EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000020841 (Gene tree)
Gene ID: 100413224
Gene Symbol: RPUSD2
Alias: C15orf19|C18B11|FLJ31409|PUS9
Full Name: RNA pseudouridine synthase domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5104 bases
Position: chrNTIC01038834.1:91610660-91615763
Accession: 100413224
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000038769	PseudoU_synth_2	PF00849.22	1.7e-32	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000040953	RPUSD2-201	1850	XM_009005547	ENSCJAP00000038769	545 (aa)	XP_009003795	U3DPB3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	91.009	ENSG00000166133	RPUSD2	100	91.009	Homo_sapiens
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	57.359	ENSAPOG00000000817	rpusd2	91	53.346	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.303	ENSAMEG00000016996	RPUSD2	100	83.303	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	59.226	ENSACIG00000024029	rpusd2	99	54.600	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	58.079	ENSAOCG00000015237	rpusd2	90	53.846	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	57.860	ENSAPEG00000021763	rpusd2	90	53.654	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	56.118	ENSATEG00000015242	rpusd2	82	55.647	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	78	66.432	ENSAPLG00000004723	RPUSD2	100	66.432	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	66.667	ENSACAG00000013893	RPUSD2	97	63.924	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	96.147	ENSANAG00000009691	RPUSD2	100	96.147	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	57.143	ENSACLG00000019531	rpusd2	83	56.485	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	81	57.700	ENSAMXG00000013376	rpusd2	84	56.335	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	80.616	ENSBTAG00000003193	RPUSD2	99	81.670	Bos_taurus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	74	35.910	WBGene00019498	K07E8.7	97	35.910	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.333	ENSCAFG00000009165	RPUSD2	100	83.333	Canis_familiaris
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.514	ENSCAFG00020005849	RPUSD2	100	83.514	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	81.307	ENSCHIG00000006152	RPUSD2	99	81.307	Capra_hircus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	85.872	ENSTSYG00000012844	RPUSD2	100	85.872	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	53	89.895	ENSCAPG00000006895	-	100	89.895	Cavia_aperea
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	82.714	ENSCPOG00000013201	RPUSD2	99	82.714	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	96.881	ENSCCAG00000024378	RPUSD2	100	96.881	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	90.642	ENSCATG00000043734	RPUSD2	100	90.642	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.853	ENSCLAG00000011862	RPUSD2	100	83.853	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	94	91.585	ENSCSAG00000007538	RPUSD2	100	91.585	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	63	89.213	ENSCHOG00000004834	RPUSD2	63	89.213	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	82	64.706	ENSCPBG00000013419	RPUSD2	89	64.842	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	91.743	ENSCANG00000003659	RPUSD2	100	91.743	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	79.749	ENSCGRG00001009839	Rpusd2	97	79.749	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	79.749	ENSCGRG00000012348	Rpusd2	100	79.749	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	85	55.052	ENSCSEG00000001953	rpusd2	84	55.052	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	59.375	ENSCVAG00000010848	rpusd2	82	58.621	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	92	54.493	ENSDARG00000060992	rpusd2	87	54.528	Danio_rerio
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	81.284	ENSDNOG00000047745	RPUSD2	100	81.284	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	88.736	ENSDORG00000009092	Rpusd2	100	88.736	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	79	48.180	FBgn0051719	RluA-1	63	48.180	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	78	49.420	FBgn0032256	RluA-2	78	49.420	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	77.615	ENSETEG00000008581	RPUSD2	100	77.615	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	77	34.642	ENSEBUG00000012149	rpusd2	98	33.200	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.333	ENSEASG00005016463	RPUSD2	99	83.333	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.514	ENSECAG00000024178	RPUSD2	99	83.514	Equus_caballus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	96	71.893	ENSEEUG00000005132	RPUSD2	96	71.893	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	83	58.635	ENSELUG00000016786	rpusd2	84	58.635	Esox_lucius
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	84.058	ENSFCAG00000040796	RPUSD2	100	84.058	Felis_catus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	79	71.264	ENSFALG00000001122	RPUSD2	96	71.332	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	94	83.757	ENSFDAG00000003070	RPUSD2	100	83.757	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	83	57.918	ENSFHEG00000007518	rpusd2	84	57.918	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	58.889	ENSGMOG00000011014	rpusd2	99	57.084	Gadus_morhua
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	84	65.690	ENSGALG00000041216	RPUSD2	97	65.690	Gallus_gallus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	82	59.471	ENSGAFG00000003390	rpusd2	81	59.471	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	82	54.298	ENSGACG00000008656	rpusd2	91	54.298	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	87	65.010	ENSGAGG00000013098	RPUSD2	93	65.010	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	90.459	ENSGGOG00000006684	RPUSD2	100	90.459	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	56.926	ENSHBUG00000023777	rpusd2	83	56.276	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	82.018	ENSHGLG00000012765	RPUSD2	100	82.018	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	82.018	ENSHGLG00100006653	RPUSD2	100	82.018	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	86	56.098	ENSHCOG00000015587	rpusd2	84	56.098	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	88	55.642	ENSIPUG00000021006	rpusd2	87	55.642	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	82.640	ENSSTOG00000025619	RPUSD2	100	82.640	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	79.450	ENSJJAG00000023160	Rpusd2	100	80.000	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	56.774	ENSKMAG00000006618	rpusd2	87	53.891	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	56.522	ENSLBEG00000021571	rpusd2	90	52.762	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	64.474	ENSLACG00000017338	RPUSD2	100	64.474	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	63.514	ENSLOCG00000014755	rpusd2	92	62.826	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	82.123	ENSLAFG00000015588	RPUSD2	99	82.123	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	90.275	ENSMFAG00000045062	RPUSD2	100	90.275	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	90.459	ENSMMUG00000001483	RPUSD2	100	90.459	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	80.328	ENSMNEG00000041429	RPUSD2	100	80.328	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	78	94.169	ENSMLEG00000036551	RPUSD2	100	94.169	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	55.532	ENSMAMG00000001077	rpusd2	82	54.709	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	57.143	ENSMZEG00005006947	rpusd2	91	56.485	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	84	68.122	ENSMGAG00000003058	RPUSD2	100	68.122	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	81.362	ENSMAUG00000020467	Rpusd2	100	81.362	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	85.846	ENSMICG00000028637	RPUSD2	99	85.846	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	78.712	ENSMOCG00000020061	Rpusd2	99	78.712	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	58.444	ENSMMOG00000012020	rpusd2	82	57.883	Mola_mola
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	86	78.344	ENSMODG00000000300	RPUSD2	87	78.344	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	54.641	ENSMALG00000010024	rpusd2	82	54.049	Monopterus_albus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	77.362	MGP_CAROLIEiJ_G0024130	Rpusd2	100	77.362	Mus_caroli
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	76.827	ENSMUSG00000027324	Rpusd2	100	76.827	Mus_musculus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	77.184	MGP_PahariEiJ_G0025573	Rpusd2	100	77.184	Mus_pahari
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	76.744	MGP_SPRETEiJ_G0025046	Rpusd2	100	76.744	Mus_spretus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	82.523	ENSMPUG00000008517	RPUSD2	100	82.523	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	94	86.550	ENSMLUG00000007971	RPUSD2	100	86.550	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	77.396	ENSNGAG00000014126	Rpusd2	100	77.396	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	58.998	ENSNBRG00000010070	rpusd2	90	54.092	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	90.826	ENSNLEG00000035735	RPUSD2	100	90.826	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	71.612	ENSMEUG00000008500	RPUSD2	100	71.612	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	77.982	ENSOPRG00000014177	-	100	77.982	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	96	86.233	ENSODEG00000017193	RPUSD2	97	86.233	Octodon_degus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	58.998	ENSONIG00000020102	rpusd2	90	58.242	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	83.303	ENSOCUG00000015745	RPUSD2	97	83.303	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	88	56.148	ENSORLG00000015516	rpusd2	89	56.148	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	82	59.251	ENSORLG00020010533	rpusd2	83	59.251	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	82	58.681	ENSORLG00015009206	rpusd2	82	58.681	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	87	54.379	ENSOMEG00000007355	rpusd2	80	54.865	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	96	85.249	ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.249	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	79.525	ENSOARG00000020235	RPUSD2	99	79.492	Ovis_aries
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	91.193	ENSPPAG00000032874	RPUSD2	100	91.193	Pan_paniscus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	84.954	ENSPPRG00000010446	RPUSD2	100	84.954	Panthera_pardus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	84.771	ENSPTIG00000013316	RPUSD2	100	84.771	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	91.193	ENSPTRG00000006924	RPUSD2	100	91.193	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	100	90.275	ENSPANG00000019339	RPUSD2	100	90.275	Papio_anubis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	81	54.669	ENSPKIG00000023017	rpusd2	83	52.432	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	63	65.043	ENSPSIG00000012680	RPUSD2	99	65.043	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	80	58.904	ENSPMGG00000018165	rpusd2	81	57.860	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000020841	RPUSD2	99	80.146	ENSPEMG00000012878	Rpusd2	99	80.146	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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