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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000009363 (Gene tree)
Gene ID: 100386340
Gene Symbol: REXO5
Alias: NEF-sp
Full Name: RNA exonuclease 5
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51843 bases
Position: chrNTIC01004446.1:15045099-15096941
Accession: 100386340
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000017186	RRM_1	PF00076.22	4.9e-13	1	1
ENSCJAP00000017194	RRM_1	PF00076.22	6.2e-13	1	1
ENSCJAP00000017190	RNase_T	PF00929.24	2.3e-06	1	1
ENSCJAP00000017186	RNase_T	PF00929.24	2.6e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000018184	REXO5-203	4345	-	ENSCJAP00000017194	708 (aa)	-	F7I7V7
ENSCJAT00000018176	REXO5-201	4543	-	ENSCJAP00000017186	774 (aa)	XP_009007519	F7I7Y5
ENSCJAT00000018180	REXO5-202	4450	-	ENSCJAP00000017190	743 (aa)	XP_009007523	F7I7W3

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	90.065	ENSG00000005189	REXO5	100	94.286	Homo_sapiens
ENSCJAG00000009363	REXO5	90	44.487	ENSAPOG00000008514	REXO5	91	35.780	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	83.097	ENSAMEG00000006178	REXO5	100	83.097	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000009363	REXO5	63	31.510	ENSAOCG00000003481	-	82	32.237	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000009363	REXO5	92	40.836	ENSAPEG00000010627	REXO5	98	35.152	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000009363	REXO5	77	38.250	ENSATEG00000004682	REXO5	97	38.856	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000009363	REXO5	93	52.482	ENSAPLG00000015740	REXO5	99	48.391	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000009363	REXO5	96	45.192	ENSACAG00000009744	REXO5	97	44.083	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	94.057	ENSANAG00000034379	REXO5	100	94.057	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000009363	REXO5	77	34.923	ENSACLG00000004778	REXO5	99	34.923	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	80.362	ENSBTAG00000006449	REXO5	98	80.362	Bos_taurus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	82.171	ENSCAFG00000017924	REXO5	100	82.171	Canis_familiaris
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	80.362	ENSCAFG00020021846	REXO5	99	80.362	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	81.654	ENSCHIG00000022443	REXO5	99	81.654	Capra_hircus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	71.484	ENSCPOG00000008940	REXO5	95	71.484	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	95.995	ENSCCAG00000034936	REXO5	100	95.995	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	90.039	ENSCATG00000044063	REXO5	100	90.039	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	74.839	ENSCLAG00000008033	REXO5	95	74.839	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	90.168	ENSCSAG00000007562	REXO5	100	90.168	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000009363	REXO5	77	82.828	ENSCHOG00000009146	-	79	82.828	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000009363	REXO5	97	47.950	ENSCPBG00000019062	REXO5	98	45.960	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	89.780	ENSCANG00000035776	REXO5	100	89.780	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	69.191	ENSCGRG00001016179	-	99	69.191	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	69.191	ENSCGRG00000010868	-	99	68.504	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000009363	REXO5	50	38.660	ENSCVAG00000014887	-	71	38.660	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000009363	REXO5	94	81.619	ENSEASG00005007266	REXO5	100	83.607	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	82.065	ENSECAG00000018769	REXO5	89	82.065	Equus_caballus
ENSCJAG00000009363	REXO5	84	71.930	ENSEEUG00000003572	REXO5	89	71.930	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	81.783	ENSFCAG00000015160	REXO5	100	81.783	Felis_catus
ENSCJAG00000009363	REXO5	93	48.214	ENSFALG00000014026	REXO5	99	46.371	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000009363	REXO5	98	39.450	ENSFHEG00000013388	REXO5	92	39.450	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000009363	REXO5	96	45.302	ENSGALG00000002239	REXO5	98	45.584	Gallus_gallus
ENSCJAG00000009363	REXO5	76	40.184	ENSGAFG00000011045	REXO5	98	32.701	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000009363	REXO5	57	40.046	ENSGACG00000019507	-	93	40.046	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000009363	REXO5	94	50.350	ENSGAGG00000008242	REXO5	94	46.950	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	89.935	ENSGGOG00000004539	REXO5	100	89.935	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	35.000	ENSHBUG00000017976	REXO5	92	35.000	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000009363	REXO5	86	74.439	ENSHGLG00000012652	REXO5	99	74.439	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	72.351	ENSHGLG00100013255	REXO5	100	71.772	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000009363	REXO5	66	38.182	ENSHCOG00000008648	REXO5	84	38.878	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000009363	REXO5	85	72.360	ENSSTOG00000007071	REXO5	97	71.064	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000009363	REXO5	95	69.689	ENSJJAG00000023821	-	96	69.689	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	33.551	ENSKMAG00000009488	REXO5	92	33.551	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000009363	REXO5	94	38.602	ENSLBEG00000009276	REXO5	99	33.213	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000009363	REXO5	75	56.863	ENSLACG00000001758	REXO5	89	56.863	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000009363	REXO5	98	80.607	ENSLAFG00000006157	REXO5	99	80.607	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	90.168	ENSMFAG00000036613	REXO5	100	90.168	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	90.039	ENSMMUG00000016748	REXO5	100	90.039	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	90.168	ENSMNEG00000045028	REXO5	100	90.168	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	90.039	ENSMLEG00000029851	REXO5	100	90.039	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000009363	REXO5	94	33.711	ENSMAMG00000006915	REXO5	92	33.711	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000009363	REXO5	97	33.456	ENSMZEG00005013657	REXO5	99	33.456	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000009363	REXO5	93	49.648	ENSMGAG00000010369	REXO5	99	46.543	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	84.645	ENSMICG00000014886	REXO5	100	84.645	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000009363	REXO5	59	69.147	ENSMOCG00000010062	-	100	69.147	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000009363	REXO5	98	53.342	ENSMODG00000007059	REXO5	94	53.342	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	65.459	MGP_CAROLIEiJ_G0030385	-	99	65.459	Mus_caroli
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	65.071	ENSMUSG00000030924	Rexo5	98	66.147	Mus_musculus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	65.459	MGP_SPRETEiJ_G0031499	-	99	65.459	Mus_spretus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	83.226	ENSMPUG00000013643	REXO5	100	83.226	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000009363	REXO5	94	68.904	ENSNGAG00000002025	-	98	70.601	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000009363	REXO5	73	35.567	ENSNBRG00000006877	REXO5	90	35.567	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	90.065	ENSNLEG00000012334	REXO5	100	90.065	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000009363	REXO5	93	52.885	ENSMEUG00000015298	REXO5	99	52.885	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000009363	REXO5	89	68.156	ENSOPRG00000011398	REXO5	89	68.156	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000009363	REXO5	85	43.846	ENSONIG00000000148	REXO5	97	39.789	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000009363	REXO5	92	61.484	ENSOANG00000014291	REXO5	100	53.711	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	79.226	ENSOCUG00000009913	REXO5	99	79.226	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	34.667	ENSORLG00000009738	REXO5	93	34.667	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000009363	REXO5	90	35.074	ENSORLG00020010270	REXO5	93	34.887	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	34.887	ENSORLG00015009678	REXO5	93	34.887	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000009363	REXO5	89	45.560	ENSOMEG00000019491	REXO5	91	34.626	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	81.161	ENSOGAG00000011564	REXO5	100	81.161	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	81.783	ENSOARG00000013401	REXO5	100	81.380	Ovis_aries
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	89.806	ENSPPAG00000035005	REXO5	100	89.806	Pan_paniscus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	78.839	ENSPPRG00000022345	REXO5	100	78.839	Panthera_pardus
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	82.065	ENSPTIG00000012096	REXO5	100	82.065	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	89.806	ENSPTRG00000007851	REXO5	100	89.806	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	89.909	ENSPANG00000006898	REXO5	99	89.909	Papio_anubis
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	38.231	ENSPKIG00000014406	REXO5	94	38.231	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000009363	REXO5	93	51.786	ENSPSIG00000012172	REXO5	94	45.889	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	53.637	ENSPCIG00000029238	-	99	54.351	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000009363	REXO5	78	36.526	ENSPFOG00000012767	REXO5	98	32.403	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000009363	REXO5	78	36.526	ENSPLAG00000006408	REXO5	98	32.403	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000009363	REXO5	96	39.490	ENSPMEG00000007726	REXO5	91	40.063	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000009363	REXO5	75	41.270	ENSPREG00000000146	REXO5	74	37.439	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	90.373	ENSPPYG00000007163	REXO5	100	90.065	Pongo_abelii
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	74.501	ENSPCAG00000006265	REXO5	100	74.501	Procavia_capensis
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	83.742	ENSPCOG00000018775	REXO5	100	83.742	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000009363	REXO5	94	81.893	ENSPVAG00000003293	REXO5	100	81.893	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000009363	REXO5	78	35.961	ENSPNYG00000006922	REXO5	90	35.813	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000009363	REXO5	90	36.464	ENSPNAG00000018866	-	91	36.464	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000009363	REXO5	97	71.010	ENSRNOG00000014513	Rexo5	99	67.152	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	89.521	ENSRBIG00000035163	REXO5	89	89.521	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	89.263	ENSRROG00000034741	REXO5	100	89.263	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000009363	REXO5	100	94.213	ENSSBOG00000029650	REXO5	100	94.213	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000009363	REXO5	97	55.802	ENSSHAG00000005042	REXO5	97	55.802	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000009363	REXO5	97	38.710	ENSSFOG00015007581	REXO5	98	38.710	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000009363	REXO5	91	35.602	ENSSMAG00000000709	REXO5	91	35.864	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000009363	REXO5	85	46.008	ENSSDUG00000014528	REXO5	91	34.505	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000009363	REXO5	90	33.947	ENSSLDG00000007641	REXO5	79	45.769	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	82.968	ENSSSCG00000007855	REXO5	99	82.968	Sus_scrofa
ENSCJAG00000009363	REXO5	93	49.286	ENSTGUG00000009219	REXO5	99	47.035	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000009363	REXO5	86	46.269	ENSTRUG00000015295	-	91	34.850	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000009363	REXO5	85	81.714	ENSTBEG00000008797	REXO5	90	78.740	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000009363	REXO5	99	80.234	ENSTTRG00000016439	REXO5	99	80.234	Tursiops_truncatus
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