EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000010616 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PRPF6
Alias: ANT-1|C20orf14|Prp6|RP60|SNRNP102|TOM|U5-102K|bB152O15.1|hPrp6
Full Name: pre-mRNA processing factor 6
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51736 bases
Position: chrNTIC01034389.1:56544695-56596430
Accession: 15860
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000019620	PRP1_N	PF06424.12	2.4e-57	1	1
ENSCJAP00000063088	PRP1_N	PF06424.12	6.7e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000082088	PRPF6-202	1863	-	ENSCJAP00000063088	620 (aa)	-	A0A2R8MPJ2
ENSCJAT00000020737	PRPF6-201	2826	-	ENSCJAP00000019620	941 (aa)	-	U3FT76

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.150	ENSG00000101161	PRPF6	100	99.150	Homo_sapiens
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.349	ENSAPOG00000010395	prpf6	96	92.774	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	96.497	ENSAMEG00000001916	PRPF6	99	96.497	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.030	ENSACIG00000019862	prpf6	96	92.455	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.242	ENSAOCG00000012988	prpf6	96	92.667	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	85.654	ENSAPEG00000008301	prpf6	100	86.185	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.711	ENSATEG00000005581	prpf6	96	92.136	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.131	ENSACAG00000006464	PRPF6	95	97.131	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	100.000	ENSANAG00000012661	PRPF6	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.923	ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.349	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	92.234	ENSAMXG00000001929	prpf6	96	92.660	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.450	ENSBTAG00000011656	PRPF6	100	97.450	Bos_taurus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.768	ENSCAFG00000013165	PRPF6	100	97.768	Canis_familiaris
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.768	ENSCAFG00020002050	PRPF6	100	97.768	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.450	ENSCHIG00000018187	PRPF6	100	97.450	Capra_hircus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.406	ENSTSYG00000007814	PRPF6	100	98.406	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000010616	PRPF6	97	96.947	ENSCAPG00000015077	PRPF6	100	96.947	Cavia_aperea
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.193	ENSCPOG00000007518	PRPF6	100	98.193	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	96.805	ENSCCAG00000024564	PRPF6	100	96.599	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.044	ENSCATG00000037473	PRPF6	100	99.044	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	94.155	ENSCLAG00000003854	PRPF6	100	94.155	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	93.981	ENSCSAG00000016742	PRPF6	100	93.981	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	85	80.650	ENSCHOG00000003315	-	100	80.650	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.343	ENSCPBG00000013964	PRPF6	96	97.343	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	73.150	ENSCING00000008817	-	99	73.150	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.044	ENSCANG00000038230	PRPF6	100	99.044	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.300	ENSCGRG00001022666	Prpf6	100	98.300	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	86.716	ENSCSEG00000018561	prpf6	100	87.141	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.561	ENSCVAG00000010550	prpf6	96	92.986	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.817	ENSDARG00000091367	prpf6	99	92.242	Danio_rerio
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.131	ENSDNOG00000040544	PRPF6	100	97.131	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	91	97.430	ENSDORG00000005406	Prpf6	100	97.430	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	71.996	FBgn0036828	CG6841	98	72.425	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000010616	PRPF6	85	94.737	ENSETEG00000004447	PRPF6	85	94.737	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	87.169	ENSEBUG00000008835	prpf6	99	87.169	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.556	ENSEASG00005023115	PRPF6	100	97.556	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	93.411	ENSECAG00000013983	PRPF6	100	93.411	Equus_caballus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	90	100.000	ENSEEUG00000000180	PRPF6	81	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	90.967	ENSELUG00000001945	prpf6	93	90.967	Esox_lucius
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.556	ENSFCAG00000001183	PRPF6	100	97.556	Felis_catus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	89.692	ENSFALG00000006046	-	97	89.692	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.343	ENSFALG00000010326	-	97	97.343	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	96.706	ENSFDAG00000006451	PRPF6	100	98.073	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.880	ENSFHEG00000000560	prpf6	96	92.880	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	88.689	ENSGMOG00000015622	prpf6	99	88.689	Gadus_morhua
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.343	ENSGALG00000006001	PRPF6	100	97.343	Gallus_gallus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	87.354	ENSGAFG00000021109	prpf6	96	87.779	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	90.967	ENSGACG00000002576	prpf6	99	90.967	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.237	ENSGAGG00000008653	PRPF6	96	97.237	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.150	ENSGGOG00000016876	PRPF6	100	99.492	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.923	ENSHBUG00000004496	prpf6	96	92.349	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.981	ENSHGLG00000009222	PRPF6	100	97.981	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000010616	PRPF6	97	97.928	ENSHGLG00100016600	PRPF6	100	97.928	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	90.967	ENSHCOG00000011513	prpf6	96	91.392	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.774	ENSIPUG00000004912	prpf6	96	92.774	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	95.435	ENSSTOG00000002922	PRPF6	100	95.435	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.193	ENSJJAG00000000836	Prpf6	100	98.193	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.923	ENSKMAG00000017800	prpf6	96	92.349	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.392	ENSLBEG00000012582	prpf6	96	91.392	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	93.943	ENSLOCG00000004827	prpf6	96	92.986	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.343	ENSLAFG00000005272	PRPF6	100	97.343	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.044	ENSMFAG00000037542	PRPF6	100	99.322	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.357	ENSMMUG00000015558	PRPF6	98	99.480	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	84.640	ENSMNEG00000045555	PRPF6	100	84.640	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.030	ENSMAMG00000010718	prpf6	96	92.455	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	94	91.383	ENSMZEG00005026539	prpf6	100	91.837	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.401	ENSMZEG00005015261	-	99	91.826	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010616	PRPF6	97	97.274	ENSMGAG00000006634	PRPF6	100	97.274	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.406	ENSMAUG00000013969	Prpf6	100	98.406	Mesocricetus_auratus
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ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.300	ENSMOCG00000001701	Prpf6	100	98.300	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.286	ENSMMOG00000020419	prpf6	100	91.711	Mola_mola
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	98.274	ENSMODG00000017051	PRPF6	99	98.274	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	92.159	ENSMALG00000000089	prpf6	100	92.159	Monopterus_albus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.711	MGP_CAROLIEiJ_G0024814	Prpf6	100	100.000	Mus_caroli
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.406	ENSMUSG00000002455	Prpf6	100	100.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.406	MGP_PahariEiJ_G0026262	Prpf6	100	100.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.406	MGP_SPRETEiJ_G0025741	Prpf6	100	100.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	93	97.232	ENSMPUG00000008673	PRPF6	99	97.378	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.300	ENSNGAG00000003365	Prpf6	100	98.300	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.030	ENSNBRG00000015025	prpf6	96	92.455	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.044	ENSNLEG00000010208	PRPF6	100	99.044	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	88.270	ENSMEUG00000009824	-	90	88.270	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.774	ENSODEG00000004841	PRPF6	100	92.774	Octodon_degus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	91.923	ENSONIG00000017406	prpf6	96	92.349	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.556	ENSOANG00000004920	PRPF6	100	97.556	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	96.245	ENSOCUG00000014151	PRPF6	100	96.245	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.136	ENSORLG00000009592	prpf6	96	92.136	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.242	ENSORLG00020001458	prpf6	96	92.242	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.242	ENSORLG00015018762	prpf6	96	92.242	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.136	ENSOMEG00000012174	prpf6	96	92.561	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	90.446	ENSOGAG00000007573	PRPF6	100	90.446	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.024	ENSOARG00000008776	PRPF6	99	97.024	Ovis_aries
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.150	ENSPPAG00000008686	PRPF6	100	99.492	Pan_paniscus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.556	ENSPPRG00000008497	PRPF6	100	97.556	Panthera_pardus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	97	97.492	ENSPTIG00000011184	PRPF6	97	97.492	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	99.150	ENSPTRG00000013765	PRPF6	100	99.492	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.512	ENSPANG00000024135	PRPF6	100	98.512	Papio_anubis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	93.305	ENSPKIG00000005627	prpf6	99	93.730	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000010616	PRPF6	94	97.392	ENSPSIG00000007717	PRPF6	100	97.392	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	89.703	ENSPMGG00000008925	prpf6	96	89.915	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	98.300	ENSPEMG00000016036	Prpf6	100	98.300	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000010616	PRPF6	99	88.310	ENSPMAG00000006144	prpf6	99	88.310	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.875	ENSPCIG00000017909	PRPF6	100	97.875	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.242	ENSPFOG00000006431	prpf6	96	92.667	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.136	ENSPLAG00000005974	prpf6	96	92.561	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	92.349	ENSPMEG00000009977	prpf6	96	92.774	Poecilia_mexicana
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