EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000012225 (Gene tree)
Gene ID: 100403142
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35323 bases
Position: chrNTIC01000001.1:4041162-4076484
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSCJAP00000050985	Paf67	PF10255.9	2.6e-103	2	2
ENSCJAP00000022654	Paf67	PF10255.9	6.3e-103	1	2
ENSCJAP00000022654	Paf67	PF10255.9	6.3e-103	2	2
ENSCJAP00000044618	Paf67	PF10255.9	1.9e-75	1	2
ENSCJAP00000044618	Paf67	PF10255.9	1.9e-75	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSCJAT00000023966	-	1554	-	ENSCJAP00000022654	517 (aa)	-	F7HN32
ENSCJAT00000060680	-	1131	-	ENSCJAP00000050985	376 (aa)	-	F6SZJ6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSCJAG00000012225	-	87	100.000	ENSAMEG00000010267	EIF3L	74	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000012225	-	80	99.010	ENSACIG00000004431	eif3s6ip	68	98.039	Amphilophus_citrinellus
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ENSCJAG00000012225	-	82	99.010	ENSAPEG00000024616	eif3s6ip	69	99.010	Amphiprion_percula
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ENSCJAG00000012225	-	78	100.000	ENSAPLG00000015281	EIF3L	71	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000012225	-	78	100.000	ENSACAG00000015371	EIF3L	69	100.000	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000012225	-	87	100.000	ENSANAG00000028227	-	74	100.000	Aotus_nancymaae
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ENSCJAG00000012225	-	81	96.190	ENSANAG00000020611	-	79	96.190	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000012225	-	82	99.010	ENSACLG00000021594	eif3s6ip	70	98.039	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000012225	-	81	99.010	ENSAMXG00000003073	eif3s6ip	69	98.039	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000012225	-	84	100.000	ENSBTAG00000010790	EIF3L	72	100.000	Bos_taurus
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ENSCJAG00000012225	-	87	100.000	ENSCAFG00020003202	-	73	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000012225	-	59	100.000	ENSCAFG00020021941	-	65	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000012225	-	84	98.095	ENSCAFG00020004232	-	72	99.007	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000012225	-	84	100.000	ENSCHIG00000014325	EIF3L	72	100.000	Capra_hircus
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ENSCJAG00000012225	-	85	99.048	ENSCCAG00000034054	-	73	99.048	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000012225	-	87	100.000	ENSCATG00000037073	EIF3L	74	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000012225	-	84	100.000	ENSCLAG00000016779	EIF3L	72	100.000	Chinchilla_lanigera
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ENSCJAG00000012225	-	84	100.000	ENSCPBG00000023050	EIF3L	72	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000012225	-	74	74.176	ENSCING00000014830	-	67	62.791	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000012225	-	74	73.077	ENSCSAVG00000009201	-	66	61.620	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000012225	-	87	100.000	ENSCANG00000035707	EIF3L	72	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000012225	-	56	75.758	ENSCANG00000018914	-	55	75.758	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000012225	-	84	100.000	ENSCGRG00001020655	Eif3l	72	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000012225	-	84	100.000	ENSCGRG00000014127	Eif3l	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000012225	-	82	97.059	ENSCSEG00000017526	eif3s6ip	69	97.059	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000012225	-	82	99.010	ENSCVAG00000001269	eif3s6ip	69	99.010	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000012225	-	83	98.020	ENSDARG00000101082	eif3s6ip	70	98.020	Danio_rerio
ENSCJAG00000012225	-	57	100.000	ENSDORG00000009478	Eif3l	57	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000012225	-	83	61.321	FBgn0036258	eIF3l	70	61.321	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000012225	-	67	99.194	ENSETEG00000006051	EIF3L	66	87.850	Echinops_telfairi
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ENSCJAG00000012225	-	70	100.000	ENSEASG00005018809	EIF3L	59	100.000	Equus_asinus_asinus
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ENSCJAG00000012225	-	82	99.010	ENSOMEG00000017565	eif3s6ip	69	98.039	Oryzias_melastigma
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