EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000010968 (Gene tree)
Gene ID: 100394820
Gene Symbol: URB2
Alias: KIAA0133|NET10|NPA2
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34351 bases
Position: chrNTIC01010001.1:15878062-15912412
Accession: 28967
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000060069	Urb2	PF10441.9	1e-25	1	1
ENSCJAP00000055580	Urb2	PF10441.9	2.1e-17	1	1
ENSCJAP00000020262	Urb2	PF10441.9	3.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000078557	URB2-203	4521	-	ENSCJAP00000055580	1506 (aa)	-	A0A2R8M8N3
ENSCJAT00000021406	URB2-201	6017	-	ENSCJAP00000020262	1442 (aa)	-	F7EE89
ENSCJAT00000073681	URB2-202	4572	-	ENSCJAP00000060069	1523 (aa)	-	U3EWQ6

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000010968's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000010968's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.388	ENSG00000135763	URB2	100	95.238	Homo_sapiens
ENSCJAG00000010968	URB2	88	61.702	ENSAPOG00000000608	urb2	89	61.702	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	83.257	ENSAMEG00000009206	URB2	95	87.857	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000010968	URB2	99	61.702	ENSAOCG00000019961	urb2	91	61.702	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000010968	URB2	99	61.702	ENSAPEG00000005263	urb2	91	61.702	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000010968	URB2	99	62.411	ENSATEG00000020930	urb2	95	62.411	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000010968	URB2	97	50.766	ENSAPLG00000002998	URB2	95	70.423	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000010968	URB2	100	49.035	ENSACAG00000001285	URB2	95	64.789	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000010968	URB2	100	96.520	ENSANAG00000033963	URB2	100	96.520	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000010968	URB2	88	61.429	ENSACLG00000009254	urb2	89	61.429	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010968	URB2	100	56.338	ENSAMXG00000003474	urb2	97	56.338	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	79.286	ENSBTAG00000010180	URB2	95	79.286	Bos_taurus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	87.234	ENSCAFG00000012118	URB2	100	82.415	Canis_familiaris
ENSCJAG00000010968	URB2	93	87.234	ENSCAFG00020027217	URB2	99	81.601	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000010968	URB2	99	77.143	ENSCHIG00000014513	URB2	99	73.736	Capra_hircus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	83.585	ENSTSYG00000006924	URB2	95	90.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000010968	URB2	64	83.642	ENSCPOG00000020777	-	100	80.460	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	96.783	ENSCCAG00000023932	URB2	100	96.783	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.454	ENSCATG00000043366	URB2	100	92.651	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000010968	URB2	100	77.297	ENSCLAG00000006268	URB2	95	86.525	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.323	ENSCSAG00000010599	URB2	100	92.520	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000010968	URB2	69	82.177	ENSCHOG00000010163	URB2	71	82.177	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000010968	URB2	100	75.352	ENSCPBG00000006191	URB2	97	75.352	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000010968	URB2	100	95.745	ENSCANG00000023711	URB2	100	92.913	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	73.805	ENSCGRG00001009591	Urb2	95	83.688	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000010968	URB2	100	73.805	ENSCGRG00000011259	Urb2	95	83.688	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000010968	URB2	99	56.643	ENSCSEG00000000299	urb2	96	56.643	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000010968	URB2	99	55.195	ENSCVAG00000011011	urb2	96	55.195	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	58.741	ENSDARG00000003217	urb2	99	61.165	Danio_rerio
ENSCJAG00000010968	URB2	97	59.987	ENSDNOG00000043064	URB2	94	75.714	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	76.131	ENSDORG00000014975	Urb2	95	82.979	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000010968	URB2	91	84.375	ENSETEG00000002869	URB2	90	84.375	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000010968	URB2	99	81.812	ENSEASG00005012060	URB2	95	88.571	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	82.009	ENSECAG00000012338	URB2	99	87.943	Equus_caballus
ENSCJAG00000010968	URB2	97	81.560	ENSEEUG00000002669	URB2	92	81.560	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000010968	URB2	98	65.546	ENSELUG00000014647	urb2	95	62.937	Esox_lucius
ENSCJAG00000010968	URB2	100	79.659	ENSFCAG00000007662	URB2	95	87.234	Felis_catus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	69.014	ENSFALG00000003385	URB2	97	69.014	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000010968	URB2	100	76.509	ENSFDAG00000021079	URB2	95	84.397	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.140	ENSFHEG00000010357	urb2	95	60.140	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000010968	URB2	91	56.429	ENSGMOG00000012459	urb2	95	56.429	Gadus_morhua
ENSCJAG00000010968	URB2	100	51.480	ENSGALG00000011101	URB2	95	68.696	Gallus_gallus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	62.411	ENSGACG00000016179	urb2	95	62.411	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	73.944	ENSGAGG00000021879	URB2	95	76.923	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.454	ENSGGOG00000025643	URB2	100	92.454	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000010968	URB2	99	61.429	ENSHBUG00000018469	urb2	95	61.429	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000010968	URB2	97	77.680	ENSHGLG00000016561	URB2	93	86.525	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000010968	URB2	100	75.787	ENSHGLG00100001838	URB2	95	86.525	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000010968	URB2	99	36.761	ENSIPUG00000020315	urb2	95	58.741	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	82.979	ENSSTOG00000025323	URB2	95	82.979	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	75.098	ENSJJAG00000011998	Urb2	95	82.270	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	58.042	ENSKMAG00000020129	urb2	95	58.042	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	46.907	ENSLACG00000002038	URB2	97	64.583	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000010968	URB2	100	57.639	ENSLOCG00000015462	urb2	95	57.639	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	78.135	ENSLAFG00000012484	URB2	95	86.429	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.192	ENSMFAG00000039905	URB2	100	92.388	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.323	ENSMMUG00000009509	URB2	100	92.520	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.388	ENSMNEG00000038762	URB2	100	92.585	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.388	ENSMLEG00000043252	URB2	100	92.585	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	62.411	ENSMAMG00000020365	urb2	95	62.411	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.714	ENSMZEG00005011027	urb2	91	60.714	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000010968	URB2	94	48.489	ENSMGAG00000012073	URB2	95	69.014	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000010968	URB2	95	82.979	ENSMAUG00000017980	Urb2	100	82.979	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	84.110	ENSMICG00000033302	URB2	95	89.286	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	72.364	ENSMOCG00000020369	Urb2	95	85.106	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.839	ENSMALG00000006529	urb2	95	60.839	Monopterus_albus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	71.270	ENSMUSG00000031976	Urb2	95	81.560	Mus_musculus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	80.762	ENSMPUG00000012438	URB2	95	88.652	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000010968	URB2	99	82.270	ENSNGAG00000016524	Urb2	95	82.270	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.192	ENSNLEG00000014450	URB2	100	92.454	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000010968	URB2	87	76.923	ENSMEUG00000016434	URB2	89	76.923	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000010968	URB2	92	87.143	ENSOPRG00000009906	URB2	87	87.143	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000010968	URB2	100	76.378	ENSODEG00000005593	URB2	95	85.106	Octodon_degus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	61.429	ENSONIG00000017078	urb2	95	61.429	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	75.352	ENSOANG00000013732	URB2	94	75.352	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	85.714	ENSOCUG00000010700	URB2	99	81.944	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	57.343	ENSORLG00000010915	urb2	95	57.343	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000010968	URB2	99	57.343	ENSORLG00020003361	urb2	95	57.343	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000010968	URB2	99	57.343	ENSORLG00015001534	urb2	95	57.343	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000010968	URB2	99	58.865	ENSOMEG00000010076	urb2	95	58.865	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000010968	URB2	99	80.249	ENSOGAG00000003021	URB2	95	90.000	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000010968	URB2	99	77.143	ENSOARG00000003102	URB2	99	73.539	Ovis_aries
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.782	ENSPPAG00000040629	URB2	100	92.782	Pan_paniscus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	79.462	ENSPPRG00000012767	URB2	95	86.525	Panthera_pardus
ENSCJAG00000010968	URB2	96	88.636	ENSPTIG00000012577	URB2	100	88.636	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000010968	URB2	100	92.717	ENSPTRG00000002092	URB2	100	92.717	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000010968	URB2	100	89.895	ENSPANG00000002245	URB2	100	90.092	Papio_anubis
ENSCJAG00000010968	URB2	100	64.336	ENSPKIG00000005787	urb2	95	65.734	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000010968	URB2	100	54.249	ENSPSIG00000002690	URB2	97	73.239	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000010968	URB2	96	73.461	ENSPEMG00000019551	Urb2	94	84.211	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000010968	URB2	100	63.874	ENSPCIG00000030071	URB2	95	78.723	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	55.705	ENSPFOG00000014330	urb2	95	55.705	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000010968	URB2	99	55.705	ENSPLAG00000014654	urb2	95	55.705	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000010968	URB2	99	55.034	ENSPMEG00000012356	urb2	95	55.705	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000010968	URB2	99	56.291	ENSPREG00000010268	urb2	95	56.291	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000010968	URB2	99	92.055	ENSPPYG00000000123	URB2	99	92.318	Pongo_abelii
ENSCJAG00000010968	URB2	99	85.489	ENSPCOG00000023537	URB2	99	85.686	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000010968	URB2	100	65.291	ENSPVAG00000002108	URB2	100	65.203	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000010968	URB2	88	61.429	ENSPNYG00000016840	urb2	89	61.429	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000010968	URB2	100	57.042	ENSPNAG00000013684	urb2	95	57.042	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000010968	URB2	100	72.418	ENSRNOG00000026853	Urb2	92	82.979	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000010968	URB2	100	91.929	ENSRBIG00000037937	URB2	100	92.192	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000010968	URB2	100	91.798	ENSRROG00000039854	URB2	100	92.060	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000010968	URB2	100	95.995	ENSSBOG00000023055	URB2	100	95.995	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000010968	URB2	100	64.398	ENSSHAG00000014735	URB2	95	78.014	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000010968	URB2	98	62.937	ENSSFOG00015015432	urb2	93	62.937	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000010968	URB2	89	59.859	ENSSMAG00000004984	urb2	90	59.859	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.839	ENSSDUG00000000902	urb2	95	60.839	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000010968	URB2	100	53.910	ENSSPUG00000018549	URB2	95	73.239	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	62.411	ENSSPAG00000013632	urb2	95	62.411	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	75.115	ENSSSCG00000010186	URB2	99	75.115	Sus_scrofa
ENSCJAG00000010968	URB2	100	66.901	ENSTGUG00000009990	URB2	95	66.901	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000010968	URB2	99	62.411	ENSTRUG00000008173	urb2	95	62.411	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.993	ENSTNIG00000017689	urb2	95	60.993	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000010968	URB2	99	83.571	ENSTTRG00000014864	URB2	97	83.571	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	83.125	ENSUAMG00000015022	URB2	95	87.857	Ursus_americanus
ENSCJAG00000010968	URB2	99	83.125	ENSUMAG00000004728	URB2	95	87.857	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000010968	URB2	66	86.429	ENSVPAG00000001750	-	63	86.429	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000010968	URB2	100	87.943	ENSVVUG00000006747	URB2	95	87.943	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000010968	URB2	100	61.111	ENSXETG00000023331	urb2	95	61.111	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000010968	URB2	99	56.291	ENSXMAG00000015059	urb2	95	56.291	Xiphophorus_maculatus