EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000015607 (Gene tree)
Gene ID: 100399568
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 123848 bases
Position: chrNTIC01035500.1:23495463-23619310
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000028862	GTP_EFTU	PF00009.27	2.7e-61	1	1
ENSCJAP00000058842	GTP_EFTU	PF00009.27	2.7e-61	1	1
ENSCJAP00000044168	GTP_EFTU	PF00009.27	1.6e-39	1	1
ENSCJAP00000057840	GTP_EFTU	PF00009.27	8.2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000030501	-	3057	-	ENSCJAP00000028862	1018 (aa)	-	F6W5W8
ENSCJAT00000061660	-	2904	-	ENSCJAP00000044168	967 (aa)	-	F7FY98
ENSCJAT00000081279	-	270	-	ENSCJAP00000057840	89 (aa)	-	A0A2R8MDJ2
ENSCJAT00000083659	-	3120	-	ENSCJAP00000058842	1039 (aa)	-	A0A2R8P9Y2

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000015607	-	76	41.509	ENSCJAG00000015045	EEF2	96	36.901
ENSCJAG00000015607	-	72	37.255	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	69	37.255

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000015607	-	96	97.570	ENSG00000140598	EFL1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSAPOG00000000188	efl1	84	92.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSAMEG00000006031	EFL1	84	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000015607	-	93	93.651	ENSACIG00000017802	efl1	84	93.651	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSAOCG00000023933	efl1	83	92.857	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000015607	-	56	82.000	ENSAOCG00000024337	-	82	85.897	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSAPEG00000000262	efl1	84	92.857	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000015607	-	97	92.742	ENSATEG00000012373	efl1	90	92.742	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSAPLG00000011147	EFL1	85	97.619	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000015607	-	97	95.161	ENSACAG00000011040	EFL1	84	95.238	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSANAG00000027459	EFL1	85	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000015607	-	93	92.063	ENSACLG00000025780	efl1	84	92.063	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSAMXG00000019529	efl1	86	92.857	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSBTAG00000003410	EFL1	84	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000015607	-	85	57.600	WBGene00010732	K10C3.5	92	57.658	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSCAFG00000013671	EFL1	84	100.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000015607	-	61	94.444	ENSCAFG00020015837	-	82	97.500	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSCHIG00000001883	EFL1	84	100.000	Capra_hircus
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSTSYG00000000348	EFL1	85	100.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSCAPG00000017944	EFL1	83	99.206	Cavia_aperea
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSCPOG00000001924	EFL1	84	99.206	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSCCAG00000034450	EFL1	85	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSCATG00000031678	-	85	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000015607	-	93	98.413	ENSCLAG00000010155	EFL1	84	98.413	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSCSAG00000015165	EFL1	85	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000015607	-	66	100.000	ENSCHOG00000014029	EFL1	62	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000015607	-	93	96.800	ENSCPBG00000017638	EFL1	83	96.800	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000015607	-	61	68.519	ENSCING00000000792	-	99	63.755	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000015607	-	93	79.365	ENSCSAVG00000001787	-	89	79.200	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSCANG00000038093	EFL1	96	89.023	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000015607	-	93	98.413	ENSCGRG00001010826	Efl1	84	98.413	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000015607	-	93	98.413	ENSCGRG00000003273	Efl1	84	98.413	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000015607	-	93	90.476	ENSCSEG00000005856	efl1	84	90.476	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000015607	-	90	91.270	ENSCVAG00000011863	efl1	80	91.270	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000015607	-	97	95.161	ENSDARG00000079672	efl1	84	95.238	Danio_rerio
ENSCJAG00000015607	-	66	77.966	ENSDARG00000117086	CABZ01090544.1	98	77.966	Danio_rerio
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSDNOG00000006097	EFL1	84	99.206	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSDORG00000000719	Efl1	84	99.206	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000015607	-	88	62.698	FBgn0053158	CG33158	82	62.903	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000015607	-	90	84.564	ENSETEG00000004309	EFL1	90	84.522	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000015607	-	75	79.365	ENSEBUG00000010738	efl1	80	79.365	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000015607	-	93	94.444	ENSEASG00005007108	EFL1	96	84.327	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000015607	-	93	94.444	ENSECAG00000016354	EFL1	84	94.444	Equus_caballus
ENSCJAG00000015607	-	63	93.750	ENSEEUG00000006326	EFL1	75	86.494	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSELUG00000002520	efl1	83	92.857	Esox_lucius
ENSCJAG00000015607	-	93	96.825	ENSFCAG00000007741	EFL1	85	96.825	Felis_catus
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSFALG00000011103	EFL1	84	97.619	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSFDAG00000009023	EFL1	84	99.206	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000015607	-	93	89.683	ENSFHEG00000017795	efl1	85	89.683	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000015607	-	93	90.476	ENSGMOG00000005041	efl1	85	90.476	Gadus_morhua
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSGALG00000006225	EFL1	84	97.619	Gallus_gallus
ENSCJAG00000015607	-	61	74.074	ENSGAFG00000004687	-	84	81.707	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000015607	-	93	90.476	ENSGACG00000012495	efl1	84	90.476	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSGAGG00000022841	EFL1	84	97.619	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000015607	-	94	82.353	ENSGGOG00000008894	-	97	83.302	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000015607	-	90	100.000	ENSGGOG00000005017	EFL1	84	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000015607	-	93	92.063	ENSHBUG00000022667	efl1	84	92.063	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSHGLG00100010319	EFTUD1	99	95.122	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000015607	-	93	88.889	ENSHCOG00000007325	efl1	84	88.889	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000015607	-	93	89.683	ENSIPUG00000023360	EFTUD1	85	89.683	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSSTOG00000022945	EFL1	84	99.206	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000015607	-	64	94.737	ENSSTOG00000030430	-	83	88.172	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000015607	-	93	98.413	ENSJJAG00000018598	Efl1	84	98.413	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000015607	-	61	74.074	ENSKMAG00000002771	-	97	68.730	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000015607	-	93	90.476	ENSLBEG00000015269	efl1	84	90.476	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSLACG00000016121	EFL1	84	97.619	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000015607	-	93	96.032	ENSLOCG00000012862	efl1	84	96.032	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSLAFG00000012504	EFL1	85	99.206	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSMFAG00000032657	-	96	89.023	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSMMUG00000023353	EFL1	85	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSMNEG00000041671	-	95	89.023	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSMLEG00000033735	EFL1	96	89.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSMAMG00000011336	efl1	84	92.857	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000015607	-	93	92.063	ENSMZEG00005003012	efl1	84	92.063	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSMGAG00000007991	EFL1	85	97.619	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000015607	-	93	98.413	ENSMAUG00000010709	Efl1	84	98.413	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSMICG00000027853	EFL1	85	99.206	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSMOCG00000007470	Efl1	85	99.206	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000015607	-	93	90.476	ENSMMOG00000015370	efl1	83	90.476	Mola_mola
ENSCJAG00000015607	-	93	97.619	ENSMODG00000019386	EFL1	84	97.619	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000015607	-	93	93.651	ENSMALG00000018810	efl1	84	93.651	Monopterus_albus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	MGP_CAROLIEiJ_G0029936	Efl1	100	93.852	Mus_caroli
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSMUSG00000038563	Efl1	100	93.590	Mus_musculus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	MGP_PahariEiJ_G0013157	Efl1	100	93.162	Mus_pahari
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	MGP_SPRETEiJ_G0031038	Efl1	85	99.206	Mus_spretus
ENSCJAG00000015607	-	93	96.825	ENSMPUG00000015494	EFL1	84	96.825	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSNGAG00000017740	Efl1	84	99.206	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000015607	-	76	75.000	ENSNLEG00000031827	-	97	75.763	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000015607	-	90	100.000	ENSNLEG00000010679	EFL1	84	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000015607	-	60	94.340	ENSMEUG00000012049	-	51	94.340	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000015607	-	61	96.296	ENSOPRG00000001514	-	100	96.471	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000015607	-	96	91.616	ENSODEG00000016193	EFL1	86	95.000	Octodon_degus
ENSCJAG00000015607	-	93	92.857	ENSONIG00000003394	efl1	84	92.857	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000015607	-	93	99.206	ENSOCUG00000012163	EFL1	85	99.206	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000015607	-	57	89.516	ENSORLG00000020390	efl1	78	89.683	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000015607	-	56	78.000	ENSORLG00000029029	-	72	80.769	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000015607	-	93	90.476	ENSORLG00015012031	efl1	86	90.476	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000015607	-	93	89.683	ENSOMEG00000022784	efl1	86	89.683	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSOARG00000014452	EFL1	84	100.000	Ovis_aries
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ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSPPAG00000039672	EFL1	85	100.000	Pan_paniscus
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ENSCJAG00000015607	-	100	82.222	ENSPTRG00000050545	-	97	86.803	Pan_troglodytes
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ENSCJAG00000015607	-	93	100.000	ENSPANG00000015635	-	95	89.023	Papio_anubis
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