EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000006550 (Gene tree)
Gene ID: 100385836
Gene Symbol: TYW3
Alias: C1orf171|FLJ40918
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26004 bases
Position: chrNTIC01036611.1:46380395-46406398
Accession: 100385836
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000059276	TYW3	PF02676.14	1.7e-55	1	1
ENSCJAP00000012107	TYW3	PF02676.14	3.3e-41	1	2
ENSCJAP00000012107	TYW3	PF02676.14	3.3e-41	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000012768	TYW3-202	678	-	ENSCJAP00000012107	225 (aa)	-	F7EJI6
ENSCJAT00000066414	TYW3-201	3751	-	ENSCJAP00000059276	258 (aa)	XP_002751016	U3FUS8

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000006550's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000006550's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	91.120	ENSG00000162623	TYW3	100	96.429	Homo_sapiens
ENSCJAG00000006550	TYW3	88	54.733	ENSAPOG00000009462	tyw3	91	54.733	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	83.077	ENSAMEG00000003461	TYW3	100	83.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000006550	TYW3	72	62.567	ENSACIG00000002242	tyw3	97	52.245	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000006550	TYW3	87	52.479	ENSAOCG00000002161	tyw3	91	52.479	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000006550	TYW3	77	45.370	ENSAPEG00000009395	tyw3	90	60.440	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	55.605	ENSATEG00000004411	-	90	55.605	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	55.605	ENSATEG00000004518	tyw3	90	55.605	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000006550	TYW3	98	53.558	ENSACAG00000011380	TYW3	99	53.558	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	96.139	ENSANAG00000034485	TYW3	100	96.139	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	54.464	ENSACLG00000022833	tyw3	88	54.464	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000006550	TYW3	75	64.767	ENSAMXG00000039965	tyw3	97	55.378	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	78.378	ENSBTAG00000005196	TYW3	100	78.378	Bos_taurus
ENSCJAG00000006550	TYW3	83	84.259	ENSCAFG00000032209	TYW3	100	84.259	Canis_familiaris
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	83.012	ENSCAFG00020017095	TYW3	92	83.012	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	79.615	ENSCHIG00000009333	TYW3	100	79.615	Capra_hircus
ENSCJAG00000006550	TYW3	97	78.571	ENSTSYG00000006369	TYW3	99	78.571	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	96.525	ENSCCAG00000034210	TYW3	100	96.525	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	93.411	ENSCATG00000044397	TYW3	100	93.411	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	81.081	ENSCLAG00000004370	TYW3	95	81.081	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	93.411	ENSCSAG00000001387	TYW3	100	93.411	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000006550	TYW3	73	89.831	ENSCHOG00000005179	TYW3	73	89.831	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000006550	TYW3	97	61.569	ENSCPBG00000017047	TYW3	99	61.569	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	92.636	ENSCANG00000036108	TYW3	100	92.636	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	68.872	ENSCGRG00001022820	Tyw3	100	72.917	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000006550	TYW3	75	69.430	ENSCGRG00000003132	Tyw3	93	77.500	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000006550	TYW3	89	53.689	ENSCSEG00000021219	tyw3	88	53.659	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000006550	TYW3	88	53.540	ENSCVAG00000003270	tyw3	91	53.540	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	54.065	ENSDARG00000038222	tyw3	96	54.065	Danio_rerio
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	82.946	ENSDNOG00000033863	TYW3	100	82.946	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000006550	TYW3	61	77.143	ENSDORG00000002718	-	100	77.143	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000006550	TYW3	77	78.283	ENSETEG00000012572	TYW3	99	78.283	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000006550	TYW3	54	52.143	ENSEBUG00000014020	tyw3	56	52.143	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	84.291	ENSEASG00005007776	TYW3	100	84.291	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	84.674	ENSECAG00000007888	TYW3	100	84.674	Equus_caballus
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	69.020	ENSEEUG00000009289	TYW3	99	69.020	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	55.200	ENSELUG00000023000	tyw3	98	55.200	Esox_lucius
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	85.385	ENSFCAG00000035340	TYW3	100	85.385	Felis_catus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	79.151	ENSFDAG00000003816	TYW3	100	79.151	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000006550	TYW3	83	57.604	ENSFHEG00000001347	tyw3	86	57.604	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000006550	TYW3	97	50.775	ENSGALG00000032549	TYW3	98	50.775	Gallus_gallus
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	55.157	ENSGAFG00000012457	tyw3	83	55.157	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000006550	TYW3	85	54.709	ENSGACG00000014630	tyw3	98	54.709	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	90.347	ENSGGOG00000013676	TYW3	100	92.278	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	81.081	ENSHGLG00000004440	TYW3	100	81.081	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	77.220	ENSHGLG00100018315	TYW3	100	77.220	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000006550	TYW3	74	55.263	ENSHCOG00000016590	TYW3	92	55.263	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000006550	TYW3	75	65.803	ENSIPUG00000012907	tyw3	78	57.328	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	75.290	ENSSTOG00000028816	TYW3	95	75.290	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	56	77.778	ENSJJAG00000005103	-	100	77.778	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000006550	TYW3	78	61.500	ENSKMAG00000020761	tyw3	72	61.500	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000006550	TYW3	85	54.338	ENSLBEG00000021318	tyw3	88	55.251	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	55.426	ENSLACG00000012636	TYW3	100	55.426	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000006550	TYW3	88	58.333	ENSLOCG00000003437	tyw3	89	58.333	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	82.946	ENSLAFG00000011373	TYW3	100	82.946	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	92.889	ENSMFAG00000003496	TYW3	100	92.889	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	92.889	ENSMMUG00000014595	TYW3	100	92.889	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	92.444	ENSMNEG00000028346	TYW3	100	92.444	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	93.023	ENSMLEG00000041647	TYW3	100	93.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	52.124	ENSMAMG00000010987	tyw3	98	52.124	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	76	62.051	ENSMZEG00005023808	tyw3	82	56.818	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	59.375	ENSMAUG00000000522	Tyw3	100	65.517	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	86.100	ENSMICG00000015883	TYW3	100	84.513	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000006550	TYW3	83	71.223	ENSMOCG00000021348	Tyw3	99	71.223	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	56.696	ENSMMOG00000021442	tyw3	89	56.696	Mola_mola
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	67.829	ENSMODG00000019082	TYW3	93	67.829	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	50.769	ENSMALG00000014442	tyw3	97	50.769	Monopterus_albus
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	72.374	MGP_CAROLIEiJ_G0025755	Tyw3	100	77.778	Mus_caroli
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	71.984	ENSMUSG00000047583	Tyw3	100	77.778	Mus_musculus
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	71.595	MGP_PahariEiJ_G0027206	Tyw3	100	77.083	Mus_pahari
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	72.374	MGP_SPRETEiJ_G0026708	Tyw3	100	77.083	Mus_spretus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	83.846	ENSMPUG00000010967	TYW3	100	83.846	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	83.784	ENSMLUG00000005999	TYW3	100	83.784	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000006550	TYW3	56	81.379	ENSNGAG00000000586	-	100	81.379	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	93.798	ENSNLEG00000009556	TYW3	100	93.798	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	62.934	ENSOPRG00000014182	TYW3	100	62.934	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	79.151	ENSODEG00000005361	TYW3	100	83.448	Octodon_degus
ENSCJAG00000006550	TYW3	75	62.176	ENSONIG00000019965	tyw3	98	62.176	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000006550	TYW3	76	61.224	ENSOANG00000002172	-	98	61.224	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	79.923	ENSOCUG00000003043	TYW3	100	79.923	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000006550	TYW3	84	55.505	ENSORLG00000004470	tyw3	84	55.505	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000006550	TYW3	84	55.046	ENSORLG00020003793	tyw3	91	52.381	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000006550	TYW3	84	54.587	ENSORLG00015006950	tyw3	84	54.587	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	53.509	ENSOMEG00000016176	tyw3	89	53.509	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	75.969	ENSOGAG00000025029	-	99	75.969	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	81.783	ENSOGAG00000011590	-	99	81.783	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	79.537	ENSOARG00000012508	TYW3	99	79.537	Ovis_aries
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	90.734	ENSPPAG00000043438	TYW3	100	92.664	Pan_paniscus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	86.047	ENSPPRG00000023209	TYW3	100	86.047	Panthera_pardus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	85.000	ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.000	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	90.734	ENSPTRG00000000867	TYW3	100	92.664	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	93.411	ENSPANG00000013397	TYW3	100	93.411	Papio_anubis
ENSCJAG00000006550	TYW3	85	50.820	ENSPKIG00000009802	tyw3	88	50.820	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000006550	TYW3	62	63.975	ENSPSIG00000008432	TYW3	95	63.975	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000006550	TYW3	87	51.786	ENSPMGG00000005290	tyw3	79	55.191	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	70.817	ENSPEMG00000013100	Tyw3	100	76.389	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	73.878	ENSPCIG00000024204	TYW3	81	73.878	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	57.143	ENSPFOG00000000927	tyw3	83	57.143	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	57.143	ENSPLAG00000009891	tyw3	83	57.143	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	57.143	ENSPMEG00000002006	tyw3	83	57.143	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	56.696	ENSPREG00000012341	tyw3	83	56.696	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	94.208	ENSPPYG00000001234	TYW3	100	94.208	Pongo_abelii
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	82.171	ENSPCAG00000000524	TYW3	100	82.171	Procavia_capensis
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	86.873	ENSPCOG00000023207	TYW3	97	86.873	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	78.295	ENSPVAG00000002356	TYW3	100	79.070	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000006550	TYW3	70	62.703	ENSPNYG00000017982	tyw3	59	62.703	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000006550	TYW3	97	55.422	ENSPNAG00000028431	tyw3	98	55.422	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	71.984	ENSRNOG00000028328	Tyw3	88	71.984	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000006550	TYW3	61	92.029	ENSRBIG00000040137	-	100	92.029	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	93.023	ENSRROG00000034171	TYW3	100	93.023	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	95.736	ENSSBOG00000022917	TYW3	100	95.736	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000006550	TYW3	96	55.020	ENSSFOG00015021842	tyw3	97	55.020	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000006550	TYW3	77	62.121	ENSSMAG00000019609	tyw3	93	51.751	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000006550	TYW3	93	52.344	ENSSDUG00000003674	tyw3	96	52.344	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000006550	TYW3	93	52.344	ENSSLDG00000010425	tyw3	96	52.344	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000006550	TYW3	78	76.617	ENSSARG00000001097	TYW3	100	76.617	Sorex_araneus
ENSCJAG00000006550	TYW3	98	55.814	ENSSPUG00000007880	TYW3	99	56.538	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	77	60.302	ENSSPAG00000013786	tyw3	91	51.793	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	81.298	ENSSSCG00000003779	TYW3	100	81.298	Sus_scrofa
ENSCJAG00000006550	TYW3	86	55.602	ENSTRUG00000023563	tyw3	89	55.602	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000006550	TYW3	74	59.686	ENSTNIG00000003368	tyw3	97	59.686	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	83.784	ENSTBEG00000017002	TYW3	100	83.784	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000006550	TYW3	100	83.969	ENSTTRG00000010464	TYW3	100	83.969	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	84.615	ENSUAMG00000010803	TYW3	98	84.615	Ursus_americanus
ENSCJAG00000006550	TYW3	95	84.615	ENSUMAG00000006460	TYW3	96	84.615	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000006550	TYW3	72	90.860	ENSVPAG00000006900	TYW3	100	90.860	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000006550	TYW3	99	83.784	ENSVVUG00000006902	TYW3	92	83.784	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000006550	TYW3	84	56.481	ENSXETG00000002996	tyw3	94	53.617	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000006550	TYW3	88	51.982	ENSXCOG00000000715	tyw3	84	51.982	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000006550	TYW3	88	52.838	ENSXMAG00000006464	tyw3	76	61.376	Xiphophorus_maculatus