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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000013024 (Gene tree)
Gene ID: 100411258
Gene Symbol: PPARGC1A
Alias: PGC-1alpha|PGC1|PGC1A|PPARGC1
Full Name: PPARG coactivator 1 alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 110304 bases
Position: chrNTIC01033278.1:139310748-139421051
Accession: 100411258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000023980	RRM_1	PF00076.22	3.3e-07	1	1
ENSCJAP00000047195	RRM_1	PF00076.22	3.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000025366	PPARGC1A-201	7062	-	ENSCJAP00000023980	795 (aa)	XP_008991777	F7EFK3
ENSCJAT00000052987	PPARGC1A-203	2094	-	ENSCJAP00000046572	697 (aa)	-	F7I1G0
ENSCJAT00000062131	PPARGC1A-205	804	-	ENSCJAP00000050855	267 (aa)	-	F7FMX6
ENSCJAT00000025329	PPARGC1A-204	894	-	ENSCJAP00000023944	297 (aa)	-	F7FLC8
ENSCJAT00000053193	PPARGC1A-202	7030	-	ENSCJAP00000047195	798 (aa)	XP_002745991	F7ISR8

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc04152	AMPK signaling pathway	KEGG
cjc04211	Longevity regulating pathway	KEGG
cjc04371	Apelin signaling pathway	KEGG
cjc04714	Thermogenesis	KEGG
cjc04910	Insulin signaling pathway	KEGG
cjc04920	Adipocytokine signaling pathway	KEGG
cjc04922	Glucagon signaling pathway	KEGG
cjc04931	Insulin resistance	KEGG
cjc05016	Huntington disease	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.997	ENSG00000109819	PPARGC1A	100	98.997	Homo_sapiens
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.908	ENSG00000155846	PPARGC1B	50	51.908	Homo_sapiens
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	72	81.152	ENSAPOG00000018632	ppargc1a	100	56.353	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	68	49.630	ENSAMEG00000005287	PPARGC1B	52	49.630	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.614	ENSAMEG00000010421	PPARGC1A	100	95.614	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	72	81.675	ENSAOCG00000006754	ppargc1a	100	56.671	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	72	70.925	ENSATEG00000016702	ppargc1a	100	55.193	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	88.095	ENSAPLG00000005303	PPARGC1A	100	88.095	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	69	49.265	ENSACAG00000015737	PPARGC1B	52	49.265	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	83.146	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	100	83.146	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	99.123	ENSANAG00000035930	PPARGC1A	100	99.123	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.908	ENSANAG00000021830	PPARGC1B	50	51.908	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	70	78.534	ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	70.796	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	96	69.397	ENSAMXG00000002461	ppargc1a	99	55.849	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.618	ENSBTAG00000017024	PPARGC1A	100	94.663	Bos_taurus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.990	ENSCAFG00000016519	PPARGC1A	100	95.990	Canis_familiaris
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	69	48.529	ENSCAFG00000018275	PPARGC1B	53	48.529	Canis_familiaris
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	97	96.114	ENSCAFG00020027242	PPARGC1A	99	96.114	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	55	48.980	ENSCAFG00020023524	PPARGC1B	51	48.529	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	57	47.826	ENSCHIG00000004409	PPARGC1B	53	47.794	Capra_hircus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.618	ENSCHIG00000015991	PPARGC1A	100	94.618	Capra_hircus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	66	48.092	ENSTSYG00000034354	PPARGC1B	53	48.092	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.496	ENSTSYG00000010439	PPARGC1A	100	98.496	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	97	92.198	ENSCAPG00000005150	PPARGC1A	96	92.198	Cavia_aperea
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	55	49.020	ENSCPOG00000001958	PPARGC1B	51	48.120	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.363	ENSCPOG00000001518	PPARGC1A	100	95.363	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.622	ENSCCAG00000024681	PPARGC1A	100	98.622	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	65	51.145	ENSCATG00000030402	PPARGC1B	50	51.145	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.872	ENSCATG00000032575	PPARGC1A	100	98.872	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.238	ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.238	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	66	49.630	ENSCLAG00000015452	PPARGC1B	51	49.630	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.872	ENSCSAG00000016575	PPARGC1A	100	98.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.908	ENSCSAG00000011792	PPARGC1B	52	51.908	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	61	50.000	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	60	50.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.908	ENSCANG00000037487	PPARGC1B	51	51.908	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.747	ENSCANG00000033426	PPARGC1A	100	98.747	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.361	ENSCGRG00001015534	Ppargc1a	100	94.361	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	56	52.128	ENSCGRG00001017949	Ppargc1b	53	46.753	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.361	ENSCGRG00000000200	Ppargc1a	100	94.361	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	55	52.128	ENSCGRG00000008387	Ppargc1b	52	48.905	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	74	77.949	ENSCSEG00000006884	ppargc1a	87	69.959	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	70	46.477	ENSCVAG00000016547	ppargc1a	73	47.951	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	62	40.984	ENSDARG00000101569	ppargc1b	54	40.984	Danio_rerio
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	87	80.791	ENSDARG00000067829	ppargc1a	99	48.140	Danio_rerio
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.489	ENSDNOG00000041106	PPARGC1A	100	95.489	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	99	94.784	ENSDORG00000016276	Ppargc1a	99	94.784	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	56	50.735	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	51	50.735	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	96.742	ENSEASG00005007984	PPARGC1A	100	96.742	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	99	96.320	ENSECAG00000009164	PPARGC1A	98	96.320	Equus_caballus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	98	90.653	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	100	88.860	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	51.394	ENSELUG00000017027	ppargc1a	100	51.947	Esox_lucius
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.489	ENSFCAG00000000043	PPARGC1A	100	95.489	Felis_catus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	58	48.921	ENSFALG00000008858	PPARGC1B	56	48.921	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	98	86.812	ENSFALG00000009211	PPARGC1A	99	86.812	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.862	ENSFDAG00000005659	PPARGC1A	100	94.862	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	55	49.505	ENSFDAG00000008719	PPARGC1B	53	48.855	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	53.373	ENSFHEG00000021990	ppargc1a	100	52.476	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	87.719	ENSGALG00000042851	PPARGC1A	100	87.719	Gallus_gallus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	52	80.114	ENSGAFG00000015514	ppargc1a	100	53.513	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	99	85.409	ENSGAGG00000007043	PPARGC1A	100	86.031	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	57	50.000	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	60	50.000	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.908	ENSGGOG00000009505	PPARGC1B	51	51.908	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.997	ENSGGOG00000009810	PPARGC1A	100	98.997	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	87	83.030	ENSHBUG00000005269	ppargc1a	99	86.885	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	54	50.562	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	53	48.889	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	98	96.154	ENSHGLG00000007022	PPARGC1A	100	96.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	93.609	ENSHGLG00100000133	PPARGC1A	100	91.855	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	51.840	ENSHCOG00000014886	ppargc1a	91	79.878	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	86	87.097	ENSIPUG00000020313	ppargc1a	66	87.097	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.363	ENSSTOG00000012522	PPARGC1A	100	95.363	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	71	81.250	ENSKMAG00000005390	ppargc1a	100	54.048	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	95	71.368	ENSLBEG00000019562	ppargc1a	83	74.634	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	91	35.047	ENSLACG00000011232	PPARGC1B	69	48.322	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	71.536	ENSLACG00000014054	PPARGC1A	99	73.852	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	61	42.105	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	57	42.105	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.612	ENSLAFG00000012981	PPARGC1A	100	94.612	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	57	48.529	ENSLAFG00000012339	PPARGC1B	57	48.529	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.145	ENSMFAG00000042269	PPARGC1B	51	51.145	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.371	ENSMFAG00000000534	PPARGC1A	100	98.371	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.145	ENSMMUG00000004749	PPARGC1B	51	51.145	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.496	ENSMMUG00000001844	PPARGC1A	100	98.496	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.145	ENSMNEG00000034121	PPARGC1B	51	51.145	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.496	ENSMNEG00000028682	PPARGC1A	100	98.496	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	98.872	ENSMLEG00000034233	PPARGC1A	100	98.872	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	53	51.145	ENSMLEG00000040973	PPARGC1B	52	51.145	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	96	71.193	ENSMAMG00000005531	ppargc1a	100	53.070	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	72	78.534	ENSMZEG00005001739	ppargc1a	70	70.370	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	87.594	ENSMGAG00000012485	PPARGC1A	100	87.594	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	62	44.545	ENSMGAG00000003134	PPARGC1B	50	44.545	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	94.236	ENSMAUG00000011811	Ppargc1a	100	94.236	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	71	47.403	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	54	47.403	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	96.867	ENSMICG00000015390	PPARGC1A	100	96.867	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	55	51.020	ENSMICG00000002702	PPARGC1B	52	49.265	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	93.860	ENSMOCG00000008765	Ppargc1a	100	93.860	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	71	44.805	ENSMOCG00000014885	Ppargc1b	55	44.805	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	80	84.242	ENSMMOG00000011847	ppargc1a	98	84.146	Mola_mola
ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	90.476	ENSMODG00000000549	PPARGC1A	100	90.476	Monodelphis_domestica
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