EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000016231 (Gene tree)
Gene ID: 100397707
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger matrin-type 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6052 bases
Position: chrNTIC01011112.1:162631036-162637087
Accession: 100397707
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000029887	zf-U1	PF06220.12	0.00037	1	1
ENSCJAP00000029887	zf-met	PF12874.7	3.7e-06	1	1
ENSCJAP00000029887	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000031583	-	600	-	ENSCJAP00000029887	199 (aa)	XP_002744293	F7INW3

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000016231	-	100	98.492	ENSCJAG00000021456	-	100	98.492

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSG00000146007	ZMAT2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSAPOG00000004818	zmat2	100	88.060	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSAMEG00000010766	ZMAT2	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000016231	-	99	88.384	ENSACIG00000007914	zmat2	99	88.384	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSAOCG00000016267	zmat2	100	88.060	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSAPEG00000008887	zmat2	100	88.060	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000016231	-	100	89.055	ENSATEG00000009724	zmat2	100	89.055	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000016231	-	100	97.990	ENSACAG00000012747	ZMAT2	100	97.990	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSANAG00000028921	ZMAT2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000016231	-	65	74.242	ENSACLG00000015635	-	94	74.242	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000016231	-	100	87.562	ENSACLG00000000982	zmat2	100	87.562	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000016231	-	100	87.562	ENSACLG00000001243	zmat2	100	87.562	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000016231	-	100	92.965	ENSAMXG00000042537	zmat2	100	92.965	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSBTAG00000005441	ZMAT2	100	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCAFG00000005907	ZMAT2	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCAFG00020000423	ZMAT2	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000016231	-	97	100.000	ENSCHIG00000014775	ZMAT2	97	100.000	Capra_hircus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSTSYG00000035442	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000016231	-	100	80.402	ENSTSYG00000032797	-	100	80.402	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000016231	-	100	99.497	ENSCPOG00000037729	ZMAT2	100	99.497	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCCAG00000024723	ZMAT2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCLAG00000017314	ZMAT2	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCSAG00000012639	ZMAT2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000016231	-	78	91.026	ENSCHOG00000007795	ZMAT2	93	95.890	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000016231	-	100	98.492	ENSCPBG00000007718	ZMAT2	100	98.492	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000016231	-	54	65.741	ENSCING00000016227	-	99	65.741	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000016231	-	75	72.368	ENSCSAVG00000008239	-	94	67.368	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCANG00000039567	ZMAT2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCGRG00001023749	Zmat2	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSCGRG00000013756	Zmat2	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000016231	-	100	86.070	ENSCSEG00000006694	zmat2	91	86.070	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000016231	-	100	88.557	ENSCVAG00000003489	zmat2	100	88.557	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000016231	-	100	90.955	ENSDARG00000004956	zmat2	100	90.955	Danio_rerio
ENSCJAG00000016231	-	62	100.000	ENSDNOG00000015171	ZMAT2	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000016231	-	100	77.889	ENSDORG00000014559	Zmat2	100	73.367	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000016231	-	94	64.398	FBgn0035520	CG11586	96	68.063	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000016231	-	100	96.985	ENSETEG00000005406	-	100	96.985	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000016231	-	58	73.043	ENSEBUG00000015463	-	65	71.429	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSEASG00005018047	ZMAT2	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSECAG00000014412	ZMAT2	100	100.000	Equus_caballus
ENSCJAG00000016231	-	76	100.000	ENSEEUG00000007861	ZMAT2	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000016231	-	97	90.722	ENSELUG00000021857	zmat2	99	89.268	Esox_lucius
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSFCAG00000001289	ZMAT2	100	100.000	Felis_catus
ENSCJAG00000016231	-	100	88.442	ENSFALG00000014244	-	100	88.442	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000016231	-	98	97.949	ENSFALG00000008988	-	98	97.949	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSFDAG00000008372	ZMAT2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSFHEG00000016999	zmat2	100	88.060	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000016231	-	76	88.387	ENSGMOG00000003032	zmat2	99	88.235	Gadus_morhua
ENSCJAG00000016231	-	100	97.990	ENSGALG00000041746	ZMAT2	100	97.990	Gallus_gallus
ENSCJAG00000016231	-	100	87.562	ENSGAFG00000009807	zmat2	100	87.562	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000016231	-	100	88.557	ENSGACG00000020892	zmat2	100	88.557	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000016231	-	100	97.487	ENSGAGG00000008849	ZMAT2	100	97.487	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSGGOG00000005121	ZMAT2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000016231	-	100	78.713	ENSHBUG00000019195	zmat2	100	78.713	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000016231	-	75	75.658	ENSHBUG00000021068	-	91	77.348	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000016231	-	99	80.676	ENSHBUG00000021112	-	99	80.676	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000016231	-	100	99.497	ENSHGLG00000008187	-	100	99.497	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000016231	-	100	99.497	ENSHGLG00100002997	-	100	99.497	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000016231	-	100	87.065	ENSHCOG00000002199	zmat2	90	87.065	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000016231	-	100	90.452	ENSIPUG00000024080	Zmat2	100	90.452	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSSTOG00000002025	ZMAT2	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000016231	-	100	99.497	ENSJJAG00000003703	-	100	99.497	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000016231	-	100	87.562	ENSKMAG00000005411	zmat2	100	87.562	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000016231	-	100	87.065	ENSLBEG00000002013	zmat2	100	87.065	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000016231	-	100	94.472	ENSLACG00000001030	ZMAT2	100	94.472	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000016231	-	100	92.965	ENSLOCG00000011219	zmat2	85	92.965	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSLAFG00000018601	ZMAT2	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMFAG00000037329	ZMAT2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMMUG00000004484	ZMAT2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMNEG00000031600	ZMAT2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMLEG00000041320	ZMAT2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSMAMG00000022430	zmat2	100	88.060	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000016231	-	100	87.562	ENSMZEG00005027828	zmat2	100	87.562	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000016231	-	100	85.572	ENSMZEG00005001274	-	100	85.572	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000016231	-	99	96.970	ENSMGAG00000000843	ZMAT2	99	96.970	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000016231	-	100	75.369	ENSMAUG00000016579	Zmat2	100	75.862	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMICG00000042843	ZMAT2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000016231	-	100	93.970	ENSMOCG00000012659	Zmat2	100	93.970	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000016231	-	100	88.557	ENSMMOG00000016831	zmat2	100	88.557	Mola_mola
ENSCJAG00000016231	-	100	98.995	ENSMODG00000011277	-	100	98.995	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000016231	-	100	99.497	ENSMODG00000011269	-	100	99.497	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000016231	-	99	88.500	ENSMALG00000009668	zmat2	99	88.500	Monopterus_albus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0022140	Zmat2	100	100.000	Mus_caroli
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMUSG00000001383	Zmat2	100	100.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018874	Zmat2	100	100.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0023052	Zmat2	100	100.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSMPUG00000008383	ZMAT2	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000016231	-	100	98.492	ENSMLUG00000017525	ZMAT2	100	98.492	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000016231	-	100	99.497	ENSNGAG00000009406	Zmat2	100	99.497	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000016231	-	100	87.562	ENSNBRG00000017902	zmat2	100	87.562	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000016231	-	100	63.819	ENSNLEG00000009450	-	95	63.158	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000016231	-	76	99.342	ENSMEUG00000001757	ZMAT2	100	99.342	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSODEG00000002444	ZMAT2	100	100.000	Octodon_degus
ENSCJAG00000016231	-	100	86.634	ENSONIG00000017873	zmat2	100	86.634	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000016231	-	86	99.419	ENSOANG00000007213	ZMAT2	100	99.419	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSOCUG00000004255	ZMAT2	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000016231	-	100	88.557	ENSORLG00000024293	zmat2	100	88.557	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000016231	-	100	88.557	ENSORLG00020003239	zmat2	100	88.557	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSORLG00015007715	zmat2	100	88.060	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000016231	-	100	88.060	ENSOMEG00000017427	zmat2	93	88.060	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSOGAG00000002054	ZMAT2	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSOARG00000018690	ZMAT2	100	100.000	Ovis_aries
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSPPAG00000034165	ZMAT2	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSPPRG00000004163	ZMAT2	100	100.000	Panthera_pardus
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSPTIG00000008652	ZMAT2	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000016231	-	100	100.000	ENSPTRG00000017327	ZMAT2	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000016231	-	100	91.457	ENSPANG00000032021	ZMAT2	100	90.452	Papio_anubis
ENSCJAG00000016231	-	100	91.960	ENSPKIG00000017778	zmat2	100	91.960	Paramormyrops_kingsleyae
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