EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000012434 (Gene tree)
Gene ID: 100409888
Gene Symbol: REXO2
Alias: CGI-114|DKFZP566E144|SFN
Full Name: RNA exonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11377 bases
Position: chrNTIC01001113.1:11953873-11965249
Accession: 100409888
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000050425	RNase_T	PF00929.24	1e-32	1	1
ENSCJAP00000053148	RNase_T	PF00929.24	1.7e-11	1	1
ENSCJAP00000061344	RNase_T	PF00929.24	1e-07	1	1
ENSCJAP00000044887	RNase_T	PF00929.24	5.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000059783	REXO2-201	1476	-	ENSCJAP00000050425	237 (aa)	XP_002754546	F7HJH7
ENSCJAT00000074131	REXO2-203	366	-	ENSCJAP00000053148	121 (aa)	-	A0A2R8M3H2
ENSCJAT00000055734	REXO2-202	240	-	ENSCJAP00000044887	80 (aa)	-	F7HGC4
ENSCJAT00000070906	REXO2-204	258	-	ENSCJAP00000061344	86 (aa)	-	A0A2R8PDH6

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000012434's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000012434's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000012434	REXO2	72	78.161	ENSCJAG00000044911	-	93	78.161

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSG00000076043	REXO2	100	98.507	Homo_sapiens
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSAMEG00000013263	REXO2	100	96.624	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000012434	REXO2	76	80.110	ENSACIG00000023553	smfn	97	80.110	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000012434	REXO2	69	58.140	ENSAOCG00000018799	-	64	58.140	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000012434	REXO2	54	75.194	ENSAOCG00000011565	smfn	79	75.194	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000012434	REXO2	81	80.311	ENSAPEG00000012435	smfn	71	80.311	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000012434	REXO2	96	72.247	ENSATEG00000015385	smfn	81	72.247	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000012434	REXO2	86	83.902	ENSAPLG00000005045	REXO2	99	83.654	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000012434	REXO2	90	66.822	ENSACAG00000011631	REXO2	92	68.447	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	99.174	ENSANAG00000020834	REXO2	100	99.174	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000012434	REXO2	61	72.917	ENSANAG00000027457	-	99	69.444	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	71.366	ENSACLG00000024566	smfn	98	78.191	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSBTAG00000005843	REXO2	100	96.624	Bos_taurus
ENSCJAG00000012434	REXO2	77	45.902	WBGene00007429	C08B6.8	88	55.072	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSCAFG00000013511	REXO2	100	96.624	Canis_familiaris
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.468	ENSCAFG00020002513	REXO2	100	97.468	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSCHIG00000009264	REXO2	100	97.046	Capra_hircus
ENSCJAG00000012434	REXO2	82	85.128	ENSTSYG00000027948	-	100	85.128	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.203	ENSTSYG00000002237	REXO2	100	96.203	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	98.404	ENSCAPG00000006093	REXO2	100	98.404	Cavia_aperea
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSCPOG00000010548	REXO2	100	97.046	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.890	ENSCCAG00000034979	REXO2	100	97.890	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSCATG00000015278	REXO2	100	97.046	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.203	ENSCLAG00000011195	REXO2	100	96.203	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSCSAG00000002754	REXO2	100	96.624	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	94.515	ENSCHOG00000000642	-	100	94.515	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	91.250	ENSCHOG00000013497	REXO2	100	96.429	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000012434	REXO2	61	88.276	ENSCPBG00000009359	REXO2	100	88.276	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000012434	REXO2	80	56.842	ENSCING00000009858	-	87	58.564	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSCANG00000034756	REXO2	100	97.046	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	86	95.610	ENSCGRG00001010922	-	100	95.610	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.359	ENSCGRG00001019814	-	100	95.359	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000012434	REXO2	86	96.098	ENSCGRG00001013673	-	100	96.098	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.359	ENSCGRG00000006235	Rexo2	100	95.359	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000012434	REXO2	81	81.250	ENSCSEG00000007214	smfn	71	79.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000012434	REXO2	77	78.689	ENSCVAG00000012008	smfn	99	78.689	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	56	60.417	ENSCVAG00000012022	-	64	65.789	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	93	72.072	ENSDARG00000009806	smfn	85	71.171	Danio_rerio
ENSCJAG00000012434	REXO2	83	96.939	ENSDNOG00000046533	REXO2	100	95.897	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000012434	REXO2	97	70.563	ENSDORG00000025142	-	97	72.174	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSDORG00000011255	Rexo2	100	96.624	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000012434	REXO2	87	48.309	FBgn0039115	CG10214	98	48.058	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000012434	REXO2	93	69.091	ENSEBUG00000013964	REXO2	72	70.233	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.781	ENSEASG00005006674	REXO2	100	95.781	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.781	ENSECAG00000005988	REXO2	100	95.781	Equus_caballus
ENSCJAG00000012434	REXO2	84	78.788	ENSELUG00000020072	smfn	69	78.788	Esox_lucius
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.468	ENSFCAG00000018632	REXO2	100	97.468	Felis_catus
ENSCJAG00000012434	REXO2	80	88.360	ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.360	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSFDAG00000011764	REXO2	100	97.046	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000012434	REXO2	76	56.522	ENSFHEG00000022493	-	75	54.082	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	78.723	ENSGMOG00000006370	smfn	94	81.215	Gadus_morhua
ENSCJAG00000012434	REXO2	83	91.371	ENSGALG00000035980	REXO2	99	83.262	Gallus_gallus
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	76.617	ENSGAFG00000015349	smfn	71	77.000	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000012434	REXO2	80	77.249	ENSGACG00000020096	smfn	87	79.545	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	94	84.444	ENSGAGG00000021126	REXO2	97	84.444	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.521	ENSGGOG00000023267	REXO2	100	97.521	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	50.220	ENSHBUG00000020097	REXO2	62	74.803	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	94.937	ENSHGLG00000013556	REXO2	100	94.937	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.359	ENSHGLG00100005257	REXO2	100	95.359	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000012434	REXO2	76	76.111	ENSHCOG00000007122	smfn	93	78.916	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000012434	REXO2	84	80.808	ENSIPUG00000020440	rexo2	74	80.000	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSSTOG00000012465	REXO2	100	97.046	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.890	ENSJJAG00000013710	-	100	97.890	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000012434	REXO2	99	82.278	ENSJJAG00000022605	-	100	69.198	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000012434	REXO2	81	79.688	ENSKMAG00000016795	smfn	80	70.089	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	77.249	ENSLBEG00000006021	smfn	100	77.249	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000012434	REXO2	97	67.227	ENSLACG00000018623	REXO2	97	66.807	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	82.673	ENSLOCG00000002389	smfn	96	82.673	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	94.093	ENSLAFG00000012451	REXO2	100	94.093	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSMFAG00000041155	REXO2	100	97.046	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSMMUG00000012269	REXO2	100	97.046	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSMNEG00000033379	REXO2	100	97.046	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSMLEG00000036571	REXO2	100	97.046	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000012434	REXO2	96	72.687	ENSMAMG00000021209	smfn	80	72.247	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	71.366	ENSMZEG00005020730	REXO2	82	71.366	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	71.366	ENSMZEG00005023224	-	82	71.366	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000012434	REXO2	68	88.344	ENSMGAG00000003026	REXO2	100	88.344	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.359	ENSMAUG00000014576	Rexo2	100	95.359	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSMICG00000010094	REXO2	100	97.046	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	94.937	ENSMOCG00000009016	Rexo2	100	94.937	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000012434	REXO2	81	79.793	ENSMMOG00000006430	smfn	72	79.793	Mola_mola
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	91.561	ENSMODG00000013913	REXO2	100	91.561	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	76.617	ENSMALG00000018130	smfn	57	76.617	Monopterus_albus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	93.249	MGP_CAROLIEiJ_G0032166	Rexo2	100	93.249	Mus_caroli
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	93.671	ENSMUSG00000032026	Rexo2	100	93.671	Mus_musculus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	93.671	MGP_PahariEiJ_G0015034	Rexo2	100	93.671	Mus_pahari
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	93.671	MGP_SPRETEiJ_G0033305	Rexo2	100	93.671	Mus_spretus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSMPUG00000003947	REXO2	100	96.624	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSMLUG00000009030	REXO2	100	96.624	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000012434	REXO2	86	98.537	ENSNGAG00000008819	Rexo2	100	98.537	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000012434	REXO2	77	79.121	ENSNBRG00000006529	smfn	96	79.121	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000012434	REXO2	91	60.526	ENSNBRG00000015319	-	78	66.019	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.521	ENSNLEG00000029745	REXO2	100	97.521	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000012434	REXO2	92	94.064	ENSMEUG00000011558	REXO2	100	94.064	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	73.418	ENSOPRG00000011076	REXO2	100	73.418	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	98.936	ENSODEG00000009750	-	100	98.936	Octodon_degus
ENSCJAG00000012434	REXO2	82	75.897	ENSODEG00000016046	-	98	75.897	Octodon_degus
ENSCJAG00000012434	REXO2	94	86.667	ENSODEG00000009698	-	96	78.689	Octodon_degus
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	72.687	ENSONIG00000001954	smfn	92	72.687	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000012434	REXO2	87	94.175	ENSOANG00000001754	REXO2	100	87.448	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.624	ENSOCUG00000004274	REXO2	95	96.624	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000012434	REXO2	87	80.097	ENSORLG00000005119	smfn	67	80.097	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000012434	REXO2	87	80.097	ENSORLG00020010121	smfn	67	80.097	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000012434	REXO2	87	79.612	ENSORLG00015015699	smfn	66	79.612	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000012434	REXO2	60	74.648	ENSOMEG00000008940	-	99	74.648	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000012434	REXO2	87	76.214	ENSOMEG00000016878	REXO2	76	76.214	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.468	ENSOGAG00000016860	REXO2	100	97.468	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000012434	REXO2	88	96.651	ENSOARG00000001040	REXO2	98	96.651	Ovis_aries
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSPPAG00000039849	REXO2	100	97.046	Pan_paniscus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.468	ENSPPRG00000007255	REXO2	100	97.468	Panthera_pardus
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	98.404	ENSPTIG00000015578	REXO2	100	98.404	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSPTRG00000004306	REXO2	100	97.046	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSPANG00000010675	REXO2	100	97.046	Papio_anubis
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	81.188	ENSPKIG00000000911	smfn	77	85.135	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000012434	REXO2	84	91.500	ENSPSIG00000005151	REXO2	81	85.837	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	80.319	ENSPMGG00000007442	smfn	100	80.319	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	80.169	ENSPEMG00000001421	Rexo2	100	80.169	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	90.717	ENSPCIG00000011227	REXO2	63	90.717	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	78.109	ENSPFOG00000017861	smfn	99	78.500	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000012434	REXO2	75	76.404	ENSPLAG00000007327	REXO2	68	76.404	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	78.109	ENSPMEG00000017343	smfn	72	78.109	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	77.114	ENSPREG00000016438	smfn	72	77.114	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.468	ENSPPYG00000003895	REXO2	100	97.468	Pongo_abelii
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	94.937	ENSPCAG00000005237	REXO2	100	94.937	Procavia_capensis
ENSCJAG00000012434	REXO2	99	89.873	ENSPCOG00000027639	REXO2	100	96.410	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	85.774	ENSPVAG00000005295	REXO2	100	85.774	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	70.925	ENSPNYG00000018401	smfn	82	70.925	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000012434	REXO2	82	82.564	ENSPNAG00000005290	smfn	79	77.209	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	94.093	ENSRNOG00000018939	Rexo2	100	94.093	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSRBIG00000037809	REXO2	100	97.046	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSRROG00000038928	REXO2	100	97.046	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000012434	REXO2	73	43.956	YLR059C	REX2	67	44.134	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	99.174	ENSSBOG00000028651	REXO2	100	99.174	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000012434	REXO2	99	91.064	ENSSHAG00000008008	REXO2	100	91.064	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	81.283	ENSSFOG00015022414	smfn	99	81.283	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000012434	REXO2	98	69.957	ENSSMAG00000003168	smfn	85	69.957	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000012434	REXO2	93	74.091	ENSSDUG00000015624	smfn	77	74.091	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000012434	REXO2	93	75.909	ENSSLDG00000014005	smfn	71	79.310	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000012434	REXO2	54	99.213	ENSSARG00000014530	REXO2	100	99.213	Sorex_araneus
ENSCJAG00000012434	REXO2	67	86.792	ENSSPUG00000006005	REXO2	85	86.792	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	76	81.768	ENSSPAG00000001530	smfn	97	81.768	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.203	ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.203	Sus_scrofa
ENSCJAG00000012434	REXO2	84	87.940	ENSTGUG00000000121	REXO2	99	80.591	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000012434	REXO2	82	77.320	ENSTRUG00000021529	smfn	82	69.196	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000012434	REXO2	80	81.053	ENSTNIG00000008588	smfn	97	72.727	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSTBEG00000017040	REXO2	100	97.046	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	95.781	ENSTTRG00000014928	REXO2	100	95.781	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.694	ENSUAMG00000019096	REXO2	100	97.436	Ursus_americanus
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSUMAG00000003770	REXO2	100	97.046	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000012434	REXO2	79	77.660	ENSVPAG00000006301	REXO2	100	77.660	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000012434	REXO2	100	97.046	ENSVVUG00000025223	REXO2	100	97.046	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000012434	REXO2	96	77.533	ENSXETG00000012648	rexo2	91	76.957	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000012434	REXO2	95	66.522	ENSXCOG00000018838	smfn	95	76.882	Xiphophorus_couchianus
ENSCJAG00000012434	REXO2	85	75.622	ENSXMAG00000021125	smfn	64	75.622	Xiphophorus_maculatus