EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000015250 (Gene tree)
Gene ID: 103792402
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8943 bases
Position: chrNTIC01022223.1:132347524-132356466
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000028118	S10_plectin	PF03501.15	4.4e-49	1	1
ENSCJAP00000062603	S10_plectin	PF03501.15	4.4e-46	1	1
ENSCJAP00000061273	S10_plectin	PF03501.15	6.3e-46	1	1
ENSCJAP00000053142	S10_plectin	PF03501.15	7.2e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000082666	-	1001	-	ENSCJAP00000053142	190 (aa)	-	A0A2R8P1D5
ENSCJAT00000077668	-	1304	-	ENSCJAP00000061273	175 (aa)	-	A0A2R8MKU7
ENSCJAT00000073864	-	906	-	ENSCJAP00000062603	149 (aa)	-	A0A2R8N9P5
ENSCJAT00000029714	-	498	-	ENSCJAP00000028118	165 (aa)	-	F7BRM8

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03010	Ribosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000015250	-	93	95.652	ENSCJAG00000040387	-	99	89.677
ENSCJAG00000015250	-	100	88.571	ENSCJAG00000038788	-	100	88.571
ENSCJAG00000015250	-	97	86.897	ENSCJAG00000042251	-	87	92.754
ENSCJAG00000015250	-	100	93.143	ENSCJAG00000038444	-	100	93.143
ENSCJAG00000015250	-	92	99.342	ENSCJAG00000045624	-	84	98.571

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000015250	-	98	99.383	ENSG00000124614	RPS10	100	93.714	Homo_sapiens
ENSCJAG00000015250	-	95	98.718	ENSG00000270800	RPS10-NUDT3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000015250	-	95	87.324	ENSAPOG00000010000	rps10	92	92.157	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.143	ENSAMEG00000001047	RPS10	100	93.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000015250	-	93	91.558	ENSACIG00000010800	rps10	89	91.558	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000015250	-	95	88.028	ENSAOCG00000021264	rps10	92	92.810	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000015250	-	95	88.028	ENSAPEG00000023100	rps10	92	92.810	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000015250	-	95	87.324	ENSATEG00000025129	rps10	92	92.157	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000015250	-	69	94.167	ENSAPLG00000008728	-	100	94.167	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000015250	-	89	87.313	ENSACAG00000015886	-	100	85.311	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000015250	-	100	91.429	ENSANAG00000031095	-	100	91.429	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	100	85.714	ENSANAG00000028861	-	100	85.714	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	100	90.857	ENSANAG00000031336	-	100	90.857	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	100	89.714	ENSANAG00000003030	-	100	89.714	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	98	76.163	ENSANAG00000011004	-	78	81.579	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	98	99.383	ENSANAG00000023528	RPS10-NUDT3	100	96.875	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	100	82.286	ENSANAG00000038233	-	83	82.286	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	99	82.759	ENSANAG00000036783	-	99	82.759	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	100	86.286	ENSANAG00000035098	-	76	92.763	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015250	-	95	87.324	ENSACLG00000000755	rps10	92	92.157	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000015250	-	95	87.324	ENSAMXG00000043037	rps10	92	92.157	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSBTAG00000015598	RPS10	100	93.714	Bos_taurus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCAFG00000001214	RPS10	100	93.714	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015250	-	98	52.326	ENSCAFG00000024875	-	88	57.237	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015250	-	100	93.143	ENSCAFG00000011435	-	100	93.143	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015250	-	100	93.143	ENSCAFG00000008935	-	100	93.143	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCAFG00020006238	RPS10	100	94.340	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000015250	-	96	93.706	ENSCAFG00020026142	-	92	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000015250	-	100	66.857	ENSCHIG00000009521	-	100	66.857	Capra_hircus
ENSCJAG00000015250	-	100	84.571	ENSCHIG00000024418	-	100	84.571	Capra_hircus
ENSCJAG00000015250	-	100	57.377	ENSCHIG00000021691	-	95	59.394	Capra_hircus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCHIG00000026089	RPS10	100	93.714	Capra_hircus
ENSCJAG00000015250	-	100	82.286	ENSCHIG00000026947	-	100	82.286	Capra_hircus
ENSCJAG00000015250	-	93	98.039	ENSCHIG00000008222	-	93	98.039	Capra_hircus
ENSCJAG00000015250	-	100	82.857	ENSTSYG00000031022	-	100	82.857	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000015250	-	98	97.531	ENSTSYG00000032368	RPS10-NUDT3	97	96.855	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000015250	-	94	70.000	ENSTSYG00000031140	-	96	71.698	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000015250	-	69	93.333	ENSCAPG00000017077	-	87	93.333	Cavia_aperea
ENSCJAG00000015250	-	100	67.429	ENSCAPG00000013627	-	100	67.429	Cavia_aperea
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSCPOG00000008613	-	100	92.571	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000015250	-	100	72.000	ENSCPOG00000022550	-	100	72.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000015250	-	95	90.071	ENSCCAG00000022184	-	93	92.105	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	93	78.986	ENSCCAG00000032655	-	97	79.630	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	97	84.028	ENSCCAG00000036988	-	100	87.578	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCCAG00000028065	RPS10-NUDT3	97	98.701	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	100	89.714	ENSCCAG00000005707	-	100	89.714	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	92	94.161	ENSCCAG00000026845	-	92	97.727	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	96	86.713	ENSCCAG00000027958	-	91	91.096	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015250	-	100	87.429	ENSCATG00000030649	-	77	87.429	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015250	-	100	90.857	ENSCATG00000015458	-	100	90.857	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015250	-	100	88.000	ENSCATG00000022438	-	100	88.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCATG00000043558	-	100	93.714	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015250	-	100	93.143	ENSCATG00000018563	-	100	93.143	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015250	-	83	83.212	ENSCLAG00000017787	-	88	83.333	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000015250	-	100	94.286	ENSCLAG00000009803	-	100	94.286	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000015250	-	100	90.857	ENSCSAG00000018427	-	100	90.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSCSAG00000018886	-	100	92.571	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCSAG00000018731	-	100	93.714	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015250	-	93	96.377	ENSCHOG00000002870	-	100	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000015250	-	75	92.857	ENSCHOG00000008555	-	100	97.196	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000015250	-	100	81.143	ENSCPBG00000017967	-	70	81.143	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSCPBG00000027135	-	79	92.571	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000015250	-	98	95.679	ENSCANG00000022488	-	98	95.679	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	100	90.286	ENSCANG00000012451	-	100	90.286	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	100	86.857	ENSCANG00000038018	-	100	86.957	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	100	90.857	ENSCANG00000037539	-	100	90.857	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSCANG00000028086	-	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.143	ENSCANG00000007445	-	100	93.143	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	100	78.286	ENSCANG00000031931	-	92	84.868	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015250	-	99	91.379	ENSCANG00000035231	-	99	91.379	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSCJAG00000015250	-	90	81.333	ENSCGRG00001012534	-	92	81.699	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000015250	-	100	65.537	ENSCGRG00000014097	-	93	67.702	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000015250	-	90	81.333	ENSCGRG00000002822	-	92	81.699	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSCGRG00000008120	Rps10	100	92.571	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000015250	-	95	80.282	ENSCSEG00000016916	rps10	100	80.682	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000015250	-	95	87.324	ENSCVAG00000014422	rps10	92	91.503	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000015250	-	92	88.406	ENSDARG00000034897	rps10	100	95.588	Danio_rerio
ENSCJAG00000015250	-	99	59.195	ENSDNOG00000030976	-	89	59.195	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015250	-	100	77.714	ENSDNOG00000037802	-	100	78.857	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSDNOG00000011670	-	100	93.714	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015250	-	97	70.000	ENSDORG00000023739	-	93	70.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015250	-	100	81.714	ENSDORG00000028965	-	76	88.158	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSDORG00000012060	-	100	93.714	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015250	-	100	79.429	ENSDORG00000027790	-	100	79.429	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015250	-	100	78.409	ENSDORG00000028471	-	100	78.409	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015250	-	90	80.741	ENSEBUG00000016038	rps10	82	83.846	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000015250	-	93	42.754	ENSEASG00005003251	-	89	44.776	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000015250	-	95	98.718	ENSEASG00005020975	RPS10-NUDT3	100	93.143	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000015250	-	87	44.961	ENSECAG00000031422	-	87	46.774	Equus_caballus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSECAG00000006430	RPS10	97	96.774	Equus_caballus
ENSCJAG00000015250	-	92	99.342	ENSEEUG00000003376	RPS10-NUDT3	100	99.342	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000015250	-	90	85.621	ENSELUG00000020573	rps10	91	85.897	Esox_lucius
ENSCJAG00000015250	-	99	55.114	ENSFCAG00000032561	-	90	58.824	Felis_catus
ENSCJAG00000015250	-	100	93.714	ENSFCAG00000015355	-	100	93.714	Felis_catus
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSFALG00000003777	-	98	92.571	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSFDAG00000003603	-	100	92.571	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000015250	-	95	88.028	ENSFHEG00000016772	rps10	92	92.810	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000015250	-	96	84.028	ENSGMOG00000000113	rps10	80	89.437	Gadus_morhua
ENSCJAG00000015250	-	100	92.571	ENSGALG00000002813	RPS10	100	92.571	Gallus_gallus
ENSCJAG00000015250	-	98	88.889	ENSGAFG00000016161	rps10	96	88.889	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000015250	-	96	87.500	ENSGACG00000004926	rps10	99	84.416	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000015250	-	84	76.761	ENSGAGG00000010043	-	87	72.727	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000015250	-	97	74.375	ENSGAGG00000003102	-	99	74.375	Gopherus_agassizii
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