EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000010778 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB11B
Alias: H-YPT3
Full Name: RAB11B%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12833 bases
Position: chrNTIC01011113.1:5846748-5859580
Accession: 9761
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000019878	MMR_HSR1	PF01926.23	2.7e-07	1	1
ENSCJAP00000019889	MMR_HSR1	PF01926.23	3.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000021019	RAB11B-201	657	-	ENSCJAP00000019889	218 (aa)	-	F7BSW8
ENSCJAT00000021005	RAB11B-202	540	-	ENSCJAP00000019878	179 (aa)	-	F7BT36
ENSCJAT00000066474	RAB11B-203	573	-	ENSCJAP00000060645	190 (aa)	-	A0A2R8MJ30

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000010778's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000010778's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000010778	RAB11B	93	39.011	ENSCJAG00000040200	RAB33B	79	39.011
ENSCJAG00000010778	RAB11B	85	34.615	ENSCJAG00000021602	RERG	81	33.939
ENSCJAG00000010778	RAB11B	91	45.062	ENSCJAG00000019696	RAB15	87	54.369
ENSCJAG00000010778	RAB11B	92	37.576	ENSCJAG00000039039	RAB6A	79	37.576
ENSCJAG00000010778	RAB11B	91	37.037	ENSCJAG00000010247	RAB23	80	35.602
ENSCJAG00000010778	RAB11B	85	30.435	ENSCJAG00000019369	RASL11A	66	30.435
ENSCJAG00000010778	RAB11B	94	32.877	ENSCJAG00000009762	RAB36	79	32.877
ENSCJAG00000010778	RAB11B	89	56.875	ENSCJAG00000008981	RAB2B	99	48.387
ENSCJAG00000010778	RAB11B	91	47.531	ENSCJAG00000041780	RAB5B	86	43.689
ENSCJAG00000010778	RAB11B	88	36.306	ENSCJAG00000018414	-	67	36.306
ENSCJAG00000010778	RAB11B	85	35.897	ENSCJAG00000013101	RAB34	60	35.897
ENSCJAG00000010778	RAB11B	82	34.694	ENSCJAG00000012199	HRAS	85	36.420
ENSCJAG00000010778	RAB11B	82	32.432	ENSCJAG00000044294	MRAS	81	33.529
ENSCJAG00000010778	RAB11B	79	30.282	ENSCJAG00000005865	ARL8A	72	30.282
ENSCJAG00000010778	RAB11B	82	30.464	ENSCJAG00000042173	-	87	32.121
ENSCJAG00000010778	RAB11B	87	42.236	ENSCJAG00000003973	RAB9A	83	40.719
ENSCJAG00000010778	RAB11B	89	48.447	ENSCJAG00000047802	RAB39B	82	47.126
ENSCJAG00000010778	RAB11B	92	52.727	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	45.581
ENSCJAG00000010778	RAB11B	92	53.939	ENSCJAG00000042020	RAB14	81	52.299
ENSCJAG00000010778	RAB11B	89	55.975	ENSCJAG00000047933	-	99	48.804
ENSCJAG00000010778	RAB11B	93	42.771	ENSCJAG00000044464	RAB22A	86	42.771
ENSCJAG00000010778	RAB11B	93	47.368	ENSCJAG00000009933	-	94	41.667
ENSCJAG00000010778	RAB11B	91	48.148	ENSCJAG00000008955	RAB35	99	42.105
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	97.647	ENSCJAG00000042037	RAB11A	100	91.284
ENSCJAG00000010778	RAB11B	91	48.148	ENSCJAG00000048394	RAB5A	91	42.718
ENSCJAG00000010778	RAB11B	90	55.280	ENSCJAG00000001599	-	99	48.095
ENSCJAG00000010778	RAB11B	88	40.491	ENSCJAG00000017521	RAB7A	81	39.623
ENSCJAG00000010778	RAB11B	93	32.738	ENSCJAG00000042669	RHEB	91	32.738
ENSCJAG00000010778	RAB11B	87	42.500	ENSCJAG00000002524	RAB33A	75	40.331
ENSCJAG00000010778	RAB11B	82	34.694	ENSCJAG00000044757	KRAS	93	34.066
ENSCJAG00000010778	RAB11B	88	43.671	ENSCJAG00000015468	RAB12	60	35.849
ENSCJAG00000010778	RAB11B	96	39.524	ENSCJAG00000041773	RAB30	97	39.524
ENSCJAG00000010778	RAB11B	82	35.374	ENSCJAG00000036517	NRAS	95	36.471
ENSCJAG00000010778	RAB11B	92	47.024	ENSCJAG00000045749	RAB18	84	45.714
ENSCJAG00000010778	RAB11B	94	41.243	ENSCJAG00000003347	RAB9B	88	41.243
ENSCJAG00000010778	RAB11B	94	70.833	ENSCJAG00000007715	RAB25	99	60.633

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSG00000185236	RAB11B	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000010778	RAB11B	99	98.630	ENSAMEG00000004955	RAB11B	99	98.630	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000010778	RAB11B	96	97.076	ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.076	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.495	ENSAOCG00000018050	rab11ba	100	94.495	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.037	ENSAPEG00000009177	rab11ba	100	94.037	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	95.413	ENSATEG00000023730	rab11ba	100	95.413	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSANAG00000037616	RAB11B	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	89.412	ENSACLG00000018852	-	92	87.685	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	93.119	ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	92.353	WBGene00004274	rab-11.1	99	80.556	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCAFG00000032060	RAB11B	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCAFG00020022184	RAB11B	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSTSYG00000014758	RAB11B	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSCPOG00000030154	RAB11B	100	99.541	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCCAG00000031042	RAB11B	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCLAG00000003207	RAB11B	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCSAG00000008024	RAB11B	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	85.780	ENSCHOG00000013525	RAB11B	100	85.780	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	95.294	ENSCING00000009526	-	100	84.475	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCANG00000040517	RAB11B	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCGRG00001013827	Rab11b	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSCGRG00000010967	Rab11b	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.495	ENSCSEG00000007121	rab11ba	84	94.495	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	96.330	ENSDARG00000041878	rab11ba	100	96.330	Danio_rerio
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	98.165	ENSDNOG00000004134	-	100	98.165	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSDNOG00000014618	RAB11B	97	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.083	ENSDORG00000006304	Rab11b	100	99.083	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.037	ENSEBUG00000011775	rab11ba	99	94.146	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	89.412	ENSEBUG00000015447	-	100	81.651	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000010778	RAB11B	80	100.000	ENSEEUG00000009165	-	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	96.471	ENSELUG00000019240	-	99	92.784	Esox_lucius
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSFCAG00000015216	RAB11B	100	99.541	Felis_catus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSFDAG00000019872	RAB11B	100	99.541	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.037	ENSFHEG00000022642	rab11ba	100	94.037	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	92.661	ENSGMOG00000007390	rab11ba	99	92.661	Gadus_morhua
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.495	ENSGAFG00000005679	rab11ba	100	94.495	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.083	ENSGAGG00000012557	-	100	99.083	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSHGLG00000014984	RAB11B	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSHGLG00100003638	RAB11B	100	99.541	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSSTOG00000031571	RAB11B	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSJJAG00000018891	Rab11b	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSKMAG00000006082	-	100	94.954	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSLBEG00000006087	rab11ba	100	94.954	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000010778	RAB11B	96	99.415	ENSLACG00000016974	RAB11B	99	99.415	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSLAFG00000013598	RAB11B	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSMNEG00000039759	-	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.495	ENSMAMG00000018556	rab11ba	100	94.495	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	89.412	ENSMZEG00005019251	-	92	87.685	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	93.119	ENSMZEG00005010947	rab11ba	100	93.119	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSMAUG00000021579	Rab11b	100	99.541	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSMOCG00000012667	Rab11b	100	99.541	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	92.202	ENSMALG00000021949	rab11ba	100	92.202	Monopterus_albus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0021415	Rab11b	100	100.000	Mus_caroli
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.083	ENSMUSG00000077450	Rab11b	100	99.083	Mus_musculus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0020420	Rab11b	100	100.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0022327	Rab11b	100	100.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	99.541	ENSMPUG00000007263	RAB11B	100	99.541	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	95.475	ENSMLUG00000002308	-	100	95.475	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSNGAG00000015757	Rab11b	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	93.578	ENSNBRG00000023898	rab11ba	84	93.578	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSNLEG00000001733	RAB11B	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSODEG00000011371	RAB11B	100	100.000	Octodon_degus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.037	ENSONIG00000002535	rab11ba	100	94.037	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	88	100.000	ENSOCUG00000028208	RAB11B	63	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	99	95.853	ENSORLG00000015307	rab11ba	99	95.853	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000010778	RAB11B	99	95.853	ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000010778	RAB11B	99	96.296	ENSORLG00015016946	rab11ba	81	96.296	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000010778	RAB11B	99	95.853	ENSOMEG00000002581	rab11ba	99	95.853	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSOARG00000003801	RAB11B	97	100.000	Ovis_aries
ENSCJAG00000010778	RAB11B	96	100.000	ENSPPRG00000010160	RAB11B	84	100.000	Panthera_pardus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSPEMG00000014536	Rab11b	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000010778	RAB11B	88	94.268	ENSPMAG00000009335	-	100	80.952	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSPFOG00000006159	rab11ba	100	94.954	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSPLAG00000014243	rab11ba	100	94.954	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSPMEG00000007917	rab11ba	75	94.954	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSPREG00000006357	rab11ba	78	94.954	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSPPYG00000009504	RAB11B	100	100.000	Pongo_abelii
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	91.284	ENSPCAG00000016118	RAB11B	100	91.284	Procavia_capensis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	82	97.945	ENSPCOG00000008655	-	100	97.945	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSPCOG00000028053	RAB11B	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSPVAG00000009645	RAB11B	100	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	95	77.907	ENSPNYG00000023810	-	90	78.537	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	93.119	ENSPNYG00000019644	rab11ba	100	93.119	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	97.706	ENSPNAG00000006431	-	100	97.706	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	97.248	ENSPNAG00000020475	rab11ba	100	97.248	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSRNOG00000007648	Rab11b	100	100.000	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSSBOG00000035094	RAB11B	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSSDUG00000002965	rab11ba	100	94.954	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.954	ENSSLDG00000005221	rab11ba	100	94.954	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.037	ENSSPAG00000017313	rab11ba	100	94.037	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSSSCG00000013600	RAB11B	100	100.000	Sus_scrofa
ENSCJAG00000010778	RAB11B	72	100.000	ENSTBEG00000014750	-	100	100.000	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSTTRG00000009758	RAB11B	100	100.000	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	94	80.488	ENSUMAG00000014594	RAB11B	97	80.488	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	ENSVVUG00000025210	RAB11B	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	95.413	ENSXETG00000021890	rab11b.2	99	95.413	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000010778	RAB11B	74	97.744	ENSXCOG00000009194	-	98	97.744	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	94.495	ENSXMAG00000013416	rab11ba	100	94.495	Xiphophorus_maculatus