EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000010972 (Gene tree)
Gene ID: 100387849
Gene Symbol: PUSL1
Alias: FLJ90811
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2761 bases
Position: chrNTIC01036611.1:118354759-118357519
Accession: 100387849
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000020257	PseudoU_synth_1	PF01416.20	3.7e-35	1	2
ENSCJAP00000020257	PseudoU_synth_1	PF01416.20	3.7e-35	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000021401	PUSL1-201	1215	XM_017974224	ENSCJAP00000020257	303 (aa)	XP_017829713	F7EEK5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSCJAG00000010972	PUSL1	89	47.794	ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	90	50.725	ENSAOCG00000019419	pusl1	82	50.725	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000010972	PUSL1	93	49.825	ENSAPEG00000005452	pusl1	93	50.357	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	50.714	ENSATEG00000024154	pusl1	93	50.714	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	94	54.325	ENSAPLG00000004946	PUSL1	96	54.325	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000010972	PUSL1	84	54.297	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	54.297	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000010972	PUSL1	100	97.690	ENSANAG00000037456	PUSL1	100	97.690	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000010972	PUSL1	92	49.822	ENSACLG00000008675	pusl1	93	49.822	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000010972	PUSL1	93	48.936	ENSAMXG00000044007	pusl1	96	48.936	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	94	85.211	ENSBTAG00000007619	PUSL1	98	85.211	Bos_taurus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	99	79.070	ENSCAFG00000019291	PUSL1	99	79.070	Canis_familiaris
ENSCJAG00000010972	PUSL1	94	83.803	ENSCAFG00020011568	PUSL1	93	83.803	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000010972	PUSL1	93	86.477	ENSCHIG00000012615	PUSL1	98	86.477	Capra_hircus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	98	80.602	ENSCPOG00000005149	PUSL1	97	80.602	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	100	98.350	ENSCCAG00000027475	PUSL1	100	98.350	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	100	92.409	ENSCATG00000018260	PUSL1	100	92.409	Cercocebus_atys
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ENSCJAG00000010972	PUSL1	95	76.976	ENSEEUG00000000837	PUSL1	98	76.976	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	50.538	ENSELUG00000015945	pusl1	95	50.538	Esox_lucius
ENSCJAG00000010972	PUSL1	99	84.000	ENSFCAG00000007617	PUSL1	99	84.000	Felis_catus
ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	53.214	ENSFHEG00000006370	pusl1	93	53.214	Fundulus_heteroclitus
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ENSCJAG00000010972	PUSL1	90	51.812	ENSGAFG00000007546	pusl1	93	51.812	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	48.754	ENSGACG00000007848	pusl1	92	48.754	Gasterosteus_aculeatus
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ENSCJAG00000010972	PUSL1	91	49.643	ENSHBUG00000001264	pusl1	93	49.643	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000010972	PUSL1	100	79.479	ENSHGLG00000017570	PUSL1	100	79.479	Heterocephalus_glaber_female
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ENSCJAG00000010972	PUSL1	90	50.730	ENSHCOG00000010077	pusl1	99	50.730	Hippocampus_comes
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