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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000016409 (Gene tree)
Gene ID: 100413875
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 87410 bases
Position: chrNTIC01011112.1:66674925-66762334
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000030345	IBN_N	PF03810.19	8.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000032048	TNPO1-202	2547	-	ENSCJAP00000030328	848 (aa)	-	F6XIR9
ENSCJAT00000032066	TNPO1-201	3350	-	ENSCJAP00000030345	898 (aa)	-	U3BCG9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	84.392	ENSCJAG00000005096	TNPO2	99	84.392

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.666	Homo_sapiens
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.483	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.483	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	98.670	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.506	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.506	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.596	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.596	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.596	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.596	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.146	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	98	92.334	ENSAPLG00000009619	-	97	93.333	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	96.404	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.404	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	88.753	ENSANAG00000025351	-	100	88.753	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	64.199	ENSANAG00000027118	-	99	63.978	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.889	ENSANAG00000022453	-	100	99.889	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.236	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.377	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.040	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.443	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.443	Bos_taurus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	96.517	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	Capra_hircus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	95.367	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.889	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.889	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.666	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.220	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.555	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	94	86.777	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.419	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.419	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	75.196	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.196	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	99.298	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.298	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.910	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.910	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.921	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.256	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.919	Danio_rerio
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.415	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.415	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	92	99.398	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	98.502	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000016409	TNPO1	94	84.762	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.666	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.443	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.443	Equus_caballus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	86.275	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.683	Esox_lucius
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.666	Felis_catus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.079	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.079	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.266	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.266	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	89.632	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.632	Gadus_morhua
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	95.991	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.404	Gallus_gallus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.040	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.617	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.191	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.191	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.666	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.809	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.809	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	98.998	ENSHGLG00000000970	-	100	98.998	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	98.832	ENSHGLG00100017090	-	99	98.832	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	75.167	ENSHGLG00100000963	-	100	74.610	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.329	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.258	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	90	89.766	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.766	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	88.837	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	94.966	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	94.966	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.666	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.666	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.666	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.146	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.584	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.584	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.219	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	95.521	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.217	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.217	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.268	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.268	Mola_mola
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.234	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.135	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.135	Monopterus_albus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.109	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.220	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.109	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.555	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.377	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.377	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.666	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000016409	TNPO1	91	93.272	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	98.998	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	Octodon_degus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.889	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.889	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	91	97.561	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.561	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	92.874	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.348	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.672	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.785	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.672	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.555	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.443	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	Ovis_aries
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.666	Pan_paniscus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.666	Panthera_pardus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.666	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000016409	TNPO1	93	86.740	ENSPTRG00000047731	-	100	86.740	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.666	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.666	Papio_anubis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	90.449	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	96.659	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.659	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	90.236	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	99.298	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.978	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.833	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.833	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.833	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.833	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.034	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.034	Poecilia_mexicana
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