EuRBPDB

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Ensembl ID: ENSCJAG00000020133 (Gene tree)
Gene ID: 100392717
Gene Symbol: CELF1
Alias: BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50
Full Name: CUGBP Elav-like family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28300 bases
Position: chrNTIC01001113.1:107684027-107712326
Accession: 100392717
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000037488	RRM_1	PF00076.22	3.4e-52	1	3
ENSCJAP00000037488	RRM_1	PF00076.22	3.4e-52	2	3
ENSCJAP00000037488	RRM_1	PF00076.22	3.4e-52	3	3
ENSCJAP00000048864	RRM_1	PF00076.22	3.7e-52	1	3
ENSCJAP00000048864	RRM_1	PF00076.22	3.7e-52	2	3
ENSCJAP00000048864	RRM_1	PF00076.22	3.7e-52	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000053075	CELF1-202	1545	-	ENSCJAP00000048864	514 (aa)	XP_017833606	F6SMS6
ENSCJAT00000039597	CELF1-201	1515	-	ENSCJAP00000037488	504 (aa)	-	F7AZ03

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000020133	CELF1	51	40.789	ENSCJAG00000012871	-	51	40.789
ENSCJAG00000020133	CELF1	92	44.266	ENSCJAG00000007857	CELF3	89	55.435
ENSCJAG00000020133	CELF1	59	40.741	ENSCJAG00000013725	ELAVL4	74	40.741
ENSCJAG00000020133	CELF1	99	77.186	ENSCJAG00000020663	CELF2	99	78.244
ENSCJAG00000020133	CELF1	57	43.590	ENSCJAG00000005589	ELAVL3	72	42.391
ENSCJAG00000020133	CELF1	64	35.135	ENSCJAG00000017628	PABPC1L	54	35.135
ENSCJAG00000020133	CELF1	51	40.789	ENSCJAG00000022465	-	50	40.789
ENSCJAG00000020133	CELF1	68	41.975	ENSCJAG00000008064	ELAVL2	82	41.975
ENSCJAG00000020133	CELF1	68	45.679	ENSCJAG00000046587	ELAVL1	98	45.679
ENSCJAG00000020133	CELF1	64	32.911	ENSCJAG00000019682	TIAL1	58	32.911
ENSCJAG00000020133	CELF1	93	44.099	ENSCJAG00000018355	-	95	45.125
ENSCJAG00000020133	CELF1	96	41.326	ENSCJAG00000021135	CELF4	95	43.648

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSG00000149187	CELF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	85.193	ENSAPOG00000024000	celf1	100	85.193	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	ENSAMEG00000007596	CELF1	100	99.222	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	82.787	ENSACIG00000023843	celf1	100	81.762	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	85.193	ENSAOCG00000001252	celf1	100	85.193	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000020133	CELF1	98	85.462	ENSAPEG00000002340	celf1	100	85.462	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	82.377	ENSATEG00000010871	celf1	100	81.762	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	94.574	ENSACAG00000002114	CELF1	100	93.969	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.805	ENSANAG00000031770	CELF1	100	99.805	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	84.660	ENSACLG00000010181	-	100	86.345	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000020133	CELF1	98	81.262	ENSAMXG00000020576	celf1	96	80.880	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	98.638	ENSBTAG00000002520	CELF1	100	98.638	Bos_taurus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSCAFG00000008452	CELF1	100	99.416	Canis_familiaris
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSCAFG00020025487	CELF1	100	99.416	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	98.833	ENSCHIG00000024582	CELF1	100	98.833	Capra_hircus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	70.680	ENSCAPG00000006787	CELF1	100	70.291	Cavia_aperea
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	99.795	ENSCPOG00000036381	CELF1	100	99.795	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSCCAG00000033487	CELF1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	100.000	ENSCATG00000040143	CELF1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSCLAG00000011791	CELF1	100	99.611	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSCSAG00000005786	CELF1	100	99.611	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000020133	CELF1	60	100.000	ENSCHOG00000004196	-	68	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	95.930	ENSCPBG00000022914	CELF1	100	96.728	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSCANG00000032689	CELF1	100	99.611	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	ENSCGRG00001011274	Celf1	100	99.222	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	ENSCGRG00000015357	Celf1	100	99.222	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000020133	CELF1	89	80.667	ENSCSEG00000008675	celf1	100	79.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	83.960	ENSDARG00000005315	celf1	100	88.757	Danio_rerio
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.805	ENSDNOG00000009523	CELF1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	88.716	ENSDORG00000013721	Celf1	100	88.716	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000020133	CELF1	69	100.000	ENSETEG00000004507	CELF1	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	92.218	ENSEASG00005010831	CELF1	100	92.218	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSECAG00000007741	CELF1	100	98.638	Equus_caballus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	80.493	ENSEEUG00000009782	CELF1	100	80.903	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	83.826	ENSELUG00000023173	celf1	100	83.135	Esox_lucius
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSFCAG00000002535	CELF1	100	99.416	Felis_catus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	95.543	ENSFALG00000006402	CELF1	100	95.543	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000020133	CELF1	96	98.986	ENSFDAG00000008517	CELF1	100	99.589	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	83.537	ENSGMOG00000012783	celf1	99	83.130	Gadus_morhua
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	95.930	ENSGALG00000008097	CELF1	100	95.930	Gallus_gallus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	74.521	ENSGACG00000014226	celf1	100	73.878	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	96.545	ENSGAGG00000011562	CELF1	100	95.706	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSGGOG00000004106	CELF1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	84.660	ENSHBUG00000017881	celf1	100	85.049	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	90.984	ENSHGLG00000019214	-	100	90.574	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	99.795	ENSHGLG00000006909	-	100	99.795	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	99.795	ENSHGLG00100013863	-	100	99.795	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	93.648	ENSHGLG00100017423	-	100	93.648	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	84.663	ENSHCOG00000000258	celf1	100	84.458	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	82.970	ENSIPUG00000023708	celf1	100	81.980	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSSTOG00000000613	CELF1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSJJAG00000020280	Celf1	100	99.416	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	85.918	ENSLBEG00000018296	celf1	93	85.111	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000020133	CELF1	66	85.000	ENSLBEG00000002047	-	98	82.647	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000020133	CELF1	71	81.522	ENSLACG00000018990	CELF1	92	81.522	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	87.327	ENSLOCG00000005966	celf1	95	86.931	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.027	ENSLAFG00000003484	CELF1	100	99.027	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	100.000	ENSMFAG00000003505	CELF1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSMMUG00000011657	CELF1	100	99.611	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSMNEG00000022558	CELF1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.805	ENSMLEG00000040834	CELF1	100	99.805	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	79.813	ENSMAMG00000010052	celf1	100	82.377	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	84.660	ENSMZEG00005018307	celf1	100	85.049	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000020133	CELF1	98	93.861	ENSMGAG00000010629	CELF1	98	93.861	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	ENSMAUG00000009468	Celf1	100	99.384	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSMICG00000045113	CELF1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSMOCG00000012633	Celf1	100	99.589	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	82.857	ENSMMOG00000015460	celf1	100	77.869	Mola_mola
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	98.152	ENSMODG00000019913	CELF1	100	98.152	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	MGP_CAROLIEiJ_G0023949	Celf1	100	99.589	Mus_caroli
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSMUSG00000005506	Celf1	100	99.589	Mus_musculus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	MGP_PahariEiJ_G0025385	Celf1	100	99.589	Mus_pahari
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	MGP_SPRETEiJ_G0024859	Celf1	100	99.384	Mus_spretus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSMPUG00000003960	CELF1	93	99.416	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	98.839	ENSMLUG00000016631	CELF1	100	98.839	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	97.860	ENSNGAG00000017390	Celf1	100	97.860	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000020133	CELF1	94	55.350	ENSNBRG00000023547	-	85	57.974	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSNLEG00000014638	CELF1	100	99.611	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	97.947	ENSMEUG00000007763	CELF1	100	97.947	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	98.973	ENSOPRG00000003239	-	100	98.973	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	ENSODEG00000015204	CELF1	100	99.611	Octodon_degus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	83.915	ENSONIG00000008300	celf1	100	84.302	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	97.860	ENSOANG00000007896	CELF1	99	97.860	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	ENSOCUG00000001311	CELF1	100	99.222	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	78.571	ENSOMEG00000002381	celf1	100	78.776	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.033	ENSOGAG00000011600	CELF1	100	99.033	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	98.453	ENSOARG00000006924	CELF1	100	98.768	Ovis_aries
ENSCJAG00000020133	CELF1	95	100.000	ENSPPAG00000033870	CELF1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.222	ENSPPRG00000002376	CELF1	100	99.384	Panthera_pardus
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.416	ENSPTIG00000003974	CELF1	100	99.416	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSPTRG00000052299	CELF1	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000020133	CELF1	100	100.000	ENSPANG00000021676	CELF1	100	100.000	Papio_anubis
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