EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000022080 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3973 bases
Position: chrNTIC01001113.1:52638417-52642389
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000032209	GTP_EFTU	PF00009.27	5.1e-53	1	1
ENSCJAP00000040744	GTP_EFTU	PF00009.27	5.2e-53	1	1
ENSCJAP00000053829	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-52	1	1
ENSCJAP00000040744	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	5.1e-15	1	1
ENSCJAP00000032209	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	5.2e-15	1	1
ENSCJAP00000040744	GTP_EFTU_D3	PF03143.17	1.8e-29	1	1
ENSCJAP00000032209	GTP_EFTU_D3	PF03143.17	7.7e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000043065	-	1299	-	ENSCJAP00000040744	432 (aa)	-	F7HQ79
ENSCJAT00000067067	-	832	-	ENSCJAP00000053829	215 (aa)	-	A0A2R8P2C9
ENSCJAT00000034048	-	1788	-	ENSCJAP00000032209	430 (aa)	-	F7ET92

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000022080	-	95	89.216	ENSCJAG00000017492	-	91	77.412
ENSCJAG00000022080	-	90	47.179	ENSCJAG00000000368	GSPT2	65	36.256
ENSCJAG00000022080	-	99	90.187	ENSCJAG00000003968	-	99	88.940
ENSCJAG00000022080	-	98	91.274	ENSCJAG00000010227	EEF1A2	92	91.274
ENSCJAG00000022080	-	81	97.701	ENSCJAG00000045759	-	70	97.701
ENSCJAG00000022080	-	97	30.626	ENSCJAG00000006236	TUFM	82	30.626
ENSCJAG00000022080	-	98	96.471	ENSCJAG00000001365	-	92	96.471
ENSCJAG00000022080	-	68	95.918	ENSCJAG00000046706	-	96	95.918
ENSCJAG00000022080	-	91	52.041	ENSCJAG00000007678	HBS1L	65	40.000
ENSCJAG00000022080	-	90	49.231	ENSCJAG00000018191	GSPT1	66	37.441
ENSCJAG00000022080	-	69	91.216	ENSCJAG00000038673	-	89	91.216

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000022080	-	98	91.274	ENSG00000101210	EEF1A2	100	96.226	Homo_sapiens
ENSCJAG00000022080	-	98	98.349	ENSG00000156508	EEF1A1	100	98.113	Homo_sapiens
ENSCJAG00000022080	-	99	93.192	ENSAPOG00000001301	EEF1A1	95	93.192	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000022080	-	99	93.427	ENSAPOG00000001743	eef1a1b	94	93.427	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000022080	-	96	97.837	ENSAMEG00000007786	-	89	97.837	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022080	-	99	90.443	ENSAMEG00000001552	EEF1A2	99	90.443	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022080	-	97	94.964	ENSAMEG00000003800	-	92	94.964	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022080	-	95	94.118	ENSAMEG00000014898	-	92	74.359	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022080	-	99	89.202	ENSACIG00000001197	-	92	89.202	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000022080	-	88	92.857	ENSACIG00000005630	-	91	92.857	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000022080	-	88	93.386	ENSACIG00000011859	eef1a1b	91	93.386	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000022080	-	99	90.141	ENSAOCG00000022025	-	92	90.141	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000022080	-	98	92.689	ENSAOCG00000001055	-	92	92.689	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000022080	-	99	92.958	ENSAOCG00000012886	eef1a1b	92	92.958	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000022080	-	99	92.958	ENSAPEG00000001072	eef1a1b	92	92.958	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022080	-	99	90.376	ENSAPEG00000016257	-	92	90.376	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022080	-	98	92.689	ENSAPEG00000012561	-	92	92.689	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022080	-	99	87.793	ENSAPEG00000016322	-	92	87.793	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022080	-	98	91.469	ENSATEG00000003212	-	92	89.906	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000022080	-	99	93.662	ENSATEG00000012623	EEF1A1	92	93.662	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000022080	-	99	93.192	ENSATEG00000001388	eef1a1b	92	93.192	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000022080	-	98	97.877	ENSAPLG00000009349	EEF1A1	92	97.877	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000022080	-	88	89.683	ENSAPLG00000008691	EEF1A2	91	89.683	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000022080	-	98	96.934	ENSACAG00000004556	-	92	96.934	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000022080	-	98	91.038	ENSACAG00000006007	EEF1A2	92	91.038	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000022080	-	99	93.224	ENSANAG00000020685	-	99	93.224	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022080	-	98	94.340	ENSANAG00000038380	-	96	94.340	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022080	-	96	98.068	ENSANAG00000028383	EEF1A1	94	98.068	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022080	-	81	97.414	ENSANAG00000009320	-	90	97.414	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022080	-	98	91.274	ENSANAG00000035272	EEF1A2	92	91.274	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022080	-	95	96.078	ENSANAG00000004878	-	91	86.557	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022080	-	99	89.671	ENSACLG00000022529	-	92	89.671	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000022080	-	99	93.192	ENSACLG00000007936	eef1a1b	92	93.192	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000022080	-	99	93.662	ENSACLG00000026047	EEF1A1	92	93.662	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000022080	-	98	89.412	ENSAMXG00000002854	eef1a2	92	89.412	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000022080	-	98	91.509	ENSAMXG00000029743	-	92	91.509	Astyanax_mexicanus
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ENSCJAG00000022080	-	99	93.192	ENSAMXG00000004487	EEF1A1	98	93.396	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000022080	-	98	98.349	ENSBTAG00000014534	EEF1A1	92	98.349	Bos_taurus
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ENSCJAG00000022080	-	98	97.642	ENSBTAG00000034185	-	96	97.642	Bos_taurus
ENSCJAG00000022080	-	99	88.578	ENSCAFG00000015899	-	93	88.578	Canis_familiaris
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ENSCJAG00000022080	-	98	98.349	ENSCAFG00000009708	-	92	98.349	Canis_familiaris
ENSCJAG00000022080	-	98	98.349	ENSCAFG00000018586	-	92	98.349	Canis_familiaris
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