EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000005398 (Gene tree)
Gene ID: 100394516
Gene Symbol: APOBEC1
Alias: APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3564 bases
Position: chrNTIC01000002.1:109108905-109112468
Accession: 604
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000009868	APOBEC_N	PF08210.11	1.9e-27	1	1
ENSCJAP00000009868	APOBEC_C	PF05240.14	1.6e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000010426	APOBEC1-201	666	-	ENSCJAP00000009868	221 (aa)	-	F7F6M6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	87.330	ENSG00000111701	APOBEC1	94	87.330	Homo_sapiens
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	77.828	ENSAMEG00000007098	APOBEC1	94	77.828	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	77	39.766	ENSACAG00000028578	-	93	39.766	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	92.308	ENSANAG00000027743	APOBEC1	89	92.308	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	73.756	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	94	73.756	Bos_taurus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	77.828	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	94	77.828	Canis_familiaris
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	78.281	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	92	78.281	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	74.208	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	92	74.208	Capra_hircus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	60	79.545	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	94	79.545	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	68.692	ENSCAPG00000015882	-	99	68.692	Cavia_aperea
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	66.818	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	93	66.818	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	95.023	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	94	95.023	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	89.593	ENSCATG00000021613	APOBEC1	89	89.593	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	69.159	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	93	69.159	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	86	90.052	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	100	90.052	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	77	47.674	ENSCPBG00000014331	-	71	47.674	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	77	49.419	ENSCPBG00000014335	-	70	49.419	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	75	49.112	ENSCPBG00000017398	-	74	49.112	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	86	46.875	ENSCPBG00000014327	-	72	46.875	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	86	47.917	ENSCPBG00000014328	-	84	47.917	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	47.273	ENSCPBG00000014329	-	60	47.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	90.950	ENSCANG00000038359	APOBEC1	96	90.950	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	70.093	ENSCGRG00001011130	Apobec1	93	70.093	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	70.093	ENSCGRG00000008644	Apobec1	93	70.093	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	77.376	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	94	77.376	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	96	63.551	ENSDORG00000023717	Apobec1	100	63.551	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	76.818	ENSETEG00000004867	APOBEC1	93	76.818	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	81.900	ENSEASG00005015951	APOBEC1	93	81.900	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	86	83.246	ENSECAG00000017163	APOBEC1	100	83.246	Equus_caballus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	92	54.902	ENSEEUG00000007530	-	97	54.902	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	65.000	ENSEEUG00000009112	-	98	65.000	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	80.543	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	94	80.543	Felis_catus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	64	47.552	ENSFALG00000007257	-	70	47.552	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	94	58.454	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	99	58.454	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	72	53.086	ENSGAGG00000004947	-	85	51.701	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	77	44.318	ENSGAGG00000021745	-	64	44.318	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	77	48.538	ENSGAGG00000006624	-	62	48.538	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	91	48.039	ENSGAGG00000011837	-	86	54.167	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	89	42.640	ENSGAGG00000021744	-	77	42.640	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	64.091	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	93	64.091	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	64.091	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	93	64.091	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	65.116	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	100	78.571	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	75.234	ENSJJAG00000022108	Apobec1	93	75.234	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	76.018	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	99	76.018	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	90.045	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	100	91.099	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	89.593	ENSMNEG00000029670	APOBEC1	94	89.593	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	89.593	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	94	89.593	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	70.561	ENSMAUG00000022167	Apobec1	96	70.561	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	80.090	ENSMICG00000043645	APOBEC1	96	80.090	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	68.326	ENSMODG00000018004	APOBEC1	94	68.326	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	96	69.014	ENSMUSG00000040613	Apobec1	93	69.014	Mus_musculus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	96	67.606	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	93	67.606	Mus_pahari
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	96	69.014	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	93	69.014	Mus_spretus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	73.756	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	94	73.756	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	71.028	ENSNGAG00000022607	Apobec1	93	71.028	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	87.783	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	94	87.783	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	66.063	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	94	66.063	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	78	62.209	ENSOPRG00000009508	-	95	62.209	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	76.018	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	83	76.018	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	78.281	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	94	78.281	Otolemur_garnettii
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ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	80.543	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	93	80.543	Pan_paniscus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	80.090	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	94	80.090	Panthera_pardus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	80.090	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	94	80.090	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	87.783	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	94	87.783	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	90.045	ENSPANG00000021027	APOBEC1	94	90.045	Papio_anubis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	61	48.624	ENSPSIG00000012791	-	75	48.624	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	99	43.723	ENSPSIG00000012568	-	93	43.723	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	97	69.159	ENSPEMG00000023841	Apobec1	93	69.159	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	69.683	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	94	69.683	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	86.878	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	89	86.878	Pongo_abelii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	78	79.070	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	92	79.070	Procavia_capensis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	80.543	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	98	80.543	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	62.896	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	94	62.896	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	96	67.606	ENSRNOG00000015411	Apobec1	93	67.606	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	90.498	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	94	90.498	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	90.045	ENSRROG00000033576	APOBEC1	100	91.099	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	78	95.349	ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	95.349	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	70.136	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	97	70.136	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	58	70.543	ENSSARG00000011972	-	98	70.543	Sorex_araneus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	78	67.442	ENSSARG00000000032	-	100	67.442	Sorex_araneus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	91	41.463	ENSSPUG00000009044	-	78	41.463	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	79.186	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	94	79.186	Sus_scrofa
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	65	48.966	ENSTGUG00000013118	-	99	48.966	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	73.303	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	94	73.303	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	78	77.326	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	92	77.326	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	77.376	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	91	77.376	Ursus_americanus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	77.376	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	91	77.376	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	76.471	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	94	76.471	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	78.733	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	94	78.733	Vulpes_vulpes