EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000022076 (Gene tree)
Gene ID: 100411189
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4885 bases
Position: chrNTIC01022223.1:84679559-84684443
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000040740	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	1.3e-17	1	1
ENSCJAP00000040740	Ribosomal_L30	PF00327.20	2.1e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000043061	-	768	-	ENSCJAP00000040740	255 (aa)	-	H9KXR0

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000022076	-	90	43.265	ENSCJAG00000045387	-	98	43.265
ENSCJAG00000022076	-	90	39.592	ENSCJAG00000035175	-	99	39.592
ENSCJAG00000022076	-	93	92.430	ENSCJAG00000004637	-	98	92.430
ENSCJAG00000022076	-	90	40.408	ENSCJAG00000016367	-	98	40.408
ENSCJAG00000022076	-	89	43.621	ENSCJAG00000039031	-	99	43.621
ENSCJAG00000022076	-	96	87.308	ENSCJAG00000023295	-	93	87.308
ENSCJAG00000022076	-	89	43.033	ENSCJAG00000048312	-	97	43.033
ENSCJAG00000022076	-	90	43.265	ENSCJAG00000007686	-	98	43.265
ENSCJAG00000022076	-	89	43.852	ENSCJAG00000045886	-	98	43.852

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000022076	-	93	90.040	ENSG00000146223	RPL7L1	98	90.040	Homo_sapiens
ENSCJAG00000022076	-	90	42.449	ENSG00000147604	RPL7	98	42.449	Homo_sapiens
ENSCJAG00000022076	-	91	43.725	ENSAPOG00000002965	rpl7	100	43.725	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000022076	-	91	57.895	ENSAPOG00000006262	rpl7l1	100	57.895	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000022076	-	82	40.476	ENSAMEG00000001370	-	100	40.476	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022076	-	91	81.781	ENSAMEG00000012791	RPL7L1	100	81.781	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022076	-	93	42.688	ENSAMEG00000001821	-	97	42.688	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022076	-	90	41.463	ENSAMEG00000002828	-	92	41.463	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022076	-	91	55.870	ENSACIG00000010957	rpl7l1	100	55.870	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000022076	-	94	43.529	ENSACIG00000000602	rpl7	100	44.534	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000022076	-	91	57.490	ENSAOCG00000013813	rpl7l1	100	57.490	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000022076	-	91	43.725	ENSAOCG00000013452	rpl7	100	43.725	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000022076	-	91	43.725	ENSAPEG00000021581	RPL7	100	43.725	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022076	-	91	57.490	ENSAPEG00000004499	rpl7l1	100	57.490	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022076	-	91	43.725	ENSAPEG00000022091	rpl7	100	43.725	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022076	-	91	55.870	ENSATEG00000014469	rpl7l1	100	55.870	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000022076	-	91	44.130	ENSATEG00000013417	rpl7	100	44.130	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000022076	-	91	42.276	ENSAPLG00000005601	-	100	42.915	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000022076	-	89	65.145	ENSAPLG00000013503	RPL7L1	93	65.145	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000022076	-	88	61.826	ENSACAG00000029623	RPL7L1	97	61.826	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000022076	-	92	43.426	ENSACAG00000014396	RPL7	95	43.426	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000022076	-	89	43.388	ENSANAG00000023865	-	97	43.388	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022076	-	89	86.283	ENSANAG00000033475	-	99	88.938	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022076	-	90	38.115	ENSANAG00000023767	-	94	38.115	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022076	-	90	41.224	ENSANAG00000036501	-	98	41.224	Aotus_nancymaae
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ENSCJAG00000022076	-	93	84.034	ENSANAG00000021742	-	99	84.034	Aotus_nancymaae
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ENSCJAG00000022076	-	91	55.870	ENSACLG00000017975	rpl7l1	87	55.870	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000022076	-	91	43.725	ENSACLG00000024449	rpl7	94	43.216	Astatotilapia_calliptera
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ENSCJAG00000022076	-	87	45.417	ENSAMXG00000008499	rpl7	96	44.715	Astyanax_mexicanus
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ENSCJAG00000022076	-	56	80.420	ENSBTAG00000054190	-	93	80.420	Bos_taurus
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