EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000017604 (Gene tree)
Gene ID: 100403216
Gene Symbol: ARF5
Alias: -
Full Name: ADP ribosylation factor 5
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3399 bases
Position: chrNTIC01002224.1:115043268-115046666
Accession: 100403216
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000032489	MMR_HSR1	PF01926.23	4.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000034337	ARF5-201	1107	-	ENSCJAP00000032489	180 (aa)	XP_002752092	F7HBX3

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	78.889	ENSCJAG00000020800	-	99	78.889
ENSCJAG00000017604	ARF5	94	34.225	ENSCJAG00000010382	ARFRP1	88	39.091
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	45.000	ENSCJAG00000040846	ARL5A	100	45.000
ENSCJAG00000017604	ARF5	96	31.609	ENSCJAG00000046554	ARL8B	94	31.609
ENSCJAG00000017604	ARF5	92	44.242	ENSCJAG00000040244	ARL3	91	44.242
ENSCJAG00000017604	ARF5	92	59.394	ENSCJAG00000001966	ARL1	99	58.333
ENSCJAG00000017604	ARF5	96	31.034	ENSCJAG00000005865	ARL8A	94	31.034
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	44.444	ENSCJAG00000039276	ARL5B	99	44.444
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	90.000	ENSCJAG00000040282	ARF4	100	90.000
ENSCJAG00000017604	ARF5	92	38.922	ENSCJAG00000022614	ARL11	85	38.922
ENSCJAG00000017604	ARF5	95	46.328	ENSCJAG00000042179	ARL4C	88	46.328
ENSCJAG00000017604	ARF5	83	35.526	ENSCJAG00000012332	ARL10	62	35.526
ENSCJAG00000017604	ARF5	92	46.988	ENSCJAG00000044597	-	90	46.988
ENSCJAG00000017604	ARF5	72	30.147	ENSCJAG00000009933	-	67	30.147
ENSCJAG00000017604	ARF5	91	37.725	ENSCJAG00000008542	ARL6	91	37.931
ENSCJAG00000017604	ARF5	91	42.012	ENSCJAG00000010785	ARL4D	84	42.012
ENSCJAG00000017604	ARF5	84	82.895	ENSCJAG00000041786	-	87	82.895

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSG00000004059	ARF5	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	86.034	ENSAPOG00000000667	-	99	86.034	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSAMEG00000004635	ARF5	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	69.444	ENSACIG00000014610	zgc:110286	100	69.444	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.111	ENSACIG00000005843	arf5	100	91.111	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	87.709	ENSACIG00000000467	-	99	87.709	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	86.034	ENSAOCG00000008113	-	99	86.034	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	90.000	ENSAOCG00000023329	arf5	100	90.000	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	86.034	ENSAPEG00000003087	-	99	86.034	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	90.000	ENSAPEG00000024614	arf5	100	90.000	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	86.592	ENSATEG00000001302	-	99	86.592	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.111	ENSATEG00000003053	ARF5	100	91.111	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSANAG00000026446	ARF5	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSACLG00000005705	arf5	100	91.667	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	87.151	ENSACLG00000025604	-	99	87.151	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSAMXG00000031467	arf4a	100	91.667	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSAMXG00000031774	ARF5	100	91.667	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	93.333	ENSAMXG00000038224	-	100	93.333	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	93.889	ENSAMXG00000004249	-	100	93.889	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSBTAG00000009366	ARF5	100	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	84.916	WBGene00000183	arf-3	99	84.916	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	84.112	ENSCAFG00020021629	ARF5	100	84.112	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSCHIG00000018906	ARF5	100	100.000	Capra_hircus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	97.238	ENSCPOG00000006239	ARF5	100	97.238	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSCCAG00000027943	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSCATG00000010217	ARF5	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSCLAG00000007930	ARF5	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSCSAG00000010208	ARF5	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	77.095	ENSCING00000004846	-	99	77.095	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	74.033	ENSCSAVG00000001959	-	99	74.033	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000017604	ARF5	89	98.137	ENSCANG00000037234	ARF5	98	98.137	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSCGRG00001024919	Arf5	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	86.667	ENSCSEG00000006004	arf5	100	86.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	87.709	ENSCVAG00000011381	-	99	87.709	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSCVAG00000009124	ARF5	100	91.667	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSCVAG00000007314	-	100	91.667	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSDARG00000045989	arf4a	100	91.667	Danio_rerio
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	71.271	ENSDARG00000074210	ARF5	89	71.271	Danio_rerio
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	93.889	ENSDARG00000113899	zgc:77650	100	93.889	Danio_rerio
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	93.333	ENSDARG00000070472	arf5	100	93.333	Danio_rerio
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSDORG00000000325	Arf5	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	83.889	FBgn0013749	Arf102F	100	83.889	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000017604	ARF5	97	96.571	ENSETEG00000009275	ARF5	100	96.571	Echinops_telfairi
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.111	ENSFHEG00000023119	arf5	100	91.111	Fundulus_heteroclitus
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	88.889	ENSGMOG00000008747	arf5	100	88.889	Gadus_morhua
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	89.444	ENSGACG00000000686	arf5	100	89.444	Gasterosteus_aculeatus
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSGGOG00000016749	ARF5	100	100.000	Gorilla_gorilla
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSHBUG00000008546	arf5	100	91.667	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	98.333	ENSHGLG00100006040	ARF5	60	98.333	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	83.799	ENSHCOG00000015577	-	100	83.799	Hippocampus_comes
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	93.889	ENSIPUG00000004159	Arf5	100	93.889	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	92.778	ENSIPUG00000004215	arf5	100	92.778	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	71.111	ENSIPUG00000006913	-	70	71.111	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSSTOG00000002104	ARF5	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSJJAG00000005105	Arf5	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	87.709	ENSKMAG00000012816	-	99	87.709	Kryptolebias_marmoratus
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	85.000	ENSLBEG00000012002	-	99	85.000	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSLAFG00000011469	ARF5	100	100.000	Loxodonta_africana
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	91.667	ENSMZEG00005015033	arf5	67	91.667	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSMAUG00000014825	Arf5	100	100.000	Mesocricetus_auratus
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSMOCG00000022861	Arf5	100	100.000	Microtus_ochrogaster
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ENSCJAG00000017604	ARF5	99	68.715	ENSMALG00000022638	zgc:110286	100	68.715	Monopterus_albus
ENSCJAG00000017604	ARF5	99	87.709	ENSMALG00000006020	-	99	87.709	Monopterus_albus
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ENSCJAG00000017604	ARF5	100	100.000	ENSMPUG00000006675	ARF5	100	100.000	Mustela_putorius_furo
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