EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000015031 (Gene tree)
Gene ID: 100388328
Gene Symbol: RDM1
Alias: MGC33977|RAD52B
Full Name: RAD52 motif containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 34898 bases
Position: chrNTIC01034389.1:91905333-91940230
Accession: 19950
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000027704	RRM_1	PF00076.22	1.3e-06	1	1
ENSCJAP00000045845	RRM_1	PF00076.22	2.7e-06	1	1
ENSCJAP00000044988	RRM_1	PF00076.22	3.7e-06	1	1
ENSCJAP00000027709	RRM_1	PF00076.22	4.5e-06	1	1
ENSCJAP00000067003	RRM_1	PF00076.22	4.6e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000029277	RDM1-205	420	-	ENSCJAP00000027704	139 (aa)	-	F7EKJ2
ENSCJAT00000061124	RDM1-203	1381	-	ENSCJAP00000044988	272 (aa)	-	F7FV89
ENSCJAT00000029282	RDM1-202	1119	-	ENSCJAP00000027709	309 (aa)	-	F7EKG5
ENSCJAT00000082655	RDM1-201	1498	-	ENSCJAP00000067003	311 (aa)	-	A0A2R8MYV6
ENSCJAT00000054987	RDM1-204	1503	-	ENSCJAP00000045845	226 (aa)	-	F6QC81

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	94.245	ENSG00000278023	RDM1	100	94.245	Homo_sapiens
ENSCJAG00000015031	RDM1	94	46.970	ENSAPOG00000021886	zgc:103564	84	36.481	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000015031	RDM1	94	46.212	ENSAPEG00000008929	zgc:103564	92	34.127	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000015031	RDM1	88	54.733	ENSAPLG00000004384	RDM1	92	54.357	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000015031	RDM1	95	56.818	ENSACAG00000012989	-	91	48.828	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	96.403	ENSANAG00000032752	RDM1	100	96.403	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	88.722	ENSBTAG00000000030	RDM1	89	79.842	Bos_taurus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	77.206	ENSCAFG00000015160	-	100	74.219	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	87.970	ENSCHIG00000020607	RDM1	90	79.842	Capra_hircus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	81.955	ENSCPOG00000001495	-	92	72.243	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	95.683	ENSCCAG00000035763	RDM1	100	95.683	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	92.806	ENSCATG00000044451	RDM1	100	92.806	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015031	RDM1	90	88.163	ENSCSAG00000006209	RDM1	91	88.750	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015031	RDM1	73	69.307	ENSCPBG00000009105	RDM1	93	53.441	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000015031	RDM1	97	91.852	ENSCANG00000041322	RDM1	95	91.071	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	81.203	ENSCGRG00001015927	Rdm1	89	74.206	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000015031	RDM1	94	41.353	ENSCVAG00000001956	zgc:103564	90	34.783	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000015031	RDM1	90	76.016	ENSDNOG00000045224	-	90	76.763	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015031	RDM1	85	80.412	ENSEASG00005010554	RDM1	80	74.554	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	91.729	ENSECAG00000022182	RDM1	91	81.569	Equus_caballus
ENSCJAG00000015031	RDM1	85	73.822	ENSEEUG00000006127	RDM1	91	72.926	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	87.050	ENSFCAG00000043429	RDM1	100	87.050	Felis_catus
ENSCJAG00000015031	RDM1	95	63.636	ENSGALG00000000243	RDM1	88	55.294	Gallus_gallus
ENSCJAG00000015031	RDM1	89	52.941	ENSGAGG00000000293	-	77	52.263	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	93.525	ENSGGOG00000010584	RDM1	100	93.525	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000015031	RDM1	94	43.939	ENSHCOG00000002518	-	89	37.154	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	87.218	ENSSTOG00000022491	RDM1	89	81.746	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	85.714	ENSLAFG00000029300	RDM1	89	80.237	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	92.806	ENSMFAG00000032968	RDM1	100	92.806	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000015031	RDM1	99	91.480	ENSMMUG00000006847	RDM1	95	91.964	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	92.806	ENSMNEG00000039977	RDM1	100	92.806	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000015031	RDM1	97	93.333	ENSMLEG00000041158	RDM1	95	91.964	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000015031	RDM1	82	62.281	ENSMGAG00000008774	RDM1	90	54.741	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	81.203	ENSMAUG00000018559	Rdm1	90	73.930	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	92.481	ENSMICG00000038651	RDM1	94	86.937	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	78.947	ENSMOCG00000015095	Rdm1	92	70.866	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000015031	RDM1	95	72.727	ENSMODG00000011101	RDM1	92	63.636	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	84.211	MGP_CAROLIEiJ_G0017226	Rdm1	89	75.397	Mus_caroli
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	83.459	ENSMUSG00000010362	Rdm1	89	74.603	Mus_musculus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	84.962	MGP_PahariEiJ_G0018356	Rdm1	89	74.206	Mus_pahari
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	82.707	MGP_SPRETEiJ_G0018069	Rdm1	89	74.603	Mus_spretus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	90.977	ENSMPUG00000008363	RDM1	89	83.858	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000015031	RDM1	99	93.274	ENSNLEG00000014173	RDM1	92	94.393	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000015031	RDM1	95	71.970	ENSMEUG00000015826	RDM1	95	67.373	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	83.459	ENSOCUG00000022704	RDM1	97	77.075	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000015031	RDM1	99	84.305	ENSOGAG00000011332	RDM1	90	83.594	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000015031	RDM1	99	91.928	ENSPPAG00000029969	RDM1	89	91.667	Pan_paniscus
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	94.245	ENSPTRG00000009031	RDM1	100	94.245	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	92.806	ENSPANG00000022933	RDM1	100	92.806	Papio_anubis
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	80.451	ENSPEMG00000018985	Rdm1	89	73.810	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000015031	RDM1	99	91.928	ENSPPYG00000008198	RDM1	89	91.270	Pongo_abelii
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	86.331	ENSPCOG00000017995	RDM1	100	86.331	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	89.474	ENSPVAG00000001116	RDM1	100	82.470	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	83.459	ENSRNOG00000020751	Rdm1	89	74.603	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000015031	RDM1	100	92.806	ENSRBIG00000030000	RDM1	100	92.806	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000015031	RDM1	97	92.593	ENSRROG00000035242	RDM1	95	91.964	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000015031	RDM1	95	75.758	ENSSHAG00000013584	RDM1	92	67.589	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000015031	RDM1	93	62.791	ENSSPUG00000010941	RDM1	90	52.000	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000015031	RDM1	94	46.970	ENSSPAG00000011690	-	91	37.154	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000015031	RDM1	93	70.616	ENSSSCG00000017574	-	93	71.429	Sus_scrofa
ENSCJAG00000015031	RDM1	73	84.158	ENSTBEG00000010030	RDM1	91	60.699	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	90.226	ENSUAMG00000027279	RDM1	89	84.524	Ursus_americanus
ENSCJAG00000015031	RDM1	96	90.226	ENSUMAG00000015423	RDM1	87	84.524	Ursus_maritimus