EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000020395 (Gene tree)
Gene ID: 100385611
Gene Symbol: SLTM
Alias: FLJ13213|Met
Full Name: SAFB like transcription modulator
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 54665 bases
Position: chrNTIC01038834.1:114565497-114620161
Accession: 100385611
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000037945	RRM_5	PF13893.6	7.9e-08	1	1
ENSCJAP00000037951	RRM_5	PF13893.6	8e-08	1	1
ENSCJAP00000067575	RRM_5	PF13893.6	8.5e-08	1	1
ENSCJAP00000037945	RRM_1	PF00076.22	1.4e-10	1	1
ENSCJAP00000037951	RRM_1	PF00076.22	1.4e-10	1	1
ENSCJAP00000067575	RRM_1	PF00076.22	1.5e-10	1	1
ENSCJAP00000058417	SAP	PF02037.27	4.2e-11	1	1
ENSCJAP00000037945	SAP	PF02037.27	6.7e-10	1	1
ENSCJAP00000037951	SAP	PF02037.27	6.9e-10	1	1
ENSCJAP00000043431	SAP	PF02037.27	7.7e-10	1	1
ENSCJAP00000067575	SAP	PF02037.27	8.3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000063386	SLTM-202	5070	-	ENSCJAP00000043431	898 (aa)	-	F7IAD2
ENSCJAT00000040090	SLTM-203	3105	-	ENSCJAP00000037951	1034 (aa)	XP_003733933	F6UP87
ENSCJAT00000081503	SLTM-201	5658	-	ENSCJAP00000067575	1094 (aa)	-	A0A2R8N082
ENSCJAT00000040084	SLTM-204	3081	-	ENSCJAP00000037945	1026 (aa)	-	F6UQI7
ENSCJAT00000078264	SLTM-205	189	-	ENSCJAP00000058417	62 (aa)	-	A0A2R8P9D1

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000020395's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000020395's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.389	ENSG00000137776	SLTM	100	97.389	Homo_sapiens
ENSCJAG00000020395	SLTM	85	49.791	ENSAPOG00000012346	sltm	99	49.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	93.680	ENSAMEG00000004537	SLTM	100	93.680	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	48.550	ENSACIG00000001971	sltm	99	48.302	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.110	ENSAOCG00000002747	sltm	99	49.008	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.105	ENSAPEG00000012366	sltm	99	49.292	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	50.237	ENSATEG00000003763	sltm	99	50.048	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	78.138	ENSAPLG00000013025	SLTM	58	76.950	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	70.696	ENSACAG00000015120	SLTM	98	71.498	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	100.000	ENSANAG00000037031	SLTM	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.060	ENSACLG00000002523	sltm	99	48.962	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	50.328	ENSAMXG00000012409	sltm	95	51.646	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000020395	SLTM	90	93.233	ENSBTAG00000011319	SLTM	96	93.340	Bos_taurus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	92.270	ENSCAFG00000016586	SLTM	98	92.772	Canis_familiaris
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.257	ENSCAFG00020011253	SLTM	100	93.617	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	93.954	ENSCHIG00000008780	SLTM	98	94.054	Capra_hircus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	95.204	ENSTSYG00000013581	SLTM	95	95.204	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000020395	SLTM	92	74.841	ENSCAPG00000013326	SLTM	96	85.980	Cavia_aperea
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	81.878	ENSCPOG00000026109	SLTM	98	91.260	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	100.000	ENSCCAG00000022982	SLTM	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.292	ENSCATG00000030254	SLTM	100	97.292	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000020395	SLTM	91	89.513	ENSCLAG00000007160	SLTM	100	89.513	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.292	ENSCSAG00000012004	SLTM	100	97.292	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000020395	SLTM	85	92.308	ENSCHOG00000001125	SLTM	100	92.308	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	80.194	ENSCPBG00000006045	SLTM	98	90.909	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	97.245	ENSCANG00000043731	SLTM	100	97.245	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	91.471	ENSCGRG00001022009	Sltm	98	91.552	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	91.735	ENSCGRG00000014806	Sltm	100	91.735	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	48.064	ENSCSEG00000001618	sltm	93	46.906	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000020395	SLTM	68	77.273	ENSDARG00000052728	sltm	94	61.154	Danio_rerio
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	93.346	ENSDNOG00000002975	SLTM	98	93.412	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000020395	SLTM	76	94.131	ENSDORG00000007463	Sltm	89	94.131	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000020395	SLTM	74	90.893	ENSETEG00000008003	SLTM	83	91.037	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	95.074	ENSEASG00005006792	SLTM	98	95.182	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.877	ENSECAG00000011267	SLTM	100	94.165	Equus_caballus
ENSCJAG00000020395	SLTM	86	89.630	ENSEEUG00000000580	SLTM	91	89.630	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	53.872	ENSELUG00000013388	sltm	97	53.491	Esox_lucius
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.985	ENSFCAG00000004826	SLTM	98	94.985	Felis_catus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	77.812	ENSFALG00000012285	SLTM	58	75.868	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	91.531	ENSFDAG00000018075	SLTM	100	91.531	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000020395	SLTM	72	60.417	ENSFHEG00000014764	sltm	70	68.421	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	78.378	ENSGMOG00000015455	sltm	69	68.085	Gadus_morhua
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	50.283	ENSGACG00000015814	sltm	98	50.576	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	80.316	ENSGAGG00000021279	SLTM	97	94.737	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	97.376	ENSGGOG00000015866	SLTM	100	97.376	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.154	ENSHBUG00000012461	sltm	99	49.057	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	75.728	ENSHGLG00000015426	-	61	84.385	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	90.821	ENSHGLG00000018512	-	99	91.650	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000020395	SLTM	73	71.111	ENSHGLG00000000785	-	74	83.051	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	85.742	ENSHGLG00100002674	-	60	90.532	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	74.609	ENSHGLG00100002576	-	61	78.383	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	78.474	ENSHGLG00100001757	-	61	84.219	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020395	SLTM	69	77.778	ENSIPUG00000023201	sltm	91	51.341	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	94.898	ENSSTOG00000000584	SLTM	100	94.898	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	88.986	ENSJJAG00000006970	Sltm	98	88.987	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	46.770	ENSKMAG00000007570	sltm	66	72.414	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	78.378	ENSLBEG00000025472	sltm	59	46.840	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	65.468	ENSLACG00000005234	SLTM	99	64.919	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	58.259	ENSLOCG00000013629	sltm	59	53.140	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	91.347	ENSLAFG00000017922	SLTM	98	91.347	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.389	ENSMFAG00000033354	SLTM	100	97.389	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.389	ENSMMUG00000022200	SLTM	100	97.389	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.195	ENSMNEG00000025105	SLTM	100	97.195	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.195	ENSMLEG00000043355	SLTM	100	97.195	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.811	ENSMAMG00000021391	sltm	99	49.762	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.060	ENSMZEG00005013839	sltm	99	48.962	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000020395	SLTM	96	74.274	ENSMGAG00000005313	SLTM	59	71.672	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000020395	SLTM	90	91.176	ENSMAUG00000014391	Sltm	97	91.525	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.985	ENSMICG00000013069	SLTM	98	94.985	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	91.445	ENSMOCG00000012419	Sltm	98	91.445	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	46.750	ENSMMOG00000016470	sltm	56	42.649	Mola_mola
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	80.547	ENSMODG00000008794	-	98	79.726	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000020395	SLTM	84	61.538	ENSMODG00000020311	-	95	56.928	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.953	ENSMALG00000021474	sltm	99	49.138	Monopterus_albus
ENSCJAG00000020395	SLTM	63	89.744	MGP_CAROLIEiJ_G0032404	Sltm	98	89.381	Mus_caroli
ENSCJAG00000020395	SLTM	74	91.304	ENSMUSG00000032212	Sltm	98	89.774	Mus_musculus
ENSCJAG00000020395	SLTM	63	89.744	MGP_PahariEiJ_G0015268	Sltm	98	89.479	Mus_pahari
ENSCJAG00000020395	SLTM	61	89.474	MGP_SPRETEiJ_G0033542	Sltm	98	89.479	Mus_spretus
ENSCJAG00000020395	SLTM	96	92.369	ENSMPUG00000004229	SLTM	96	92.369	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	91.159	ENSMLUG00000000742	SLTM	100	91.159	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	92.843	ENSNGAG00000012328	Sltm	98	92.920	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	47.909	ENSNBRG00000010183	sltm	91	49.173	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.002	ENSNLEG00000011440	SLTM	100	97.002	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	72.701	ENSMEUG00000015230	SLTM	59	69.294	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	89.746	ENSODEG00000017077	SLTM	99	89.746	Octodon_degus
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	49.060	ENSONIG00000005838	sltm	99	48.338	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000020395	SLTM	89	94.737	ENSOCUG00000003327	SLTM	100	86.489	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	45.385	ENSORLG00000008161	sltm	99	45.034	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	45.481	ENSORLG00020008903	sltm	99	45.192	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	45.192	ENSORLG00015007103	sltm	99	45.279	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000020395	SLTM	56	77.143	ENSOMEG00000002031	-	63	69.643	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000020395	SLTM	81	47.879	ENSOMEG00000002041	sltm	97	47.046	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.789	ENSOGAG00000011297	SLTM	98	94.789	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	92.553	ENSOARG00000020844	SLTM	98	93.215	Ovis_aries
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	95.551	ENSPPAG00000029308	SLTM	100	95.551	Pan_paniscus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.690	ENSPPRG00000012400	SLTM	98	94.690	Panthera_pardus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	94.694	ENSPTIG00000021933	SLTM	95	94.694	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.389	ENSPTRG00000007121	SLTM	100	97.389	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	95.362	ENSPANG00000017193	SLTM	100	95.362	Papio_anubis
ENSCJAG00000020395	SLTM	86	71.154	ENSPKIG00000022760	sltm	99	60.577	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	77.539	ENSPSIG00000005489	SLTM	97	70.617	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	72.973	ENSPMGG00000006037	sltm	50	68.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	90.579	ENSPEMG00000013263	Sltm	98	90.579	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000020395	SLTM	76	40.777	ENSPMAG00000008206	sltm	100	39.515	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	83.773	ENSPCIG00000028356	SLTM	98	85.965	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	46.132	ENSPFOG00000004372	sltm	99	45.312	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	72.973	ENSPLAG00000008000	sltm	99	45.561	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	72.973	ENSPMEG00000006047	sltm	90	46.162	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	72.973	ENSPREG00000023236	sltm	99	46.199	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	95.870	ENSPPYG00000006515	SLTM	98	95.870	Pongo_abelii
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	80.193	ENSPCAG00000013482	SLTM	98	80.452	Procavia_capensis
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	96.774	ENSPCOG00000010624	SLTM	100	96.774	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	92.232	ENSPVAG00000015056	SLTM	98	92.232	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.060	ENSPNYG00000013893	sltm	99	48.962	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000020395	SLTM	77	72.000	ENSPNAG00000020563	sltm	98	53.206	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000020395	SLTM	63	89.744	ENSRNOG00000054446	Sltm	98	89.479	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	97.041	ENSRBIG00000029226	SLTM	99	97.041	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	97.099	ENSRROG00000045301	SLTM	100	97.099	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	100.000	ENSSBOG00000018883	SLTM	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	82.724	ENSSHAG00000015395	SLTM	99	82.927	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	83.784	ENSSFOG00015024086	-	66	78.947	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	48.870	ENSSMAG00000000355	sltm	99	48.243	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000020395	SLTM	83	50.574	ENSSDUG00000018134	sltm	99	48.908	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000020395	SLTM	82	50.997	ENSSLDG00000013907	sltm	99	48.859	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000020395	SLTM	68	83.333	ENSSPUG00000001006	-	53	91.228	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	99	49.170	ENSSPAG00000008130	sltm	99	48.776	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	92.822	ENSSSCG00000004592	SLTM	100	93.863	Sus_scrofa
ENSCJAG00000020395	SLTM	92	76.569	ENSTGUG00000006017	SLTM	57	74.170	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000020395	SLTM	82	47.777	ENSTRUG00000017767	sltm	84	38.936	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	88.367	ENSTBEG00000000945	SLTM	100	87.347	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000020395	SLTM	100	94.681	ENSTTRG00000005246	SLTM	98	94.985	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000020395	SLTM	79	94.789	ENSUAMG00000025901	SLTM	100	94.789	Ursus_americanus
ENSCJAG00000020395	SLTM	66	92.683	ENSUAMG00000006773	-	62	94.737	Ursus_americanus
ENSCJAG00000020395	SLTM	96	93.509	ENSUMAG00000023678	SLTM	100	94.293	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000020395	SLTM	95	93.986	ENSVPAG00000008606	SLTM	100	93.986	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	94.303	ENSVVUG00000001450	SLTM	98	94.499	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000020395	SLTM	98	60.577	ENSXETG00000010840	sltm	50	55.758	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000020395	SLTM	60	72.973	ENSXMAG00000014466	sltm	99	45.854	Xiphophorus_maculatus