EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000016599 (Gene tree)
Gene ID: 100412034
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 55167 bases
Position: chrNTIC01000002.1:3193081-3248247
Accession: 100412034
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000030698	ResIII	PF04851.15	1.1e-07	1	1
ENSCJAP00000030712	ResIII	PF04851.15	1.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000032441	SBNO1-202	2247	-	ENSCJAP00000030698	748 (aa)	-	F6Z6C9
ENSCJAT00000032457	SBNO1-201	4182	-	ENSCJAP00000030712	1393 (aa)	XP_002753181	F6Y413

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.923	ENSG00000139697	SBNO1	100	98.923	Homo_sapiens
ENSCJAG00000016599	SBNO1	82	81.083	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.255	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.779	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.779	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.384	ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.437	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.930	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.140	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.930	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	75.140	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.770	ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.840	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	91.744	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.750	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	87.074	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.074	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	99.426	ENSANAG00000029958	-	100	99.426	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.087	ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.180	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	79.374	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	79.659	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.989	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	97.989	Bos_taurus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.921	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	97.921	Canis_familiaris
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.200	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	97.200	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.773	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	98.551	Capra_hircus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.277	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.277	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000016599	SBNO1	96	97.446	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	99.096	Cavia_aperea
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.770	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	99.096	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	99.057	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	95.194	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	96.976	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	99.819	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.128	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	99.096	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000016599	SBNO1	83	99.568	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	99.568	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	96	94.231	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.231	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	91.894	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	91.750	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	93.620	ENSCANG00000042688	-	100	93.620	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.985	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	98.192	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.985	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	98.192	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.471	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	75.493	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.474	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	76.037	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	78.801	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.515	Danio_rerio
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.745	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	97.533	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	83.548	ENSDORG00000015261	Sbno1	100	83.548	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000016599	SBNO1	93	90.282	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000016599	SBNO1	98	63.503	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.349	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000016599	SBNO1	90	98.220	ENSEASG00005012595	-	92	98.220	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.277	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	98.277	Equus_caballus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	83	98.352	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	98.352	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	77.989	ENSELUG00000002886	sbno1	99	78.059	Esox_lucius
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	98.348	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	98.348	Felis_catus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	91.888	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	91.966	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	95.259	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.259	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	76.096	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.130	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	94	78.082	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.436	Gadus_morhua
ENSCJAG00000016599	SBNO1	97	87.402	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.883	Gallus_gallus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.899	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.144	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	94	78.871	ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.566	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	97	94.662	ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.961	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.923	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	98.923	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000016599	SBNO1	98	73.181	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.746	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.985	ENSHGLG00000014165	-	100	96.985	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000016599	SBNO1	91	84.783	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	71.207	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	78.622	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.521	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.990	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.277	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.344	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	97.344	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.653	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	75.935	Kryptolebias_marmoratus
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ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.546	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	75.687	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	91.816	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	91.894	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000016599	SBNO1	89	96.833	ENSMAUG00000004834	-	100	96.833	Mesocricetus_auratus
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ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	93.687	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	98.553	Microtus_ochrogaster
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ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.245	ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.402	Monopterus_albus
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ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.342	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	97.134	Mus_musculus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.342	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	96.833	Mus_pahari
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.126	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	97.134	Mus_spretus
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ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.709	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.975	Nomascus_leucogenys
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ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	94.265	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.194	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.128	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	99.096	Octodon_degus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.510	ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.736	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	98	96.207	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.207	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.895	ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.927	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.018	ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.877	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.018	ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.947	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.405	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.335	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000016599	SBNO1	89	93.825	ENSOGAG00000010781	-	100	94.277	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	97.561	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.561	Ovis_aries
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.780	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	98.780	Pan_paniscus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	98.348	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.348	Panthera_pardus
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.134	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.134	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.851	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	98.851	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.780	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	99.819	Papio_anubis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	80.272	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.500	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	90.994	ENSPSIG00000009572	-	100	90.994	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	97	83.594	ENSPSIG00000009256	-	100	87.490	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000016599	SBNO1	63	82.158	ENSPMGG00000017196	sbno1	93	82.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
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