EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000009102 (Gene tree)
Gene ID: 100413972
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42240 bases
Position: chrNTIC01005557.1:47150868-47193107
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000016886	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	1	2
ENSCJAP00000016886	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000017855	PAPOLG-201	2211	-	ENSCJAP00000016886	736 (aa)	-	U3F541

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000009102's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000009102's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	60.431	ENSCJAG00000006512	PAPOLA	98	73.529

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.370	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.594	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.963	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	94.715	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.715	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.335	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.783	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.460	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.727	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.594	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.861	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.959	ENSATEG00000009007	papolg	80	86.282	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	98	74.224	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.067	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	80	64.909	ENSACAG00000015048	-	100	64.909	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	99.457	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	99.457	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.401	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.052	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.848	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.848	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.872	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.872	Bos_taurus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.531	Canis_familiaris
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.511	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.511	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.737	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	Capra_hircus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.626	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.626	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	52	91.601	ENSCAPG00000014901	-	100	91.601	Cavia_aperea
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.816	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	99.592	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	99.592	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	90	99.134	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	99.134	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.505	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	98.505	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	89	93.778	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.778	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	68	64.683	ENSCING00000024664	-	94	64.683	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	66	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.641	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	98.641	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	93.452	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.452	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	93.452	ENSCGRG00000005552	-	100	93.452	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.652	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.889	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	78	80.035	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	73.545	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.545	Danio_rerio
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.332	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	94.332	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	99.068	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	74.390	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	74.324	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	61	71.503	ENSEBUG00000004020	papolg	91	71.503	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	64	57.325	ENSEBUG00000005042	-	80	57.325	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.682	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	95.682	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.547	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.122	Equus_caballus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	83.941	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.631	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.551	Esox_lucius
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.737	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.737	Felis_catus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	65.027	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.027	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	95.142	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	66	62.282	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.458	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	87	83.729	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.729	Gadus_morhua
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.573	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.306	Gallus_gallus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.120	ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.868	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.904	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.641	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	98.641	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.401	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.182	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	94.986	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.986	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.412	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.989	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.390	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.859	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.861	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.086	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	98.834	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	98.834	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.028	ENSKMAG00000016439	papolg	97	69.385	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.246	ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.246	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	70.895	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.895	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.906	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.906	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.347	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.505	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	98.505	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.505	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	98.505	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	89.744	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	89.744	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.370	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	98.370	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.460	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.081	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.401	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.862	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.777	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.509	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	93.315	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.315	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.196	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	96.196	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	93.649	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.649	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.733	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.267	Mola_mola
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	86.997	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.997	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.594	ENSMALG00000007012	papolg	89	72.594	Monopterus_albus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.197	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.299	Mus_caroli
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.197	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	Mus_musculus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.062	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	Mus_pahari
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.062	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	Mus_spretus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.872	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.872	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	93.861	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.861	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.682	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.682	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	63.214	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.745	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	81	78.767	ENSMEUG00000013605	-	87	78.767	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	95.142	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	94.131	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	Octodon_degus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	65.772	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.995	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	85.389	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.389	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.626	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.626	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.120	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.306	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.628	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.628	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.120	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.306	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.960	ENSOMEG00000001406	papolg	89	70.306	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	89.302	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	89.302	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.602	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.602	Ovis_aries
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.370	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	98.370	Pan_paniscus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.737	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.737	Panthera_pardus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.602	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.602	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.370	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	98.370	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.309	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	94.309	Papio_anubis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	94	70.423	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.363	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.363	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	79.111	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.111	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	93.179	ENSPEMG00000008960	-	100	93.179	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	52.763	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.318	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	87.183	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.766	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.272	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.857	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.617	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.807	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.433	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.497	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.170	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.505	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.505	Pongo_abelii
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	81.769	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	Procavia_capensis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	84.885	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.885	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	89	94.812	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.828	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.828	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	73.128	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.128	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	93.657	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	93.657	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	92.391	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	92.391	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	98.370	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	98.370	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	99.321	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	99.321	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	94	87.518	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.518	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.565	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.565	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	64.276	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.276	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.372	ENSSDUG00000000912	papolg	99	72.507	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.326	ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.460	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	78.752	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.752	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	70.573	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.421	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.086	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.086	Sus_scrofa
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	72	77.068	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	77.068	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.003	ENSTRUG00000006410	papolg	99	71.003	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	66.534	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.534	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	88.027	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.027	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	90.553	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.553	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	94.952	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.952	Ursus_americanus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	94.952	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.952	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	91.429	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.429	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	74.934	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	67	85.685	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.685	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000009102	PAPOLG	82	83.099	ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	Xiphophorus_maculatus