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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000011318 (Gene tree)
Gene ID: 100389255
Gene Symbol: CNOT1
Alias: AD-005|CDC39|KIAA1007|NOT1|NOT1H
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 71431 bases
Position: chrNTIC01014446.1:29853187-29924617
Accession: 100389255
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000021192	Not1	PF04054.15	1.4e-152	1	1
ENSCJAP00000020903	Not1	PF04054.15	3.4e-140	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000022407	CNOT1-201	7131	XM_002761022	ENSCJAP00000021192	2376 (aa)	XP_002761068	U3FG51
ENSCJAT00000071434	CNOT1-202	291	-	ENSCJAP00000066670	96 (aa)	-	A0A2R8MY31
ENSCJAT00000022097	CNOT1-203	1635	-	ENSCJAP00000020903	544 (aa)	-	F7HBC7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03018	RNA degradation	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.874	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	96.914	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	96.914	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.453	ENSAMEG00000017298	CNOT1	100	99.453	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	90.182	ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.214	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.545	ENSAOCG00000002859	cnot1	100	96.000	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.545	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	90.386	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	97.055	ENSATEG00000012892	cnot1	100	97.055	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.605	ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	97.605	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000011318	CNOT1	91	96.150	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	96.104	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	96.984	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	96.984	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	97.055	ENSACLG00000014234	cnot1	100	97.055	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.364	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	91.379	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.705	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	99.705	Bos_taurus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	98	49.545	WBGene00002845	let-711	92	54.430	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.370	ENSCAFG00000008426	CNOT1	100	99.370	Canis_familiaris
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	98.616	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	99.259	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.705	ENSCHIG00000010452	CNOT1	100	99.705	Capra_hircus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.832	ENSTSYG00000006888	CNOT1	100	99.832	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000011318	CNOT1	96	72.243	ENSCAPG00000007848	-	99	77.250	Cavia_aperea
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	94.992	ENSCPOG00000013026	CNOT1	100	94.992	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	98.274	ENSCCAG00000026333	CNOT1	100	98.274	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.916	ENSCATG00000032625	CNOT1	100	99.916	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.621	ENSCLAG00000006289	CNOT1	100	99.621	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.916	ENSCSAG00000004731	CNOT1	100	99.916	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	81	100.000	ENSCHOG00000009712	CNOT1	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	94.364	ENSCPBG00000026222	CNOT1	99	98.611	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	77.677	ENSCING00000009149	-	100	58.699	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	99	78.269	ENSCSAVG00000002414	-	95	78.808	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.785	ENSCANG00000040534	CNOT1	100	97.785	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.285	ENSCGRG00001016365	Cnot1	100	99.285	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.285	ENSCGRG00000001714	Cnot1	100	99.285	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	89.892	ENSCSEG00000021493	cnot1	100	93.727	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.182	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	82.902	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.000	ENSDARG00000004174	cnot1	100	89.774	Danio_rerio
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.139	ENSDNOG00000013250	CNOT1	100	97.139	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	94.545	ENSDORG00000002101	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000011318	CNOT1	99	62.162	FBgn0085436	Not1	99	48.364	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	91.636	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	97.590	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	71.091	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	76.831	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	95.888	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	98.802	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.747	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	99.813	Equus_caballus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	94.182	ENSEEUG00000006015	CNOT1	90	99.295	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.096	ENSELUG00000014085	cnot1	100	89.376	Esox_lucius
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.454	ENSFCAG00000025155	CNOT1	100	99.454	Felis_catus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.643	ENSFALG00000007285	CNOT1	100	97.643	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.537	ENSFDAG00000013399	CNOT1	100	99.537	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	91.818	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.256	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	91	89.496	ENSGMOG00000012864	cnot1	100	89.866	Gadus_morhua
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.685	ENSGALG00000002301	CNOT1	100	97.685	Gallus_gallus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.000	ENSGAFG00000015005	cnot1	100	89.085	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.364	ENSGACG00000002606	cnot1	100	95.752	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.854	ENSGAGG00000022646	CNOT1	100	97.854	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.832	ENSGGOG00000009547	CNOT1	100	99.832	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	97.055	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	97.055	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.453	ENSHGLG00000014322	CNOT1	100	99.453	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	91.289	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	89.478	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	90.664	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	89.220	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.537	ENSSTOG00000005490	CNOT1	100	99.537	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	98.948	ENSJJAG00000000633	Cnot1	100	98.948	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.364	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	90.008	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	95	96.407	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	96.407	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	95.034	ENSLACG00000010869	CNOT1	100	95.034	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.911	ENSLOCG00000006324	cnot1	100	92.911	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.495	ENSLAFG00000000098	CNOT1	100	99.495	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.663	ENSMFAG00000035888	CNOT1	100	99.663	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.874	ENSMMUG00000014625	CNOT1	100	99.874	Macaca_mulatta
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ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	98.485	ENSMLEG00000040933	CNOT1	100	98.485	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	90.364	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	89.127	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	97.055	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	97.055	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.433	ENSMGAG00000001908	CNOT1	100	97.433	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	94.545	ENSMAUG00000009731	-	99	99.877	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.537	ENSMICG00000007071	CNOT1	100	99.537	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.327	ENSMOCG00000017969	Cnot1	100	99.327	Microtus_ochrogaster
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ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	97.854	ENSMODG00000014199	CNOT1	100	97.854	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.364	ENSMALG00000008645	cnot1	100	90.172	Monopterus_albus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	95	99.889	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	99.889	Mus_caroli
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.369	ENSMUSG00000036550	Cnot1	100	99.369	Mus_musculus
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ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.369	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	100	99.369	Mus_spretus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.747	ENSMPUG00000004830	CNOT1	100	99.747	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.074	ENSMLUG00000003728	CNOT1	100	99.074	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.579	ENSNGAG00000018628	Cnot1	100	99.579	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.545	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	97.055	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.790	ENSNLEG00000003566	CNOT1	100	99.790	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000011318	CNOT1	86	98.658	ENSMEUG00000006145	CNOT1	87	98.658	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000011318	CNOT1	86	100.000	ENSOPRG00000005604	CNOT1	86	100.000	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.495	ENSODEG00000016337	CNOT1	100	99.495	Octodon_degus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.545	ENSONIG00000007358	cnot1	100	90.088	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	94.000	ENSOANG00000012109	CNOT1	100	98.307	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.663	ENSOCUG00000006911	CNOT1	100	99.663	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.364	ENSORLG00000013734	cnot1	100	90.310	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	88.786	ENSORLG00020017012	cnot1	100	88.465	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	88.702	ENSORLG00015007091	cnot1	100	88.213	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	88.040	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	88.329	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.579	ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	99.579	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.705	ENSOARG00000001567	CNOT1	100	99.705	Ovis_aries
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.874	ENSPPAG00000022013	CNOT1	100	99.874	Pan_paniscus
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ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.747	ENSPTIG00000012589	CNOT1	100	99.747	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	99.580	ENSPTRG00000008183	CNOT1	100	99.580	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	96.354	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	96.354	Papio_anubis
ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	92.545	ENSPKIG00000023538	CNOT1	100	92.195	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000011318	CNOT1	97	93.258	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	93.258	Paramormyrops_kingsleyae
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