EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000012349 (Gene tree)
Gene ID: 100391578
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 44654 bases
Position: chrNTIC01034389.1:79126365-79171018
Accession: 100391578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000022968	GTP_EFTU	PF00009.27	4.3e-45	1	1
ENSCJAP00000022955	GTP_EFTU	PF00009.27	3.3e-36	1	1
ENSCJAP00000022941	GTP_EFTU	PF00009.27	1.2e-33	1	1
ENSCJAP00000022941	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSCJAP00000022955	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSCJAP00000022968	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSCJAP00000022955	EFG_IV	PF03764.18	3.2e-23	1	1
ENSCJAP00000022941	EFG_IV	PF03764.18	3.2e-23	1	1
ENSCJAP00000022968	EFG_IV	PF03764.18	3.3e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000024303	EFTUD2-201	2923	-	ENSCJAP00000022968	972 (aa)	XP_002748128	F7I888
ENSCJAT00000024291	EFTUD2-203	2874	-	ENSCJAP00000022955	957 (aa)	-	F7IAM1
ENSCJAT00000024273	EFTUD2-202	2880	-	ENSCJAP00000022941	959 (aa)	-	F7ICX2

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000012349's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000012349's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	87	39.061	ENSCJAG00000015045	EEF2	99	39.061
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	69	37.255	ENSCJAG00000015607	-	72	37.255
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	50	33.333	ENSCJAG00000000363	GFM1	60	31.944
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	53	40.449	ENSCJAG00000016802	GFM2	61	40.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	89.512	ENSACIG00000009096	eftud2	100	89.304	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	88	87.277	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.383	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.691	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	94.754	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	91	83.200	ENSMOCG00000017653	-	90	83.200	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	88	93.103	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	88	91.439	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	98.193	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	95.988	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.737	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.737	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	100.000	Papio_anubis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.691	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.691	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.957	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.957	Pongo_abelii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	95.679	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	Procavia_capensis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	99.680	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.152	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	87.216	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.010	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	94.342	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus