EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000020009 (Gene tree)
Gene ID: 100389597
Gene Symbol: TRUB2
Alias: CLONE24922
Full Name: TruB pseudouridine synthase family member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14600 bases
Position: chrNTIC01000001.1:40168107-40182706
Accession: 100389597
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000037226	TruB_N	PF01509.18	5.3e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000039316	TRUB2-201	996	-	ENSCJAP00000037226	331 (aa)	XP_009001769	U3ENQ0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000020009	TRUB2	88	30.272	ENSCJAG00000047815	TRUB1	72	30.272

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	90.937	ENSG00000167112	TRUB2	100	90.937	Homo_sapiens
ENSCJAG00000020009	TRUB2	62	58.537	ENSAPOG00000015733	trub2	74	58.537	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	44.604	ENSAPOG00000018284	-	76	61.069	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	84.498	ENSAMEG00000015395	TRUB2	99	84.498	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	54.643	ENSACIG00000016500	trub2	85	54.643	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	57.500	ENSAOCG00000002330	trub2	82	57.500	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	57.857	ENSAPEG00000013177	trub2	82	57.857	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000020009	TRUB2	85	56.028	ENSATEG00000011371	trub2	89	56.028	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	87	59.862	ENSAPLG00000009254	TRUB2	94	60.345	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000020009	TRUB2	88	66.667	ENSACAG00000007331	TRUB2	88	66.667	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000020009	TRUB2	94	96.463	ENSANAG00000036234	TRUB2	100	96.463	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	54.317	ENSACLG00000010793	trub2	84	54.317	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	56.786	ENSAMXG00000031679	trub2	80	56.786	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	50	85.976	ENSBTAG00000004663	TRUB2	100	85.976	Bos_taurus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	53	82.184	ENSBTAG00000055269	-	79	82.184	Bos_taurus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	86.239	ENSCAFG00000020068	TRUB2	99	86.239	Canis_familiaris
ENSCJAG00000020009	TRUB2	54	89.888	ENSCAFG00020017325	-	100	89.888	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	84.098	ENSCHIG00000021160	TRUB2	99	84.098	Capra_hircus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	86.103	ENSTSYG00000034163	TRUB2	100	86.103	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000020009	TRUB2	87	79.861	ENSCAPG00000000223	TRUB2	97	79.861	Cavia_aperea
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	80.308	ENSCPOG00000013535	TRUB2	98	80.308	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	92.615	ENSCCAG00000028463	-	97	92.615	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	93.353	ENSCCAG00000026531	-	100	93.353	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	90.578	ENSCATG00000038234	TRUB2	99	90.578	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	80.556	ENSCLAG00000001702	TRUB2	99	80.308	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	86.364	ENSCSAG00000014117	TRUB2	99	86.364	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	84.404	ENSCHOG00000001555	TRUB2	99	84.404	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000020009	TRUB2	90	65.772	ENSCPBG00000025186	TRUB2	88	65.772	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000020009	TRUB2	87	34.812	ENSCSAVG00000003930	-	90	34.812	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	81.763	ENSCANG00000016135	TRUB2	99	81.763	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	80.060	ENSCGRG00001024441	Trub2	96	84.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	80.060	ENSCGRG00000005633	Trub2	100	80.060	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.197	ENSCSEG00000001331	trub2	83	55.197	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000020009	TRUB2	83	55.957	ENSCVAG00000009901	trub2	83	55.957	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.714	ENSDARG00000028379	trub2	80	55.714	Danio_rerio
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	54.985	ENSDNOG00000043967	-	99	54.985	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	81.957	ENSDNOG00000045679	-	99	81.957	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	80.303	ENSDORG00000016222	Trub2	98	82.258	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000020009	TRUB2	81	32.967	FBgn0033060	CG7849	85	32.967	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000020009	TRUB2	97	80.308	ENSETEG00000009114	TRUB2	99	80.308	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000020009	TRUB2	72	43.421	ENSEBUG00000015723	trub2	82	43.421	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	85.410	ENSEASG00005016819	TRUB2	99	85.410	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	86.018	ENSECAG00000023520	TRUB2	99	86.018	Equus_caballus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	84.242	ENSEEUG00000008908	TRUB2	100	84.242	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	56.997	ENSELUG00000002376	trub2	92	56.997	Esox_lucius
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	86.103	ENSFCAG00000005839	TRUB2	99	86.103	Felis_catus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	90	58.389	ENSFALG00000001364	TRUB2	96	59.060	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	80.428	ENSFDAG00000021374	TRUB2	99	80.428	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	50.357	ENSFHEG00000014655	trub2	83	50.357	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	83	47.101	ENSGMOG00000000981	trub2	92	47.101	Gadus_morhua
ENSCJAG00000020009	TRUB2	87	61.806	ENSGALG00000004920	TRUB2	71	61.806	Gallus_gallus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	56.115	ENSGAFG00000010107	trub2	87	53.584	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	56.940	ENSGACG00000001476	trub2	84	56.940	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	88	68.041	ENSGAGG00000022872	TRUB2	86	68.041	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	91.541	ENSGGOG00000014780	TRUB2	100	91.541	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.036	ENSHBUG00000022384	trub2	84	55.036	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	81.346	ENSHGLG00100016548	TRUB2	99	81.346	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	57.500	ENSHCOG00000017748	trub2	86	57.500	Hippocampus_comes
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ENSCJAG00000020009	TRUB2	96	82.445	ENSSTOG00000022617	-	97	82.445	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	74.613	ENSJJAG00000019181	Trub2	97	74.613	Jaculus_jaculus
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ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.000	ENSLBEG00000000907	trub2	83	55.000	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000020009	TRUB2	86	66.434	ENSLACG00000001515	TRUB2	85	66.434	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000020009	TRUB2	87	60.137	ENSLOCG00000000885	trub2	95	60.137	Lepisosteus_oculatus
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ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	89.666	ENSMNEG00000011189	TRUB2	99	89.666	Macaca_nemestrina
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ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	56.475	ENSMAMG00000023643	trub2	92	56.475	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	54.676	ENSMZEG00005016018	trub2	84	54.676	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000020009	TRUB2	60	68.000	ENSMGAG00000003894	TRUB2	100	68.000	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	80.665	ENSMAUG00000010403	Trub2	100	80.665	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	88.415	ENSMICG00000047032	TRUB2	99	88.415	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	91	85.714	ENSMOCG00000014291	Trub2	99	85.714	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	57.651	ENSMMOG00000021674	trub2	86	57.651	Mola_mola
ENSCJAG00000020009	TRUB2	88	76.207	ENSMODG00000005940	TRUB2	98	76.207	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	58.657	ENSMALG00000021231	trub2	84	58.657	Monopterus_albus
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ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	81.269	MGP_SPRETEiJ_G0024286	Trub2	100	81.269	Mus_spretus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	83.587	ENSMPUG00000013206	TRUB2	90	83.587	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	85.139	ENSMLUG00000005256	TRUB2	97	85.139	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	99	81.763	ENSNGAG00000018679	Trub2	99	81.763	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.197	ENSNBRG00000016294	trub2	84	55.197	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	90.634	ENSNLEG00000017556	TRUB2	100	90.634	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000020009	TRUB2	93	75.321	ENSMEUG00000000484	TRUB2	100	75.321	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000020009	TRUB2	100	76.737	ENSOPRG00000001981	TRUB2	98	76.737	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	80.982	ENSODEG00000017292	TRUB2	99	81.056	Octodon_degus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	54.676	ENSONIG00000004230	trub2	84	54.676	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	56	79.144	ENSOANG00000029023	-	83	79.144	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	98	81.846	ENSOCUG00000026296	TRUB2	90	81.957	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.357	ENSORLG00000020011	trub2	84	55.357	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.556	ENSORLG00020011028	trub2	82	55.556	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	55.556	ENSORLG00015007494	trub2	86	55.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000020009	TRUB2	84	57.914	ENSOMEG00000006702	trub2	84	57.914	Oryzias_melastigma
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