EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000008877 (Gene tree)
Gene ID: 100410392
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 55993 bases
Position: chrNTIC01005557.1:46407496-46463488
Accession: 100410392
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000016374	CRM1_C	PF08767.11	1.3e-133	1	1
ENSCJAP00000016374	Xpo1	PF08389.12	9.2e-42	1	1
ENSCJAP00000016374	IBN_N	PF03810.19	3.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000017319	XPO1-201	3216	-	ENSCJAP00000016374	1071 (aa)	XP_002757768	F7A6J3

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
cjc03013	RNA transport	KEGG
cjc05164	Influenza A	KEGG
cjc05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	100.000	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.612	ENSAPOG00000004984	-	100	95.612	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	89.681	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.681	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.787	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.787	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	92.128	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	95.851	ENSACIG00000010818	-	100	95.851	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.612	ENSAOCG00000010121	-	100	95.612	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	91.410	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.410	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000008877	XPO1	91	91.864	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.864	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.612	ENSAPEG00000007038	-	100	95.612	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.612	ENSATEG00000008816	-	100	95.612	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	91.036	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.036	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.599	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.413	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.413	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	100.000	ENSANAG00000020802	XPO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.425	ENSACLG00000015192	-	100	95.425	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	92.234	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.234	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	93.326	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.326	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.892	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.892	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.880	Bos_taurus
ENSCJAG00000008877	XPO1	99	51.479	WBGene00002078	xpo-1	99	51.479	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.880	Canis_familiaris
ENSCJAG00000008877	XPO1	93	98.695	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.695	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.880	Capra_hircus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.880	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000008877	XPO1	53	93.972	ENSCAPG00000006454	-	100	93.972	Cavia_aperea
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.386	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.386	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	80.519	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.138	ENSCATG00000032674	XPO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	100.000	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000008877	XPO1	83	99.481	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.506	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	80.819	ENSCING00000024562	-	100	80.819	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000008877	XPO1	99	79.832	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.832	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.705	ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.666	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.666	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	97.666	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	94.681	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.663	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.663	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.518	ENSCVAG00000016788	-	100	95.518	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	92.717	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	94.892	Danio_rerio
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	96.265	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.265	Danio_rerio
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.786	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.786	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000008877	XPO1	92	95.857	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000008877	XPO1	99	70.853	FBgn0020497	emb	99	70.853	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000008877	XPO1	94	97.970	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.970	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000008877	XPO1	90	79.046	ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.880	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	Equus_caballus
ENSCJAG00000008877	XPO1	92	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000008877	XPO1	87	92.184	ENSELUG00000014306	-	99	92.184	Esox_lucius
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	94.362	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.362	Esox_lucius
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.880	Felis_catus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.319	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.012	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.012	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.943	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.943	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	92.157	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.157	Gadus_morhua
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	89.636	ENSGMOG00000019063	-	100	89.636	Gadus_morhua
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	Gallus_gallus
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	91.915	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000008877	XPO1	91	95.572	ENSGAFG00000003355	-	98	95.572	Gambusia_affinis
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ENSCJAG00000008877	XPO1	100	91.503	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.503	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.506	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.506	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.506	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.506	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	94.681	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	94.681	Hippocampus_comes
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ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.892	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.892	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.599	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.850	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.850	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.145	ENSKMAG00000016218	-	100	95.145	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.612	ENSLBEG00000005740	-	100	95.612	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000008877	XPO1	88	89.301	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.301	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	76.916	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.916	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	96.359	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.359	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.506	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.506	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	100.000	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	100.000	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	100.000	Macaca_mulatta
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ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.140	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	98.140	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000008877	XPO1	100	91.317	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.317	Mastacembelus_armatus
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ENSCJAG00000008877	XPO1	68	98.072	ENSMGAG00000001496	-	100	98.072	Meleagris_gallopavo
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ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.946	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	97.946	Microtus_ochrogaster
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ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.572	ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	Monodelphis_domestica
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ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.786	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	98.786	Nannospalax_galili
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