EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000022467 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 477 bases
Position: chrNTIC01007779.1:45571311-45571787
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000041080	Ribosomal_S13	PF00416.22	4.1e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000043452	-	477	-	ENSCJAP00000041080	158 (aa)	-	F7FGD8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000022467	-	96	88.816	ENSCJAG00000036990	-	100	88.816
ENSCJAG00000022467	-	96	83.553	ENSCJAG00000010569	-	100	83.553
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCJAG00000021650	RPS18	100	92.763

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSG00000231500	RPS18	100	92.763	Homo_sapiens
ENSCJAG00000022467	-	96	90.789	ENSAPOG00000002899	rps18	100	90.789	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000022467	-	96	92.715	ENSAMEG00000001623	RPS18	99	92.715	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000022467	-	96	90.066	ENSACIG00000006284	rps18	99	90.066	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000022467	-	96	90.132	ENSAOCG00000023429	rps18	99	90.132	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000022467	-	96	90.728	ENSAPEG00000003920	rps18	99	90.132	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000022467	-	96	90.789	ENSATEG00000013099	rps18	100	90.789	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000022467	-	96	92.715	ENSACAG00000002918	-	99	92.715	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000022467	-	91	69.231	ENSANAG00000026792	-	94	69.231	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022467	-	96	86.538	ENSANAG00000019801	-	100	86.538	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022467	-	52	70.732	ENSANAG00000026116	-	100	70.732	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSANAG00000037361	RPS18	100	92.763	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022467	-	89	92.199	ENSANAG00000037092	-	99	89.041	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000022467	-	96	90.066	ENSACLG00000011011	rps18	100	90.066	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000022467	-	96	90.728	ENSAMXG00000007922	rps18	100	90.728	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSBTAG00000002648	RPS18	100	92.763	Bos_taurus
ENSCJAG00000022467	-	96	70.395	WBGene00004487	rps-18	99	70.395	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCAFG00000000950	RPS18	100	92.763	Canis_familiaris
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCAFG00020003254	RPS18	100	92.763	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000022467	-	73	80.870	ENSCHIG00000020370	-	74	80.870	Capra_hircus
ENSCJAG00000022467	-	96	92.715	ENSCHIG00000025263	RPS18	100	92.715	Capra_hircus
ENSCJAG00000022467	-	96	75.000	ENSTSYG00000034184	-	100	75.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSTSYG00000012508	RPS18	100	92.763	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000022467	-	52	91.463	ENSCAPG00000017940	RPS18	100	91.463	Cavia_aperea
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCPOG00000019675	RPS18	100	92.763	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000022467	-	84	80.451	ENSCCAG00000031676	-	100	80.451	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000022467	-	100	88.608	ENSCCAG00000020227	-	88	88.608	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCCAG00000023639	-	100	92.763	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000022467	-	52	82.927	ENSCCAG00000025007	-	100	82.927	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000022467	-	96	88.816	ENSCCAG00000020201	-	100	88.816	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000022467	-	96	71.053	ENSCCAG00000023737	-	100	71.053	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000022467	-	96	80.263	ENSCATG00000041812	-	100	80.263	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000022467	-	95	87.417	ENSCATG00000043717	-	99	87.417	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000022467	-	96	90.789	ENSCATG00000022293	-	100	90.789	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCATG00000016639	RPS18	100	92.763	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000022467	-	96	88.816	ENSCATG00000019681	-	100	88.816	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCLAG00000008982	-	100	92.763	Chinchilla_lanigera
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ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCPBG00000003985	RPS18	100	92.763	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000022467	-	96	60.526	ENSCSAVG00000005312	-	96	60.526	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSCANG00000034505	-	100	92.763	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000022467	-	96	92.105	ENSCANG00000019235	-	100	92.105	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000022467	-	96	84.106	ENSCANG00000006145	-	78	84.106	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000022467	-	96	82.237	ENSCANG00000004356	-	100	82.237	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000022467	-	96	76.974	ENSCANG00000034197	-	100	76.974	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSCJAG00000022467	-	96	90.132	ENSCSEG00000018231	rps18	99	90.132	Cynoglossus_semilaevis
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ENSCJAG00000022467	-	96	90.789	ENSGAFG00000000771	rps18	100	90.789	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000022467	-	96	90.789	ENSGACG00000009814	rps18	100	90.789	Gasterosteus_aculeatus
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ENSCJAG00000022467	-	96	88.816	ENSGGOG00000028326	-	100	88.816	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000022467	-	97	89.610	ENSGGOG00000024459	-	100	89.610	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSGGOG00000006571	RPS18	100	92.763	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000022467	-	96	90.132	ENSHBUG00000012896	rps18	100	90.132	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000022467	-	96	78.947	ENSSTOG00000019434	-	100	78.947	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSCJAG00000022467	-	96	92.763	ENSJJAG00000018899	-	100	92.763	Jaculus_jaculus
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ENSCJAG00000022467	-	96	90.789	ENSKMAG00000014119	rps18	100	90.789	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000022467	-	96	90.132	ENSLBEG00000022471	rps18	100	90.132	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000022467	-	81	94.531	ENSLACG00000010919	RPS18	100	94.531	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000022467	-	71	66.071	ENSLAFG00000026586	-	100	66.071	Loxodonta_africana
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