EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000008012 (Gene tree)
Gene ID: 100385395
Gene Symbol: PTRHD1
Alias: C2orf79|LOC391356
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2277 bases
Position: chrNTIC01005557.1:83576860-83579136
Accession: 100385395
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000014802	PTH2	PF01981.16	4.7e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000015618	PTRHD1-201	423	-	ENSCJAP00000014802	140 (aa)	XP_002758035	F7IBH2

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000008012's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000008012's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.857	ENSG00000184924	PTRHD1	100	97.857	Homo_sapiens
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	57.480	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.714	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	57.480	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	57.480	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	57.480	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	59.055	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	59.055	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	98.571	ENSANAG00000019089	PTRHD1	100	98.571	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	58.268	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	58.268	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	89	58.065	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	86.429	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	100	86.429	Bos_taurus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	81	45.614	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	46.774	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	90.714	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	100	90.714	Canis_familiaris
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.714	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	100	85.714	Capra_hircus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	92.143	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	100	92.143	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.000	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	100	85.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	98.571	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	100	98.571	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.143	ENSCATG00000033690	PTRHD1	100	97.143	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	88.571	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	97	88.571	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.857	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	100	97.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	77.344	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	100	72.662	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	65.625	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	91	65.625	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	51.724	ENSCING00000019647	-	97	51.724	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	96.429	ENSCANG00000034444	PTRHD1	100	96.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	66	87.143	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	100	87.143	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	58.594	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	58.594	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	57.480	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	57.480	Danio_rerio
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	93	87.143	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	95	90.226	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	99	87.681	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	51.724	FBgn0038446	CG14903	97	51.724	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	60	82.143	ENSETEG00000001615	-	100	82.143	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	92	65.116	ENSETEG00000009379	-	96	65.116	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	59.483	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	98	60.584	ENSEASG00005001302	-	98	57.664	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	62.143	ENSECAG00000005314	-	93	60.000	Equus_caballus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	90.000	ENSECAG00000017730	PTRHD1	100	90.000	Equus_caballus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	82.143	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	100	82.143	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	56.693	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	56.693	Esox_lucius
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	89.286	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	100	89.286	Felis_catus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	100	87.143	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	57.480	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	62.069	ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	60.000	Gallus_gallus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	57.480	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	89	55.556	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	55.556	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	67.717	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	67.717	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	97.619	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	97.619	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	58.268	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	58.268	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.000	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	100	85.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	86.614	ENSHGLG00100004341	-	93	86.614	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.000	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	100	85.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.031	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	57.031	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	55.172	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	55.172	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	90.000	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	100	90.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	92	92.248	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	100	87.857	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	81	55.752	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	55.752	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	57.480	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	82	59.483	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	57.480	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	89	57.258	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	96	57.258	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	100	87.143	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	96.429	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	100	96.429	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	96.429	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	100	96.429	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	96.429	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	100	96.429	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	95.000	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	100	95.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	55.118	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	55.118	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	58.268	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	58.268	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	97	87.500	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	97	87.500	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	93.571	ENSMICG00000001578	PTRHD1	100	93.571	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	87.143	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	56.693	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	56.693	Mola_mola
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	95	72.932	ENSMODG00000015895	PTRHD1	95	72.932	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	55.118	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	55.118	Monopterus_albus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	100	87.143	Mus_caroli
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	Mus_musculus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	100	87.143	Mus_spretus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	100	87.143	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.000	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	100	85.000	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	86.429	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	100	86.429	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	58.268	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	58.268	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	96.429	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	96.429	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	54	73.684	ENSMEUG00000010482	-	92	73.684	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.000	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	100	85.000	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	88.571	ENSODEG00000007805	PTRHD1	97	88.571	Octodon_degus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	96	57.037	ENSONIG00000015722	ptrhd1	99	57.037	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	83.571	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	100	83.571	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	55.556	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	55.556	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	56.410	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	55.556	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	55.469	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	55.469	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.000	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	100	85.000	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	86.429	ENSOARG00000018052	PTRHD1	100	86.429	Ovis_aries
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.857	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	100	97.857	Pan_paniscus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	89.286	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	100	89.286	Panthera_pardus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	89.286	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	100	89.286	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.857	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	100	97.857	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.143	ENSPANG00000006781	PTRHD1	100	97.143	Papio_anubis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	98	54.015	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	92	54.015	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	59.483	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	59.055	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	75	58.095	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	57.759	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	73.810	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	100	73.810	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	57.812	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	90	57.812	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	57.480	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	57.480	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	57.480	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	95.000	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	100	95.000	Pongo_abelii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	84.286	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	100	84.286	Procavia_capensis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	92.857	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	100	92.857	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	100	87.143	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	58.268	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	58.268	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	89	56.452	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	97	56.452	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	85.714	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	100	85.714	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.143	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	100	97.143	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	97.143	ENSRROG00000029627	PTRHD1	100	97.143	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	98.571	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	100	98.571	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	69.286	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	89	70.073	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	56.034	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	56.897	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	56.250	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	58.594	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	58.594	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	59.055	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	59.055	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	84	71.795	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	69.291	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	57.480	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	92	63.566	ENSSSCG00000040441	-	93	65.323	Sus_scrofa
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	87	57.377	ENSTGUG00000015169	-	89	57.377	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	55.118	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	55.118	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	77.857	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	100	77.857	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	100	87.143	Ursus_americanus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	100	87.143	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	61.719	ENSXETG00000021176	ptrhd1	99	61.871	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	57.480	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	57.480	Xiphophorus_maculatus