EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000010512 (Gene tree)
Gene ID: 100391762
Gene Symbol: POLR1E
Alias: FLJ13390|FLJ13970|PAF53|PRAF1
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29860 bases
Position: chrNTIC01000001.1:72290526-72320385
Accession: 17631
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000019427	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.1e-100	1	1
ENSCJAP00000019423	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.3e-95	1	2
ENSCJAP00000019423	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.3e-95	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000020522	POLR1E-201	2085	-	ENSCJAP00000019427	401 (aa)	-	F6U0F9
ENSCJAT00000020518	POLR1E-202	1365	-	ENSCJAP00000019423	454 (aa)	-	F6U0K3

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000010512's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000010512's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	93.048	ENSG00000137054	POLR1E	94	88.579	Homo_sapiens
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	45.430	ENSAPOG00000012452	polr1e	95	46.966	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	76.667	ENSAMEG00000010193	POLR1E	92	72.727	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	42.779	ENSACIG00000009884	polr1e	98	41.176	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	48.387	ENSAOCG00000005665	polr1e	95	44.221	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	48.118	ENSAPEG00000020581	polr1e	95	43.970	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	48.387	ENSATEG00000020609	polr1e	94	45.063	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	73	55.655	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	51.181	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	97.594	ENSANAG00000038046	POLR1E	100	89.384	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.646	ENSACLG00000013685	polr1e	93	42.857	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.324	ENSAMXG00000018181	polr1e	95	41.058	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	87.433	ENSBTAG00000012243	POLR1E	95	83.081	Bos_taurus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.898	ENSCAFG00000002377	POLR1E	94	81.980	Canis_familiaris
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.631	ENSCAFG00020017851	POLR1E	94	81.726	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	87.166	ENSCHIG00000019479	POLR1E	95	82.576	Capra_hircus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	85.829	ENSTSYG00000002075	POLR1E	94	81.218	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000010512	POLR1E	61	83.951	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	75.261	Cavia_aperea
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	83.690	ENSCPOG00000009965	POLR1E	89	83.690	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	88.503	ENSCCAG00000029460	POLR1E	94	82.741	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.513	ENSCATG00000031732	POLR1E	93	96.774	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	86.066	ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.066	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	91.979	ENSCSAG00000010782	POLR1E	94	87.563	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	100	64.854	ENSCHOG00000013024	POLR1E	100	64.854	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	65.668	ENSCPBG00000006923	POLR1E	95	62.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.246	ENSCANG00000036112	POLR1E	93	93.548	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	78.342	ENSCGRG00001006197	Polr1e	91	74.112	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	77.807	ENSCGRG00000006430	Polr1e	91	73.604	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000010512	POLR1E	90	44.353	ENSCSEG00000005121	polr1e	95	42.746	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	43.750	ENSCVAG00000019759	polr1e	94	41.013	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	42.627	ENSDARG00000006434	polr1e	95	40.351	Danio_rerio
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	76.123	ENSDNOG00000010257	POLR1E	95	72.009	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	81.789	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	75.350	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	87.968	ENSEASG00005000675	POLR1E	94	82.995	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	88.235	ENSECAG00000014669	POLR1E	94	83.249	Equus_caballus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	99	62.185	ENSEEUG00000011928	POLR1E	99	62.893	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	90	47.922	ENSELUG00000008150	polr1e	94	43.467	Esox_lucius
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	84.759	ENSFCAG00000013081	POLR1E	99	78.692	Felis_catus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	59.299	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	56.599	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	84.492	ENSFDAG00000016917	POLR1E	89	84.492	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.837	ENSFHEG00000009801	polr1e	95	41.162	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	38.710	ENSGMOG00000003336	POLR1E	90	39.948	Gadus_morhua
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	61.518	ENSGALG00000005395	POLR1E	96	57.071	Gallus_gallus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.986	ENSGAFG00000004850	polr1e	95	41.855	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	95	44.730	ENSGACG00000016087	polr1e	92	44.730	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	58.743	ENSGAGG00000001659	POLR1E	100	53.598	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.781	ENSGGOG00000001882	POLR1E	93	96.774	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.910	ENSHBUG00000002559	polr1e	93	43.108	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.364	ENSHGLG00000002036	POLR1E	90	86.364	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.096	ENSHGLG00100012784	POLR1E	90	86.096	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	45.161	ENSHCOG00000002774	polr1e	94	42.025	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.405	ENSIPUG00000003019	polr1e	95	42.821	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	85.027	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	76.386	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	81.720	ENSJJAG00000020731	Polr1e	86	81.720	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.986	ENSKMAG00000000046	polr1e	95	40.750	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	46.174	ENSLBEG00000003104	polr1e	93	44.557	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	62.461	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	57.618	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	48.930	ENSLOCG00000012859	polr1e	94	48.861	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.631	ENSLAFG00000012831	POLR1E	89	86.631	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.781	ENSMFAG00000045465	POLR1E	93	96.774	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.781	ENSMMUG00000017892	POLR1E	93	96.774	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	85.117	ENSMNEG00000040283	POLR1E	86	91.160	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.513	ENSMLEG00000031135	POLR1E	93	96.774	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.646	ENSMAMG00000001260	polr1e	94	42.500	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.910	ENSMZEG00005021536	polr1e	90	45.910	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	78.075	ENSMAUG00000021044	Polr1e	91	74.112	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	88.770	ENSMICG00000003673	POLR1E	95	82.809	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	78.342	ENSMOCG00000012920	Polr1e	91	74.555	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	46.612	ENSMMOG00000007391	polr1e	95	42.532	Mola_mola
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	73.497	ENSMODG00000002884	POLR1E	90	73.497	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	46.702	ENSMALG00000002665	polr1e	90	46.702	Monopterus_albus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	76.550	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	99	71.322	Mus_caroli
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	76.280	ENSMUSG00000028318	Polr1e	99	71.464	Mus_musculus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	77.898	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	99	73.500	Mus_pahari
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	76.011	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	99	70.823	Mus_spretus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	77.123	ENSMPUG00000006040	POLR1E	94	73.198	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.096	ENSMLUG00000012688	POLR1E	86	86.096	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	81.720	ENSNGAG00000002520	Polr1e	91	76.904	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	46.174	ENSNBRG00000016822	polr1e	90	46.174	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	93.583	ENSNLEG00000003616	POLR1E	93	96.774	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000010512	POLR1E	69	86.275	ENSMEUG00000015372	-	73	86.275	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	71.656	ENSOPRG00000014206	POLR1E	100	66.017	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	84.492	ENSODEG00000014565	POLR1E	90	83.051	Octodon_degus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.910	ENSONIG00000008921	polr1e	90	45.910	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	82.620	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	74.757	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	46.237	ENSORLG00000005143	polr1e	94	43.641	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000010512	POLR1E	84	47.647	ENSORLG00020007271	polr1e	96	43.896	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000010512	POLR1E	96	44.961	ENSORLG00015000137	polr1e	93	44.961	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.652	ENSOMEG00000013264	polr1e	92	41.895	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	87.701	ENSOGAG00000012981	POLR1E	92	82.995	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.898	ENSOARG00000011465	POLR1E	91	82.323	Ovis_aries
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	93.316	ENSPPAG00000034566	POLR1E	93	96.774	Pan_paniscus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	84.759	ENSPPRG00000005649	POLR1E	99	78.692	Panthera_pardus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	84.759	ENSPTIG00000009774	POLR1E	99	78.692	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	93.316	ENSPTRG00000020944	POLR1E	93	96.774	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.781	ENSPANG00000025563	POLR1E	93	96.774	Papio_anubis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.553	ENSPKIG00000003562	polr1e	96	44.282	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000010512	POLR1E	88	62.040	ENSPSIG00000003274	POLR1E	96	57.073	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	89	45.961	ENSPMGG00000024169	polr1e	99	42.131	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	78.877	ENSPEMG00000019151	-	91	74.619	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	63.200	ENSPEMG00000022300	-	90	59.241	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	72.951	ENSPCIG00000014798	POLR1E	90	72.951	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	42.857	ENSPFOG00000019627	polr1e	93	39.379	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.380	ENSPLAG00000022679	polr1e	94	41.772	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	47.134	ENSPMEG00000022123	polr1e	92	42.340	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.565	ENSPREG00000009470	polr1e	95	40.806	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.513	ENSPPYG00000019061	POLR1E	94	87.817	Pongo_abelii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	65	67.568	ENSPCAG00000004891	POLR1E	100	61.842	Procavia_capensis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	89.305	ENSPCOG00000027448	POLR1E	89	89.305	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000010512	POLR1E	87	88.252	ENSPVAG00000007940	POLR1E	97	76.559	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	45.910	ENSPNYG00000001032	polr1e	93	43.108	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	43.127	ENSPNAG00000006987	polr1e	95	39.747	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	76.550	ENSRNOG00000012664	Polr1e	91	72.589	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	88.378	ENSRBIG00000034214	POLR1E	100	87.402	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	92.246	ENSRROG00000031986	POLR1E	93	96.774	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	96.524	ENSSBOG00000021415	POLR1E	100	87.238	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	78	72.381	ENSSHAG00000016084	POLR1E	100	63.889	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	46.721	ENSSFOG00015002293	polr1e	95	43.577	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	48.021	ENSSMAG00000011672	polr1e	87	46.329	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	47.230	ENSSDUG00000022279	polr1e	93	45.340	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000010512	POLR1E	97	45.802	ENSSLDG00000024918	polr1e	93	45.802	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	67	67.241	ENSSARG00000009810	-	79	59.052	Sorex_araneus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	66.304	ENSSPUG00000009499	POLR1E	94	61.421	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	48.118	ENSSPAG00000021240	polr1e	94	44.332	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	87.968	ENSSSCG00000005347	POLR1E	95	83.081	Sus_scrofa
ENSCJAG00000010512	POLR1E	87	52.500	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	47.856	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	43.717	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.520	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	44.236	ENSTNIG00000017812	polr1e	95	42.462	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	83.422	ENSTBEG00000013786	POLR1E	98	75.803	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000010512	POLR1E	87	86.932	ENSTTRG00000008294	POLR1E	97	75.957	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.631	ENSUAMG00000012474	POLR1E	100	86.649	Ursus_americanus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.631	ENSUMAG00000011496	POLR1E	89	86.631	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	85	80.938	ENSVPAG00000009048	POLR1E	97	68.750	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	86.096	ENSVVUG00000019954	POLR1E	94	81.472	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	54.472	ENSXETG00000006533	polr1e	95	51.378	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	43.750	ENSXCOG00000013706	polr1e	95	40.201	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.652	ENSXMAG00000012484	polr1e	95	41.960	Xiphophorus_maculatus