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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000015491 (Gene tree)
Gene ID: 100413748
Gene Symbol: RARS
Alias: DALRD1
Full Name: arginyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36972 bases
Position: chrNTIC01011112.1:170266701-170303672
Accession: 100413748
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000028620	Arg_tRNA_synt_N	PF03485.16	2.2e-23	1	1
ENSCJAP00000028620	tRNA-synt_1d	PF00750.19	1.2e-167	1	1
ENSCJAP00000028620	DALR_1	PF05746.15	3.2e-32	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000030243	RARS-201	3015	-	ENSCJAP00000028620	660 (aa)	XP_002744196	F6WS67

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.292	ENSCJAG00000000692	RARS2	80	32.292

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.000	ENSG00000113643	RARS	100	95.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.708	ENSG00000146282	RARS2	79	32.708	Homo_sapiens
ENSCJAG00000015491	RARS	99	78.659	ENSAPOG00000005162	rars	99	78.659	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.619	ENSAMEG00000004455	RARS2	85	31.619	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000015491	RARS	100	93.182	ENSAMEG00000007025	RARS	100	93.182	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000015491	RARS	89	80.952	ENSACIG00000019199	rars	100	80.952	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000015491	RARS	88	30.084	ENSACIG00000009620	rars2	99	30.084	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	78.659	ENSAOCG00000005604	rars	99	78.659	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000015491	RARS	99	78.506	ENSAPEG00000006465	rars	99	78.506	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000015491	RARS	99	77.287	ENSATEG00000014025	rars	99	77.287	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000015491	RARS	98	84.000	ENSAPLG00000002426	RARS	98	84.000	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000015491	RARS	98	85.054	ENSACAG00000004938	RARS	98	85.054	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000015491	RARS	100	97.576	ENSANAG00000037068	RARS	100	97.576	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.500	ENSANAG00000027711	RARS2	79	32.500	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015491	RARS	99	76.865	ENSACLG00000025166	rars	99	76.865	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000015491	RARS	100	73.979	ENSAMXG00000017290	rars	100	73.979	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000015491	RARS	79	30.354	ENSAMXG00000013899	rars2	89	30.354	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000015491	RARS	82	30.208	ENSBTAG00000016967	RARS2	95	30.208	Bos_taurus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	90.758	ENSBTAG00000014626	RARS	100	90.758	Bos_taurus
ENSCJAG00000015491	RARS	94	49.926	WBGene00004679	rars-1	94	49.926	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000015491	RARS	100	93.636	ENSCAFG00000017058	RARS	100	93.636	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015491	RARS	81	31.636	ENSCAFG00000003072	RARS2	90	31.636	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015491	RARS	59	94.057	ENSCAFG00020003506	RARS	86	94.057	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000015491	RARS	81	31.636	ENSCAFG00020015902	RARS2	90	31.636	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000015491	RARS	100	91.364	ENSCHIG00000021126	RARS	100	91.364	Capra_hircus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	94.091	ENSTSYG00000011635	RARS	100	94.091	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000015491	RARS	76	94.686	ENSCAPG00000007597	RARS	98	94.340	Cavia_aperea
ENSCJAG00000015491	RARS	81	30.727	ENSCPOG00000025172	RARS2	90	30.727	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	90.909	ENSCPOG00000007379	RARS	100	90.909	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	97.879	ENSCCAG00000027227	RARS	100	97.879	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.500	ENSCCAG00000031089	RARS2	79	32.500	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.917	ENSCATG00000023833	RARS2	80	32.917	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.152	ENSCATG00000025045	RARS	100	95.152	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.489	ENSCLAG00000015838	RARS2	86	31.489	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000015491	RARS	97	74.568	ENSCLAG00000006281	-	98	74.568	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000015491	RARS	100	91.364	ENSCLAG00000013061	-	100	91.364	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.917	ENSCSAG00000017345	RARS2	79	32.917	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.000	ENSCSAG00000010165	RARS	100	95.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015491	RARS	57	98.765	ENSCHOG00000007747	-	60	98.765	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000015491	RARS	99	80.275	ENSCPBG00000008379	RARS	100	86.004	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000015491	RARS	76	30.902	ENSCPBG00000019897	RARS2	86	30.902	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000015491	RARS	99	58.744	ENSCING00000007294	-	99	58.744	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000015491	RARS	88	62.906	ENSCSAVG00000008559	-	100	62.906	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.303	ENSCANG00000043212	RARS	100	95.303	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015491	RARS	71	30.833	ENSCANG00000034918	RARS2	78	30.833	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	91.074	ENSCGRG00001002920	RARS	100	91.074	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000015491	RARS	100	90.015	ENSCGRG00000013308	Rars	100	90.015	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000015491	RARS	100	74.586	ENSCSEG00000020512	rars	95	74.586	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000015491	RARS	99	78.201	ENSCVAG00000020217	rars	99	78.201	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	77.321	ENSDARG00000054530	rars	99	77.321	Danio_rerio
ENSCJAG00000015491	RARS	76	30.577	ENSDNOG00000000543	RARS2	79	33.521	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015491	RARS	66	89.269	ENSDNOG00000015032	RARS	100	89.269	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015491	RARS	76	30.843	ENSDORG00000013440	Rars2	86	30.843	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015491	RARS	98	75.697	ENSDORG00000010641	Rars	99	75.697	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015491	RARS	99	58.157	FBgn0027093	ArgRS	99	58.157	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000015491	RARS	89	92.803	ENSETEG00000015148	RARS	89	92.803	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000015491	RARS	98	64.877	ENSEBUG00000011116	rars	99	66.234	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.801	ENSEASG00005005661	RARS2	85	31.801	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	94.394	ENSEASG00005012782	RARS	100	94.394	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	94.394	ENSECAG00000024383	RARS	100	94.394	Equus_caballus
ENSCJAG00000015491	RARS	82	30.208	ENSECAG00000011589	RARS2	86	30.208	Equus_caballus
ENSCJAG00000015491	RARS	86	73.611	ENSEEUG00000009388	-	88	73.611	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	76.667	ENSELUG00000011052	rars	100	76.667	Esox_lucius
ENSCJAG00000015491	RARS	100	93.788	ENSFCAG00000022422	RARS	100	93.788	Felis_catus
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.792	ENSFCAG00000024551	RARS2	85	31.660	Felis_catus
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.689	ENSFALG00000002936	RARS2	89	30.952	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000015491	RARS	89	85.618	ENSFALG00000009700	RARS	99	85.618	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000015491	RARS	82	30.382	ENSFDAG00000013359	RARS2	95	30.382	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000015491	RARS	100	90.909	ENSFDAG00000004373	RARS	100	90.909	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000015491	RARS	99	76.829	ENSFHEG00000000411	rars	99	76.829	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	68.950	ENSGMOG00000014779	rars	99	68.950	Gadus_morhua
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.818	ENSGALG00000015806	RARS2	85	31.810	Gallus_gallus
ENSCJAG00000015491	RARS	98	83.462	ENSGALG00000001850	RARS	100	82.602	Gallus_gallus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	77.134	ENSGAFG00000011519	rars	99	77.134	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000015491	RARS	99	72.424	ENSGACG00000020813	rars	100	75.233	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	84.115	ENSGAGG00000013126	RARS	100	84.115	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000015491	RARS	76	30.829	ENSGAGG00000025105	RARS2	86	30.829	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000015491	RARS	100	94.848	ENSGGOG00000009650	RARS	100	94.848	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.708	ENSGGOG00000010027	RARS2	79	32.708	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000015491	RARS	99	76.865	ENSHBUG00000013622	rars	99	76.865	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000015491	RARS	77	31.358	ENSHGLG00000001593	RARS2	86	31.358	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000015491	RARS	100	91.515	ENSHGLG00000013073	RARS	100	91.515	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000015491	RARS	77	31.358	ENSHGLG00100012820	RARS2	86	31.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000015491	RARS	100	91.515	ENSHGLG00100012450	RARS	100	91.515	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000015491	RARS	70	31.197	ENSHCOG00000007279	rars2	82	31.197	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000015491	RARS	94	74.718	ENSHCOG00000020064	rars	96	74.718	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000015491	RARS	71	30.271	ENSIPUG00000015528	RARS2	79	30.271	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	75.000	ENSIPUG00000006210	rars	100	75.000	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000015491	RARS	91	80.366	ENSSTOG00000001441	RARS	95	80.366	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	93.030	ENSJJAG00000020235	Rars	100	93.030	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	76.829	ENSKMAG00000003759	rars	99	76.829	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	78.843	ENSLBEG00000021321	rars	99	78.843	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000015491	RARS	78	30.077	ENSLBEG00000012135	rars2	99	30.077	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000015491	RARS	100	81.061	ENSLACG00000015877	RARS	100	81.061	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000015491	RARS	100	78.182	ENSLOCG00000012373	rars	100	78.182	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000015491	RARS	76	31.429	ENSLAFG00000004915	RARS2	86	31.429	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000015491	RARS	100	92.576	ENSLAFG00000003877	RARS	100	92.576	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.152	ENSMFAG00000030272	RARS	100	95.152	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.917	ENSMFAG00000039420	RARS2	80	32.917	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.917	ENSMMUG00000017039	RARS2	79	32.917	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.152	ENSMMUG00000012516	RARS	100	95.152	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000015491	RARS	69	83.114	ENSMNEG00000044708	RARS	100	83.114	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000015491	RARS	71	32.500	ENSMLEG00000036913	RARS2	78	32.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	95.303	ENSMLEG00000035328	RARS	100	95.303	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	78.354	ENSMAMG00000021860	rars	99	78.354	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000015491	RARS	99	76.865	ENSMZEG00005012060	rars	99	76.865	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000015491	RARS	99	82.094	ENSMGAG00000002320	RARS	99	82.094	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000015491	RARS	76	30.377	ENSMGAG00000013668	RARS2	85	30.377	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000015491	RARS	100	80.030	ENSMAUG00000008565	Rars	100	80.030	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000015491	RARS	100	82.424	ENSMICG00000004771	-	100	82.424	Microcebus_murinus
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