EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000006014 (Gene tree)
Gene ID: 100412998
Gene Symbol: XPO6
Alias: FLJ22519|KIAA0370|RANBP20
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 119436 bases
Position: chrNTIC01004446.1:21723408-21842843
Accession: 100412998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000011196	Xpo1	PF08389.12	4.8e-24	1	1
ENSCJAP00000011196	IBN_N	PF03810.19	2.6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000011816	XPO6-201	4838	XM_017978826	ENSCJAP00000011196	1125 (aa)	XP_017834315	F7HX34

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	76.389	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	98.577	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	98.577	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	76.596	ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.867	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	77.867	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.778	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	77.778	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	77.305	ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.522	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	94.039	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	94.039	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	80.402	ENSACAG00000016883	XPO6	100	80.402	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.556	ENSANAG00000031761	XPO6	100	99.556	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.273	ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.273	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	72.450	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.450	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.133	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	98.133	Bos_taurus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	99.110	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	99.110	Canis_familiaris
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.200	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	99.334	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.956	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	97.956	Capra_hircus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	94.291	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	94.291	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.222	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	98.222	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.467	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	99.467	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSCATG00000034030	XPO6	100	99.378	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	97.687	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.687	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000006014	XPO6	91	97.714	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	97.714	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000006014	XPO6	89	92.786	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	97.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	47.203	ENSCING00000006884	-	100	47.203	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	45.883	ENSCSAVG00000000850	-	99	45.883	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.200	ENSCANG00000041578	XPO6	100	99.200	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.333	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	97.333	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	76.465	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	76.465	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	76.439	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.439	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000006014	XPO6	97	71.724	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.724	Danio_rerio
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.311	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	98.311	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.511	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	97.511	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000006014	XPO6	82	94.595	ENSETEG00000018768	XPO6	85	94.595	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	61.504	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	61.559	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.667	ENSEASG00005017296	XPO6	100	98.667	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.756	ENSECAG00000008601	XPO6	100	98.756	Equus_caballus
ENSCJAG00000006014	XPO6	97	91.292	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	91.292	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	78.497	ENSELUG00000009159	xpo6	100	78.497	Esox_lucius
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.578	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	98.578	Felis_catus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	91.873	ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	97.776	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	97.776	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	76.241	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	76.241	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	93.689	ENSGALG00000035360	XPO6	100	93.689	Gallus_gallus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	74.826	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.826	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000006014	XPO6	95	93.715	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	93.715	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.289	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	99.289	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.694	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	75.955	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000006014	XPO6	94	79.968	ENSHGLG00000003865	-	99	79.968	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.689	ENSHGLG00000009679	-	100	97.689	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.600	ENSHGLG00100003673	-	99	97.600	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000006014	XPO6	94	83.281	ENSHGLG00100001081	-	99	83.281	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.348	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	75.348	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	72.091	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	72.115	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.400	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	98.400	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.156	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	97.156	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	76.313	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	76.999	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	76.999	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	86.044	ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000006014	XPO6	94	81.419	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	Lepisosteus_oculatus
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ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	99.378	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	99.378	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	99.378	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	76.042	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.670	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.362	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	77.362	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000006014	XPO6	97	93.072	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	93.072	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	86.898	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	86.631	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	98.933	ENSMICG00000001923	XPO6	100	98.933	Microcebus_murinus
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ENSCJAG00000006014	XPO6	100	95.200	ENSMODG00000015516	XPO6	100	95.200	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	71.036	ENSMALG00000020612	xpo6	99	71.213	Monopterus_albus
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ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.956	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.956	Mus_pahari
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.600	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	97.600	Mus_spretus
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ENSCJAG00000006014	XPO6	99	97.153	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	97.153	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	98.310	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	98.310	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.694	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	75.955	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	99.378	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000006014	XPO6	87	97.158	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	97.158	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.333	ENSODEG00000012917	XPO6	100	97.333	Octodon_degus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.521	ENSONIG00000019366	xpo6	100	75.781	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	98.310	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	98.310	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.244	ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.244	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	77.094	ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.094	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.333	ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	75.478	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	75.478	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000006014	XPO6	99	99.021	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	99.021	Otolemur_garnettii
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ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.289	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	99.289	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	99.378	ENSPANG00000017103	XPO6	100	99.378	Papio_anubis
ENSCJAG00000006014	XPO6	100	80.178	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	Paramormyrops_kingsleyae
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