EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000018718 (Gene tree)
Gene ID: 100409330
Gene Symbol: SUB1
Alias: PC4|p14|p15
Full Name: SUB1 homolog%2C transcriptional regulator
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9817 bases
Position: chrNTIC01011112.1:32804353-32814169
Accession: 19985
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000034790	PC4	PF02229.16	1.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000036740	SUB1-201	315	-	ENSCJAP00000034790	104 (aa)	-	F7I1C7
ENSCJAT00000074884	SUB1-202	255	-	ENSCJAP00000064921	84 (aa)	-	A0A2R8PJ43

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSG00000113387	SUB1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	72.549	ENSAPOG00000005917	SUB1	80	67.647	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSAMEG00000006238	SUB1	76	99.020	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	68.627	ENSACIG00000015976	sub1b	80	67.647	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000018718	SUB1	88	68.132	ENSAOCG00000007313	-	62	75.325	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000018718	SUB1	95	69.697	ENSAOCG00000002323	-	68	71.084	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	65.049	ENSAPEG00000017151	-	64	71.084	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	69.608	ENSAPEG00000024347	sub1b	80	68.627	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	68.627	ENSATEG00000010340	sub1b	80	67.647	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	77.064	ENSACAG00000007974	SUB1	81	74.312	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSANAG00000011651	-	80	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	94.118	ENSANAG00000023392	-	66	94.118	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	74.510	ENSACLG00000016875	sub1b	51	69.608	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	77.451	ENSAMXG00000037104	sub1b	80	72.549	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSBTAG00000021965	SUB1	80	99.020	Bos_taurus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSCAFG00000018879	-	71	99.020	Canis_familiaris
ENSCJAG00000018718	SUB1	87	94.444	ENSCAFG00000024488	-	66	93.976	Canis_familiaris
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSCAFG00000016713	-	77	99.020	Canis_familiaris
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSCAFG00020016840	-	80	99.020	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCAFG00020011479	-	61	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCHIG00000008460	SUB1	80	100.000	Capra_hircus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	93.137	ENSTSYG00000035366	-	68	93.137	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSTSYG00000029948	-	80	100.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	91.429	ENSTSYG00000014069	-	75	91.429	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCPOG00000031334	SUB1	80	100.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	95.098	ENSCCAG00000020604	-	80	95.098	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	96.078	ENSCCAG00000033751	-	77	96.078	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	91.176	ENSCCAG00000017043	-	74	91.176	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCCAG00000023605	-	80	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCATG00000031199	SUB1	80	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.029	ENSCLAG00000007522	SUB1	80	99.029	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCSAG00000017172	-	80	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	95.098	ENSCSAG00000019449	-	80	95.098	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	88.235	ENSCPBG00000024218	SUB1	63	85.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000018718	SUB1	97	76.238	ENSCANG00000028665	-	69	76.238	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSCANG00000029372	SUB1	80	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	94.118	ENSCGRG00001003473	-	80	94.118	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	73.529	ENSCGRG00001016254	-	79	73.529	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	74.510	ENSCGRG00001014660	-	80	74.510	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	78.431	ENSCGRG00000001489	-	79	78.431	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	94.118	ENSCGRG00000001133	-	80	94.118	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	74.510	ENSCGRG00000019368	-	80	74.510	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	69.608	ENSDARG00000007720	sub1b	80	62.745	Danio_rerio
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	75.490	ENSDARG00000053446	sub1a	80	74.510	Danio_rerio
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	96.078	ENSDNOG00000040794	-	80	96.078	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	94.118	ENSDNOG00000032396	-	80	94.118	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	96.078	ENSDORG00000013916	Sub1	80	96.078	Dipodomys_ordii
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ENSCJAG00000018718	SUB1	75	96.154	ENSEEUG00000000436	SUB1	75	96.154	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSFCAG00000037288	SUB1	80	99.020	Felis_catus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	87.255	ENSFALG00000002143	SUB1	70	87.255	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	100.000	ENSFDAG00000017179	SUB1	80	100.000	Fukomys_damarensis
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	71.569	ENSGACG00000003912	sub1b	80	65.686	Gasterosteus_aculeatus
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	70.588	ENSHCOG00000001809	sub1b	80	63.725	Hippocampus_comes
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	72.115	ENSIPUG00000024367	SUB1	80	67.308	Ictalurus_punctatus
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	70.588	ENSLBEG00000010728	sub1b	80	69.608	Labrus_bergylta
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	98.039	ENSLAFG00000032088	-	80	98.039	Loxodonta_africana
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	97.059	ENSMLEG00000030509	-	76	97.059	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000018718	SUB1	97	74.257	ENSMLEG00000043436	-	69	74.257	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	66.667	ENSMAMG00000018428	sub1b	80	65.686	Mastacembelus_armatus
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	47.059	ENSMGAG00000001200	-	76	47.059	Meleagris_gallopavo
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	93.137	ENSMOCG00000018930	-	80	93.137	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	79.130	ENSMODG00000020410	SUB1	82	76.522	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	71.569	ENSMALG00000007163	sub1b	65	73.529	Monopterus_albus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	94.118	MGP_CAROLIEiJ_G0019676	Sub1	80	94.118	Mus_caroli
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	93.137	ENSMUSG00000022205	Sub1	80	93.137	Mus_musculus
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	94.118	MGP_PahariEiJ_G0016056	Sub1	80	94.118	Mus_pahari
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	93.137	MGP_SPRETEiJ_G0020573	Sub1	80	93.137	Mus_spretus
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	92.157	ENSMLUG00000009236	-	76	92.157	Myotis_lucifugus
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ENSCJAG00000018718	SUB1	98	99.020	ENSNLEG00000018383	-	76	99.020	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000018718	SUB1	98	88.235	ENSMEUG00000007770	SUB1	80	85.294	Notamacropus_eugenii
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