EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000014917 (Gene tree)
Gene ID: 100392630
Gene Symbol: SRRT
Alias: ARS2|Asr2|serrate
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15644 bases
Position: chrNTIC01011112.1:188563882-188579525
Accession: 24101
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000027514	ARS2	PF04959.13	3.9e-91	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000029083	SRRT-201	5657	-	ENSCJAP00000027514	875 (aa)	-	U3E919

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.858	ENSG00000087087	SRRT	99	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	75.699	ENSAPOG00000002304	srrt	51	75.699	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	93.584	ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.584	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000014917	SRRT	79	75.484	ENSACIG00000015795	srrt	85	75.484	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	55.981	ENSAOCG00000009189	-	96	57.956	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000014917	SRRT	79	75.914	ENSAOCG00000009693	srrt	83	75.914	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	55.981	ENSAPEG00000020016	-	96	57.956	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000014917	SRRT	79	75.484	ENSAPEG00000003646	srrt	85	75.484	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000014917	SRRT	79	73.548	ENSATEG00000014425	srrt	88	74.409	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000014917	SRRT	56	61.924	ENSATEG00000003652	-	85	64.301	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000014917	SRRT	95	77.014	ENSACAG00000001014	SRRT	96	77.241	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	99.200	ENSANAG00000031718	SRRT	100	99.200	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000014917	SRRT	56	61.414	ENSACLG00000009423	-	52	63.848	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	74.194	ENSACLG00000013156	srrt	50	74.194	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000014917	SRRT	52	75.163	ENSAMXG00000016671	srrt	50	75.217	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.032	ENSBTAG00000001134	SRRT	100	97.032	Bos_taurus
ENSCJAG00000014917	SRRT	61	47.656	WBGene00017085	E01A2.2	85	42.505	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.603	ENSCAFG00000023538	SRRT	100	97.603	Canis_familiaris
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.032	ENSCAFG00020013358	SRRT	100	97.032	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.146	ENSCHIG00000010495	SRRT	100	97.146	Capra_hircus
ENSCJAG00000014917	SRRT	96	93.333	ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.660	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000014917	SRRT	95	95.689	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	95.689	Cavia_aperea
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.719	ENSCPOG00000001739	SRRT	100	97.719	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	99.543	ENSCCAG00000015877	SRRT	100	99.543	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.516	ENSCATG00000036306	SRRT	100	98.516	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.831	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	97.831	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.744	ENSCSAG00000017996	SRRT	100	98.744	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000014917	SRRT	56	92.941	ENSCHOG00000007815	SRRT	69	91.713	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000014917	SRRT	75	82.061	ENSCPBG00000011553	SRRT	85	80.645	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	42.064	ENSCING00000003506	-	54	51.867	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	39.914	ENSCSAVG00000008394	-	81	53.760	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.059	ENSCANG00000034556	SRRT	100	98.059	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	96.583	ENSCGRG00001001594	Srrt	100	96.583	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000014917	SRRT	98	88.140	ENSCGRG00000007292	Srrt	98	87.674	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	66.595	ENSCSEG00000017878	srrt	50	67.452	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000014917	SRRT	95	64.463	ENSCVAG00000019848	srrt	54	74.409	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	90	55.051	ENSCVAG00000017344	-	51	62.217	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	75.751	ENSDARG00000017762	srrt	51	77.253	Danio_rerio
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.489	ENSDNOG00000003851	SRRT	100	97.489	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	95.791	ENSDORG00000005584	Srrt	100	95.791	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000014917	SRRT	85	52.220	FBgn0033062	Ars2	67	52.754	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000014917	SRRT	86	94.211	ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.211	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000014917	SRRT	62	62.500	ENSEBUG00000008517	-	76	65.278	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.489	ENSEASG00005016956	SRRT	100	97.489	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.603	ENSECAG00000012292	SRRT	100	97.603	Equus_caballus
ENSCJAG00000014917	SRRT	85	97.727	ENSEEUG00000009117	SRRT	93	97.727	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	55.569	ENSELUG00000021216	-	53	64.241	Esox_lucius
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.831	ENSFCAG00000006855	SRRT	100	97.831	Felis_catus
ENSCJAG00000014917	SRRT	57	52.564	ENSFALG00000007524	-	82	75.000	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	92.922	ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.757	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000014917	SRRT	74	74.672	ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000014917	SRRT	55	54.379	ENSFHEG00000004105	-	93	55.297	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000014917	SRRT	95	59.977	ENSGMOG00000018619	srrt	51	69.462	Gadus_morhua
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	74.409	ENSGAFG00000005423	srrt	51	73.978	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	53.056	ENSGAFG00000020383	-	54	61.229	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000014917	SRRT	95	63.594	ENSGACG00000020387	srrt	51	73.718	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	51.586	ENSGACG00000001100	-	53	61.345	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.858	ENSGGOG00000001508	SRRT	99	98.858	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	74.409	ENSHBUG00000002942	srrt	50	74.409	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000014917	SRRT	98	62.372	ENSHCOG00000005403	srrt	56	70.968	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	52.025	ENSHCOG00000008904	-	56	60.934	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.146	ENSSTOG00000013776	SRRT	100	97.146	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	95.434	ENSJJAG00000010446	Srrt	100	95.434	Jaculus_jaculus
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ENSCJAG00000014917	SRRT	93	54.009	ENSKMAG00000008468	-	53	62.140	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	74.464	ENSLBEG00000016308	srrt	54	75.751	Labrus_bergylta
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ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.174	ENSMLEG00000029479	SRRT	100	98.174	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	54.127	ENSMAMG00000010681	-	96	57.226	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	73.118	ENSMAMG00000014311	srrt	51	74.194	Mastacembelus_armatus
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ENSCJAG00000014917	SRRT	87	54.040	ENSMMOG00000011137	-	55	65.458	Mola_mola
ENSCJAG00000014917	SRRT	54	88.935	ENSMODG00000004862	SRRT	90	90.041	Monodelphis_domestica
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ENSCJAG00000014917	SRRT	90	61.800	ENSMALG00000018604	srrt	80	71.183	Monopterus_albus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	96.918	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	97.794	Mus_caroli
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	96.918	ENSMUSG00000037364	Srrt	100	96.918	Mus_musculus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	96.689	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	97.426	Mus_pahari
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	96.918	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	97.794	Mus_spretus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.945	ENSMPUG00000015839	SRRT	100	97.945	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.489	ENSMLUG00000009975	SRRT	100	97.489	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.146	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	97.146	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000014917	SRRT	53	72.688	ENSNBRG00000019100	srrt	52	72.688	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000014917	SRRT	95	88.568	ENSNLEG00000011987	SRRT	100	88.568	Nomascus_leucogenys
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ENSCJAG00000014917	SRRT	63	100.000	ENSOPRG00000002502	-	67	100.000	Ochotona_princeps
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ENSCJAG00000014917	SRRT	53	74.624	ENSONIG00000004242	srrt	52	74.409	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	54.009	ENSONIG00000016080	-	52	63.080	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000014917	SRRT	96	65.469	ENSORLG00000008120	srrt	52	73.978	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000014917	SRRT	96	65.665	ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000014917	SRRT	96	65.741	ENSORLG00015008062	srrt	52	73.763	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000014917	SRRT	93	56.204	ENSOMEG00000006963	-	53	64.331	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000014917	SRRT	96	65.473	ENSOMEG00000003155	srrt	90	74.194	Oryzias_melastigma
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ENSCJAG00000014917	SRRT	100	97.717	ENSPTIG00000014355	SRRT	100	97.717	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.400	ENSPTRG00000019511	SRRT	100	98.400	Pan_troglodytes
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