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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000010710 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 173695 bases
Position: chrNTIC01000001.1:107297341-107471035
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000011360	ResIII	PF04851.15	2.6e-08	1	1
ENSCJAP00000011432	ResIII	PF04851.15	3e-08	1	1
ENSCJAP00000019850	ResIII	PF04851.15	3e-08	1	1
ENSCJAP00000059897	ResIII	PF04851.15	3.1e-08	1	1
ENSCJAP00000059897	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1
ENSCJAP00000011360	BRK	PF07533.16	3.1e-17	1	1
ENSCJAP00000019850	BRK	PF07533.16	3.4e-17	1	1
ENSCJAP00000011432	BRK	PF07533.16	3.4e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000020910	SMARCA2-204	747	-	ENSCJAP00000019784	248 (aa)	-	F6WD97
ENSCJAT00000075347	SMARCA2-206	783	-	ENSCJAP00000056050	260 (aa)	-	A0A2R8M9N7
ENSCJAT00000020927	SMARCA2-205	837	-	ENSCJAP00000019801	278 (aa)	-	F7CNV9
ENSCJAT00000012060	SMARCA2-203	4713	-	ENSCJAP00000011432	1570 (aa)	-	F7HNQ9
ENSCJAT00000012010	SMARCA2-209	867	-	ENSCJAP00000011382	288 (aa)	-	F7I404
ENSCJAT00000068130	SMARCA2-201	7077	-	ENSCJAP00000059897	1614 (aa)	-	A0A2R8N4Z7
ENSCJAT00000086276	SMARCA2-207	549	-	ENSCJAP00000057450	182 (aa)	-	A0A2R8MCR1
ENSCJAT00000011988	SMARCA2-208	4257	-	ENSCJAP00000011360	1418 (aa)	-	F7I6G7
ENSCJAT00000020977	SMARCA2-202	4782	-	ENSCJAP00000019850	1593 (aa)	-	F7C7U1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	92	78.184	ENSCJAG00000005936	SMARCA4	98	72.617

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	99.144	ENSG00000080503	SMARCA2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.929	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.519	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	89.613	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.296	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.309	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.974	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	80.100	ENSAOCG00000009647	-	97	80.415	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.070	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	80.584	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.761	ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	81.282	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	90.021	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	90.021	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	90.304	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.670	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	99.429	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	99.552	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.361	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	81.581	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	81.378	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	82.609	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.074	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	97.436	Bos_taurus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	96.623	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	97.889	Canis_familiaris
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	76	96.182	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	94.906	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	96.254	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	97.436	Capra_hircus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.018	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	98.038	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	92.582	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	93.466	Cavia_aperea
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.220	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	97.439	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	99.643	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	99.744	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.362	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	98.529	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.863	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	97.953	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.431	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	98.504	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	89	93.504	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	93.504	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	91.362	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	99	95.609	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.857	ENSCANG00000039597	SMARCA2	99	98.976	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	88.298	ENSCGRG00001002323	Smarca2	99	89.840	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	77.298	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	77.438	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	94	80.179	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	78.746	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	81.414	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.020	Danio_rerio
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	96.343	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	96.343	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.432	ENSDORG00000014832	Smarca2	99	97.694	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	77	62.222	FBgn0000212	brm	90	53.567	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	88	61.402	ENSEBUG00000002449	-	95	63.794	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	98	71.641	ENSEBUG00000011442	-	96	70.321	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	96.444	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	97.570	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	67	98.611	ENSEEUG00000015540	-	69	98.611	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	96	80.405	ENSELUG00000010318	smarca2	96	79.236	Esox_lucius
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.218	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	97.438	Felis_catus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	91.883	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.292	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.151	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	95.810	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.102	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.618	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	98	77.548	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.828	Gadus_morhua
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	92.712	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.825	Gallus_gallus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	94	79.285	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	93	76.578	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	79.216	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.811	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	92.015	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	91.952	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	93.143	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	97.628	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.117	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.557	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.788	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	96.315	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	95.859	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	95.859	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	74.929	ENSHCOG00000015348	-	88	86.733	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	82.261	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	81.654	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.362	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	99	98.401	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.363	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	97.695	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.324	ENSKMAG00000015844	-	98	79.541	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	54	71.941	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	73.697	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	98	84.003	ENSLOCG00000011499	smarca2	97	83.817	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	95.259	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.322	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.071	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	97.247	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.930	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	98.534	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.219	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	97.447	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	94.727	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	95.903	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.928	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	82.276	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.361	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.779	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	85	77.955	ENSMGAG00000005160	-	100	77.822	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	97.238	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	98.462	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.080	ENSMOCG00000001611	Smarca2	99	97.185	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.131	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	97	79.256	Mola_mola
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	94.099	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	93.845	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.135	ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.744	Monopterus_albus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.745	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	96.819	Mus_caroli
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.671	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.017	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	97.064	Mus_pahari
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.532	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	99	96.565	Mus_spretus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	80	99.141	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	99.141	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	91.427	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	91.604	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.014	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	95.331	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	93	71.258	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	94.350	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	95.516	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	89.064	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	85.122	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	90.748	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	91.954	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.813	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	96.127	Octodon_degus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.989	ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.796	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	55	94.480	ENSOANG00000008299	-	95	98.248	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.813	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	99	97.072	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	79.461	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	78.470	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.561	ENSORLG00015006289	SMARCA2	98	91.008	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.077	ENSOMEG00000009736	-	97	80.378	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	93.728	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	100	94.448	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	95.442	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	95.777	Ovis_aries
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	95.021	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	98.356	Pan_paniscus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.290	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	97.502	Panthera_pardus
ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	99.121	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	99.121	Pan_troglodytes
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