EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000019724 (Gene tree)
Gene ID: 100385574
Gene Symbol: ZMAT1
Alias: KIAA1789
Full Name: zinc finger matrin-type 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39480 bases
Position: chrNTIC01038833.1:27376737-27416216
Accession: 29377
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000036650	zf-met	PF12874.7	2.7e-14	1	3
ENSCJAP00000036650	zf-met	PF12874.7	2.7e-14	2	3
ENSCJAP00000036650	zf-met	PF12874.7	2.7e-14	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000038708	ZMAT1-201	1791	-	ENSCJAP00000036650	596 (aa)	-	F6TLJ0
ENSCJAT00000038712	ZMAT1-202	2672	-	ENSCJAP00000036654	465 (aa)	-	F6TLC7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	91.472	ENSG00000166432	ZMAT1	94	91.472	Homo_sapiens
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	79.402	ENSAMEG00000004976	ZMAT1	100	79.402	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	94.631	ENSANAG00000028725	ZMAT1	100	94.631	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	60.465	ENSBTAG00000003601	ZMAT1	100	72.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	79.070	ENSCAFG00000017730	ZMAT1	100	79.070	Canis_familiaris
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	78	79.830	ENSCAFG00020007319	ZMAT1	100	79.830	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	78	77.590	ENSCHIG00000010507	ZMAT1	100	77.590	Capra_hircus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	77.280	ENSTSYG00000007330	ZMAT1	100	77.280	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	60.099	ENSCPOG00000000581	ZMAT1	97	60.427	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	95.805	ENSCCAG00000023924	ZMAT1	100	95.805	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	89.816	ENSCATG00000000551	ZMAT1	98	89.816	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	58.541	ENSCLAG00000004197	ZMAT1	97	58.043	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	87.460	ENSCSAG00000009795	ZMAT1	87	87.460	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	90	39.773	ENSCPBG00000001356	ZMAT1	90	53.279	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	90.620	ENSCANG00000037194	ZMAT1	99	90.620	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	59.360	ENSCGRG00001023697	Zmat1	97	59.360	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	59.360	ENSCGRG00000001964	Zmat1	99	59.360	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	94	69.947	ENSDNOG00000014852	-	100	69.947	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	79	56.432	ENSDNOG00000044924	-	99	56.432	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	62.340	ENSDORG00000006821	Zmat1	97	61.859	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	59.000	ENSETEG00000020259	ZMAT1	99	58.167	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	75.626	ENSEASG00005014185	ZMAT1	93	75.626	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	80.233	ENSECAG00000013390	ZMAT1	100	81.953	Equus_caballus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	76.127	ENSFCAG00000023394	ZMAT1	99	76.127	Felis_catus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	62.086	ENSFDAG00000004063	ZMAT1	92	62.252	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	98	40.530	ENSGAGG00000002326	ZMAT1	93	55.372	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	91.304	ENSGGOG00000025784	ZMAT1	95	91.137	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	58.746	ENSHGLG00000002494	ZMAT1	96	58.911	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	61.912	ENSHGLG00100004968	ZMAT1	97	62.075	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	96	68.823	ENSSTOG00000011140	ZMAT1	100	72.356	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	56.891	ENSJJAG00000020188	Zmat1	97	56.891	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	97	61.488	ENSLAFG00000015656	ZMAT1	100	61.983	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	90	84.871	ENSMFAG00000042343	ZMAT1	93	84.871	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	90.484	ENSMMUG00000002151	ZMAT1	95	90.484	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	90.317	ENSMNEG00000036310	ZMAT1	95	90.317	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	89.816	ENSMLEG00000005031	ZMAT1	95	89.816	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	59.520	ENSMAUG00000002941	Zmat1	97	59.520	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	82.500	ENSMICG00000003313	ZMAT1	99	82.363	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	61.028	ENSMOCG00000000169	Zmat1	97	61.028	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	57.416	ENSMUSG00000052676	Zmat1	97	57.416	Mus_musculus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	56.938	MGP_PahariEiJ_G0031943	Zmat1	97	56.938	Mus_pahari
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	57.643	MGP_SPRETEiJ_G0034567	Zmat1	97	57.643	Mus_spretus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	78.740	ENSMPUG00000002130	ZMAT1	99	78.740	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	71.144	ENSMLUG00000004417	ZMAT1	100	71.144	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	60.960	ENSNGAG00000006608	Zmat1	97	60.960	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	85.117	ENSNLEG00000030520	ZMAT1	94	85.117	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	86	63.285	ENSOPRG00000009950	-	100	63.659	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	87	63.534	ENSOCUG00000004164	ZMAT1	93	63.534	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	79.602	ENSOGAG00000033601	ZMAT1	100	79.602	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	76.246	ENSOARG00000001897	ZMAT1	99	76.246	Ovis_aries
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	91.304	ENSPPAG00000039554	ZMAT1	95	91.137	Pan_paniscus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	76.127	ENSPPRG00000005258	ZMAT1	99	76.127	Panthera_pardus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	76.461	ENSPTIG00000019057	ZMAT1	99	76.461	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	91.304	ENSPTRG00000041840	ZMAT1	95	91.137	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	61.022	ENSPEMG00000009944	Zmat1	97	61.022	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	87.291	ENSPPYG00000020561	ZMAT1	93	87.291	Pongo_abelii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	98	62.944	ENSPCAG00000010283	ZMAT1	98	62.944	Procavia_capensis
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	79.900	ENSPCOG00000021386	ZMAT1	99	79.900	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	77.629	ENSPVAG00000013206	ZMAT1	99	77.629	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	57.870	ENSRNOG00000024135	Zmat1	97	57.870	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	89.298	ENSRBIG00000034121	ZMAT1	95	89.298	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	90.317	ENSRROG00000036747	ZMAT1	94	90.317	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	95.470	ENSSBOG00000029970	ZMAT1	100	95.470	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	98	47.148	ENSSHAG00000011087	-	100	47.348	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	63	59.355	ENSSARG00000003063	-	63	59.355	Sorex_araneus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	94	51.515	ENSSPUG00000004951	ZMAT1	92	51.515	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	75.402	ENSSSCG00000012512	ZMAT1	100	78.556	Sus_scrofa
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	94	72.487	ENSTBEG00000012967	ZMAT1	100	72.487	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	77.295	ENSTTRG00000016662	ZMAT1	99	77.167	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	78	80.255	ENSUAMG00000015209	ZMAT1	100	80.255	Ursus_americanus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	78	80.255	ENSUMAG00000000627	ZMAT1	100	80.255	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	99	78.464	ENSVPAG00000006267	ZMAT1	99	78.333	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	100	76.160	ENSVVUG00000005342	ZMAT1	87	76.160	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000019724	ZMAT1	54	81.250	ENSXETG00000001949	krcc1	97	33.962	Xenopus_tropicalis