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Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000035190 (Gene tree)
Gene ID: 100414352
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5514 bases
Position: chrNTIC01011112.1:48172157-48177670
Accession: 100414352
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000062792	eRF1_2	PF03464.15	4.7e-37	1	1
ENSCJAP00000002698	eRF1_2	PF03464.15	3.2e-31	1	1
ENSCJAP00000062792	eRF1_3	PF03465.15	1.2e-26	1	1
ENSCJAP00000002698	eRF1_1	PF03463.15	1.6e-53	1	1
ENSCJAP00000062792	eRF1_1	PF03463.15	3.4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000002847	PELO-202	759	-	ENSCJAP00000002698	252 (aa)	-	F7HXD2
ENSCJAT00000070446	PELO-201	4154	-	ENSCJAP00000062792	385 (aa)	XP_002745035	U3C932

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cjc03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.221	ENSG00000152684	PELO	100	99.221	Homo_sapiens
ENSCJAG00000035190	PELO	96	80.498	ENSAPOG00000023700	-	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000035190	PELO	96	80.498	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000035190	PELO	96	81.743	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.260	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.260	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.260	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.260	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000035190	PELO	77	85.235	ENSAPLG00000013265	PELO	100	85.235	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000035190	PELO	98	90.426	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.130	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSANAG00000014096	PELO	100	99.740	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000035190	PELO	97	80.697	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	Bos_taurus
ENSCJAG00000035190	PELO	99	58.268	WBGene00011280	pelo-1	100	58.268	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.701	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.701	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	Capra_hircus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.961	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	100.000	ENSCCAG00000035600	PELO	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSCATG00000011829	PELO	100	99.740	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.740	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.182	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.182	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000035190	PELO	98	93.883	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000035190	PELO	100	67.857	ENSCING00000001979	-	100	69.610	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	69.610	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.610	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSCANG00000023382	PELO	100	99.740	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	96.104	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.403	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000035190	PELO	100	79.481	ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.481	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	Danio_rerio
ENSCJAG00000035190	PELO	100	96.114	ENSDNOG00000036721	PELO	100	96.114	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000035190	PELO	100	67.063	FBgn0011207	pelo	96	67.546	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000035190	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.442	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.260	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	Esox_lucius
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.182	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.182	Felis_catus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	94.805	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000035190	PELO	99	96.000	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.887	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	79.481	ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000035190	PELO	98	79.841	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.740	Gadus_morhua
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.519	ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000035190	PELO	98	94.149	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSGGOG00000012635	PELO	100	99.740	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.442	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000035190	PELO	100	96.104	ENSHGLG00100017627	PELO	100	96.104	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000035190	PELO	100	77.403	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000035190	PELO	100	79.221	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.221	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	94.805	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.805	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000035190	PELO	99	80.208	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.701	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.701	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSMFAG00000000651	PELO	100	99.740	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSMMUG00000039101	PELO	100	99.740	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSMNEG00000035538	PELO	100	99.740	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSMLEG00000039113	PELO	100	99.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000035190	PELO	97	82.574	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	Mastacembelus_armatus
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ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.403	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	97.403	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.961	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.662	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000035190	PELO	100	78.961	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.961	Mola_mola
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ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.662	Mus_caroli
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.662	Mus_musculus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.922	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.922	Mus_pahari
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.662	Mus_spretus
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ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSNLEG00000035970	PELO	100	99.740	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000035190	PELO	100	95.065	ENSMEUG00000005468	PELO	100	95.065	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000035190	PELO	98	97.361	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.361	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	Octodon_degus
ENSCJAG00000035190	PELO	96	80.270	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.000	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.818	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000035190	PELO	100	82.078	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.078	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.182	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.182	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.961	Ovis_aries
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSPPAG00000038951	PELO	100	99.740	Pan_paniscus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.182	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.182	Panthera_pardus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.182	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.481	ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.481	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSPANG00000010902	PELO	100	99.740	Papio_anubis
ENSCJAG00000035190	PELO	100	82.338	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000035190	PELO	98	93.617	ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000035190	PELO	96	78.008	ENSPMGG00000014561	pelo	95	77.907	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.403	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.403	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000035190	PELO	100	96.883	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.883	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.299	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.481	ENSPPYG00000015451	PELO	96	99.481	Pongo_abelii
ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.961	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000035190	PELO	97	81.233	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.000	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.403	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.403	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	ENSRBIG00000007299	PELO	100	99.740	Rhinopithecus_bieti
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