EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000021113 (Gene tree)
Gene ID: 100387198
Gene Symbol: PPARGC1B
Alias: PERC|PGC1B
Full Name: PPARG coactivator 1 beta
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 114903 bases
Position: chrNTIC01011112.1:153234136-153349038
Accession: 30022
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000039289	RRM_1	PF00076.22	2e-09	1	1
ENSCJAP00000043219	RRM_1	PF00076.22	2.4e-09	1	1
ENSCJAP00000048088	RRM_1	PF00076.22	2.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000057864	PPARGC1B-202	4139	-	ENSCJAP00000043219	1147 (aa)	-	F7ICR5
ENSCJAT00000041508	PPARGC1B-203	3021	-	ENSCJAP00000039289	1007 (aa)	-	F7F1B1
ENSCJAT00000059934	PPARGC1B-201	4256	-	ENSCJAP00000048088	1186 (aa)	-	F7EYF3

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc04931	Insulin resistance	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	91.477	ENSG00000155846	PPARGC1B	100	92.780	Homo_sapiens
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	84.381	ENSAMEG00000005287	PPARGC1B	100	85.203	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	49.598	ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.042	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	46.975	ENSACAG00000015737	PPARGC1B	99	48.026	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	50	45.918	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	58	51.042	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	95.040	ENSANAG00000021830	PPARGC1B	100	97.070	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	82.041	ENSBTAG00000012943	PPARGC1B	100	82.899	Bos_taurus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	84.185	ENSCAFG00000018275	PPARGC1B	100	85.106	Canis_familiaris
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	80.747	ENSCAFG00020023524	PPARGC1B	100	84.925	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	81.649	ENSCHIG00000004409	PPARGC1B	100	82.319	Capra_hircus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	96	76.797	ENSTSYG00000034354	PPARGC1B	100	77.627	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	76.012	ENSCAPG00000008859	PPARGC1B	99	80.104	Cavia_aperea
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	78.958	ENSCPOG00000001958	PPARGC1B	100	79.864	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	94.638	ENSCCAG00000026909	PPARGC1B	100	96.579	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	91.197	ENSCATG00000030402	PPARGC1B	100	94.118	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	77.647	ENSCLAG00000015452	PPARGC1B	100	79.151	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	92.378	ENSCSAG00000011792	PPARGC1B	100	93.600	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	64	88.095	ENSCHOG00000005517	-	68	88.095	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	49.185	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	99	49.714	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	91.494	ENSCANG00000037487	PPARGC1B	100	93.087	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	76.656	ENSCGRG00001017949	Ppargc1b	96	77.578	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	76.297	ENSCGRG00000008387	Ppargc1b	99	77.223	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	51	41.270	ENSDARG00000101569	ppargc1b	74	42.063	Danio_rerio
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	92	82.315	ENSDNOG00000005985	PPARGC1B	99	80.966	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	75.272	ENSDORG00000012605	Ppargc1b	100	79.656	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	82.405	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	100	83.900	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	82.877	ENSECAG00000019769	PPARGC1B	96	79.688	Equus_caballus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	53	37.952	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	57	51.042	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	80	75.652	ENSEEUG00000014903	PPARGC1B	86	76.522	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	65	37.079	ENSELUG00000014929	ppargc1b	79	37.079	Esox_lucius
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	52	38.667	ENSFCAG00000000043	PPARGC1A	55	51.042	Felis_catus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	95	48.896	ENSFALG00000008858	PPARGC1B	99	49.516	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	78.182	ENSFDAG00000008719	PPARGC1B	99	79.523	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	89	74.026	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	98	72.840	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	90.844	ENSGGOG00000009505	PPARGC1B	100	92.192	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	79.212	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	100	80.698	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	74.827	ENSHGLG00100010588	PPARGC1B	100	79.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	65	40.123	ENSIPUG00000001584	Ppargc1b	82	38.365	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	82.759	ENSSTOG00000024758	PPARGC1B	100	84.200	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	76.984	ENSJJAG00000018633	Ppargc1b	100	78.384	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	95	37.475	ENSLACG00000011232	PPARGC1B	77	35.623	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	81	40.157	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	78	44.937	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	80.241	ENSLAFG00000012339	PPARGC1B	99	80.976	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	93.062	ENSMFAG00000042269	PPARGC1B	100	94.146	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	93.062	ENSMMUG00000004749	PPARGC1B	100	94.146	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	92.765	ENSMNEG00000034121	PPARGC1B	100	93.854	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	92.675	ENSMLEG00000040973	PPARGC1B	100	93.794	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	95	45.565	ENSMGAG00000003134	PPARGC1B	86	70.312	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	77.039	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	100	77.290	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	83.036	ENSMICG00000002702	PPARGC1B	100	84.375	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	76.233	ENSMOCG00000014885	Ppargc1b	100	77.282	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	96	57.086	ENSMODG00000009891	PPARGC1B	99	57.875	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	77.688	MGP_CAROLIEiJ_G0022323	Ppargc1b	100	78.016	Mus_caroli
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	77.744	ENSMUSG00000033871	Ppargc1b	100	78.070	Mus_musculus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	76.171	MGP_PahariEiJ_G0019053	Ppargc1b	100	76.641	Mus_pahari
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	77.543	MGP_SPRETEiJ_G0023235	Ppargc1b	100	77.680	Mus_spretus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	83.595	ENSMPUG00000014245	PPARGC1B	100	84.623	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	93	77.301	ENSMLUG00000013169	PPARGC1B	100	77.301	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	53	37.725	ENSMLUG00000016307	PPARGC1A	53	51.908	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	77.007	ENSNGAG00000016998	Ppargc1b	99	78.125	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	88.317	ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	100	89.571	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	75.967	ENSOPRG00000010017	PPARGC1B	99	77.455	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	99	76.977	ENSODEG00000004901	PPARGC1B	100	80.789	Octodon_degus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	96	50.645	ENSOANG00000009368	PPARGC1B	99	53.892	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	96	78.695	ENSOCUG00000013833	PPARGC1B	100	79.093	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	78.730	ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.280	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	79.523	ENSOARG00000005658	PPARGC1B	98	80.431	Ovis_aries
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	97	91.353	ENSPPAG00000035226	PPARGC1B	100	92.693	Pan_paniscus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	85.872	ENSPPRG00000004608	PPARGC1B	100	85.839	Panthera_pardus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	52	38.667	ENSPPRG00000001711	PPARGC1A	55	51.042	Panthera_pardus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	52	38.667	ENSPTIG00000007378	PPARGC1A	55	51.042	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	83.800	ENSPTIG00000007391	PPARGC1B	100	83.833	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	91.576	ENSPTRG00000017403	PPARGC1B	100	92.878	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	92.963	ENSPANG00000009512	PPARGC1B	100	94.049	Papio_anubis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	50.197	ENSPSIG00000008358	PPARGC1B	99	50.426	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	77.129	ENSPEMG00000018822	Ppargc1b	100	78.384	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	88	56.013	ENSPCIG00000020102	PPARGC1B	99	57.008	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	91.774	ENSPPYG00000015938	PPARGC1B	100	93.073	Pongo_abelii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	71	79.400	ENSPCAG00000012171	PPARGC1B	74	88.462	Procavia_capensis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	85.104	ENSPCOG00000024059	PPARGC1B	100	86.413	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	82.312	ENSPVAG00000001308	PPARGC1B	100	83.560	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	51	55.000	ENSPNAG00000023871	ppargc1b	70	55.000	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	77.419	ENSRNOG00000017503	Ppargc1b	100	77.561	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	91.485	ENSRBIG00000036724	PPARGC1B	100	92.908	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	99	91.291	ENSRROG00000029594	PPARGC1B	99	91.391	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	94.340	ENSSBOG00000028738	PPARGC1B	100	95.308	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	57.369	ENSSHAG00000016400	PPARGC1B	99	58.333	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	48.922	ENSSPUG00000019271	PPARGC1B	99	48.396	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	52	38.605	ENSSPAG00000023514	ppargc1a	76	43.350	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	75.317	ENSSSCG00000014437	PPARGC1B	100	76.849	Sus_scrofa
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	95	48.085	ENSTGUG00000000232	PPARGC1B	100	49.010	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	99	82.447	ENSTTRG00000008430	PPARGC1B	100	83.514	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	52	37.333	ENSTTRG00000005327	PPARGC1A	53	51.908	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	83.250	ENSUMAG00000005361	PPARGC1B	99	83.204	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	100	84.185	ENSVVUG00000014358	PPARGC1B	100	85.106	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	53	37.195	ENSXETG00000020468	ppargc1a	55	51.064	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	86	46.197	ENSXETG00000012711	ppargc1b	54	64.474	Xenopus_tropicalis