ENSCJAP00000053218	GTP_EFTU	PF00009.27	4.6e-25	1	1
ENSCJAP00000009869	MMR_HSR1	PF01926.23	6e-05	1	1
ENSCJAP00000061053	MMR_HSR1	PF01926.23	6.4e-05	1	1
ENSCJAP00000053218	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00012	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000081162	EEFSEC-203	1341	-	ENSCJAP00000061053	446 (aa)	-	A0A2R8MKC0
ENSCJAT00000077926	EEFSEC-201	3311	-	ENSCJAP00000053218	596 (aa)	-	U3F7I3
ENSCJAT00000010427	EEFSEC-202	1311	-	ENSCJAP00000009869	436 (aa)	-	F7F6L8

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000005387's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000005387's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.560	ENSG00000132394	EEFSEC	100	96.560	Homo_sapiens
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.824	ENSAPOG00000015931	eefsec	98	61.993	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	83	84.105	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	99	84.105	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	65	64.413	ENSACIG00000022407	eefsec	99	64.413	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.486	ENSAOCG00000008603	eefsec	98	61.655	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	98	67.308	ENSAPEG00000017090	eefsec	98	61.157	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.768	ENSATEG00000002753	eefsec	99	60.935	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	72	77.546	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.546	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	98.165	ENSANAG00000032691	EEFSEC	100	98.165	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.488	ENSACLG00000024565	eefsec	98	64.413	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.770	ENSAMXG00000002260	eefsec	97	61.770	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	86.265	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	100	86.268	Bos_taurus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	88	31.963	WBGene00008133	efsc-1	90	31.963	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	91.290	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	81	92.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	91.333	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	100	92.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	85.930	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	100	85.930	Capra_hircus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	92.785	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.785	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	82.857	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	82.857	Cavia_aperea
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.752	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	100	87.752	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	98.624	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	100	98.624	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.560	ENSCATG00000019414	EEFSEC	100	96.560	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.248	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	100	87.248	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	95.805	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	100	95.805	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	72.222	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	86	75.376	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	64.216	ENSCSAVG00000002208	-	100	54.870	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.101	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	96.101	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	85.930	ENSCGRG00001018089	Eefsec	100	85.930	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	85.260	ENSCGRG00000010063	Eefsec	100	85.260	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.328	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	64.769	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.730	ENSCVAG00000005381	eefsec	98	61.897	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.063	ENSDARG00000004696	eefsec	99	62.396	Danio_rerio
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	83.054	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	100	84.060	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	74	83.489	ENSDORG00000000264	Eefsec	99	86.598	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	39.915	FBgn0034627	eEFSec	95	44.030	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	79.027	ENSETEG00000007406	EEFSEC	99	79.027	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	76	62.037	ENSEBUG00000015029	eefsec	96	48.644	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	91.779	ENSEASG00005006786	EEFSEC	100	92.617	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	91.946	ENSECAG00000016565	EEFSEC	100	92.785	Equus_caballus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	59.900	ENSELUG00000016632	eefsec	98	59.635	Esox_lucius
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	91.472	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	100	92.140	Felis_catus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	73.415	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	73.415	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	89.184	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	93.421	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.040	ENSFHEG00000007155	eefsec	98	61.937	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	58.615	ENSGMOG00000007705	eefsec	98	59.428	Gadus_morhua
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	73.649	ENSGALG00000038684	EEFSEC	99	73.649	Gallus_gallus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.371	ENSGAFG00000021692	eefsec	99	61.706	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.919	ENSGACG00000000793	eefsec	99	62.230	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	72.559	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	98	73.064	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	87	96.154	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	100	96.389	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.901	ENSHBUG00000008917	eefsec	97	63.787	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.584	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	100	93.421	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.081	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	96	87.081	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.824	ENSHCOG00000004193	eefsec	99	61.824	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.000	ENSIPUG00000017291	eefsec	97	64.126	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	84.694	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.694	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.204	ENSKMAG00000019907	eefsec	98	61.269	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.870	ENSLBEG00000017908	eefsec	98	61.102	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	85	67.255	ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.255	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	64.202	ENSLOCG00000014535	eefsec	98	64.706	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	84.422	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	100	85.092	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.789	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	100	96.789	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.560	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	100	96.560	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.789	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	100	96.789	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	83	95.354	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	95.354	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.531	ENSMAMG00000023964	eefsec	99	64.875	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	65	64.413	ENSMZEG00005009380	eefsec	98	64.413	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	65	73.469	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	73.469	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	89	86.142	ENSMAUG00000011197	Eefsec	97	86.142	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	85.595	ENSMOCG00000017748	Eefsec	100	85.595	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	65	65.035	ENSMMOG00000021820	eefsec	99	65.035	Mola_mola
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	82.991	ENSMODG00000008034	EEFSEC	91	82.991	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	61.383	ENSMALG00000016211	eefsec	99	63.553	Monopterus_albus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	86.935	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	100	96.053	Mus_caroli
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	86.767	ENSMUSG00000033216	Eefsec	100	96.053	Mus_musculus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	86.767	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	100	96.053	Mus_pahari
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	86.935	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	100	96.053	Mus_spretus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	90.572	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	96	90.572	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	83	88.664	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	100	88.664	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.653	ENSNBRG00000002387	eefsec	98	64.769	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.560	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	100	96.560	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	77.551	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	100	77.551	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	90.588	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	100	90.588	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	86.745	ENSODEG00000002928	EEFSEC	100	86.745	Octodon_degus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	81	60.000	ENSONIG00000019038	eefsec	100	61.089	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	81	75.569	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	75.569	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	90.436	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	100	90.436	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.768	ENSORLG00000001377	eefsec	98	62.898	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.804	ENSORLG00020000729	eefsec	98	66.923	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.768	ENSORLG00015001986	eefsec	98	60.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	59.596	ENSOMEG00000010071	eefsec	88	59.596	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	73	91.264	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	91.264	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	63	86.133	ENSOARG00000004600	EEFSEC	99	86.400	Ovis_aries
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.330	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	100	96.330	Pan_paniscus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	92.282	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	100	92.282	Panthera_pardus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	84	90.157	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	92	90.157	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.477	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	100	96.477	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	96.560	ENSPANG00000017041	EEFSEC	100	96.560	Papio_anubis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.171	ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.430	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	89	75.849	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	97	75.849	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.307	ENSPMGG00000020300	eefsec	99	61.371	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	85.762	ENSPEMG00000013677	Eefsec	100	85.762	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	91	63.985	ENSPMAG00000006779	eefsec	99	64.351	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	81	78.351	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	100	78.763	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.873	ENSPFOG00000003748	eefsec	98	61.977	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.873	ENSPLAG00000018012	eefsec	99	61.809	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.371	ENSPMEG00000001202	eefsec	99	61.474	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	98	67.788	ENSPREG00000012235	eefsec	99	61.204	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	95.805	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	100	95.805	Pongo_abelii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	71.663	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.174	Procavia_capensis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	83.725	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	100	83.725	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	65	93.511	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	65	93.511	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.653	ENSPNYG00000005726	eefsec	98	64.413	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.296	ENSPNAG00000016724	eefsec	99	61.462	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.437	ENSRNOG00000012954	Eefsec	100	87.437	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	97.248	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	100	97.248	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	50	87.558	ENSRROG00000030260	-	86	90.370	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	99.054	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	100	99.054	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	81	78.557	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	100	78.557	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.267	ENSSFOG00015021109	eefsec	98	62.267	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.992	ENSSMAG00000001454	eefsec	99	61.221	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.596	ENSSDUG00000007924	eefsec	99	65.201	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	59.966	ENSSLDG00000024985	eefsec	98	60.034	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	51	85.135	ENSSARG00000003789	-	56	85.135	Sorex_araneus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	81	71.429	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	72.464	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	60.596	ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.057	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.813	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	100	90.517	Sus_scrofa
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	73.613	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	100	73.613	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.398	ENSTRUG00000010327	eefsec	98	61.462	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.526	ENSTNIG00000003225	eefsec	99	61.526	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	87.270	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	100	87.270	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	92.114	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	100	92.114	Ursus_americanus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	72	92.593	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	91	92.593	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	98	63.975	ENSXETG00000002066	eefsec	99	72.973	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.371	ENSXCOG00000019916	eefsec	99	61.706	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	61.371	ENSXMAG00000001839	eefsec	99	61.706	Xiphophorus_maculatus