EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000038205 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 483 bases
Position: chrNTIC01022223.1:124721515-124721997
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000065893	Ribosomal_L21e	PF01157.18	2.1e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000072886	-	483	-	ENSCJAP00000065893	160 (aa)	-	A0A2R8MW88

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000038205	-	67	79.439	ENSCJAG00000041707	-	98	79.439
ENSCJAG00000038205	-	92	97.959	ENSCJAG00000039102	-	100	97.959
ENSCJAG00000038205	-	100	70.000	ENSCJAG00000044477	-	100	70.000
ENSCJAG00000038205	-	100	91.250	ENSCJAG00000019734	-	100	91.250
ENSCJAG00000038205	-	100	98.125	ENSCJAG00000043116	-	100	98.125
ENSCJAG00000038205	-	100	80.000	ENSCJAG00000044730	-	100	80.000
ENSCJAG00000038205	-	88	92.857	ENSCJAG00000044684	-	98	92.857

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000038205	-	100	98.750	ENSG00000122026	RPL21	100	98.750	Homo_sapiens
ENSCJAG00000038205	-	100	85.000	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	85.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000038205	-	51	93.827	ENSAMEG00000016455	-	96	94.118	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000038205	-	100	59.375	ENSAMEG00000004632	-	100	59.375	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000038205	-	100	95.625	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	95.625	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000038205	-	100	78.882	ENSAMEG00000004710	-	100	78.882	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000038205	-	100	86.875	ENSACIG00000021885	rpl21	100	86.875	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000038205	-	100	85.000	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	85.000	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000038205	-	100	85.000	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	85.000	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000038205	-	100	86.875	ENSATEG00000010524	rpl21	100	86.875	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000038205	-	100	93.125	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	93.125	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000038205	-	100	92.500	ENSACAG00000003169	RPL21	100	92.500	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000038205	-	100	93.750	ENSANAG00000019962	-	100	93.750	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	100	98.750	ENSANAG00000023031	-	100	98.750	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	100	96.250	ENSANAG00000006331	-	100	96.250	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	97	98.065	ENSANAG00000012283	-	100	98.065	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	100	96.250	ENSANAG00000020005	-	100	96.250	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	100	96.875	ENSANAG00000031513	-	100	96.875	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	100	96.875	ENSANAG00000031230	-	100	96.875	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000038205	-	100	86.875	ENSACLG00000026444	rpl21	100	86.875	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000038205	-	100	83.750	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	83.750	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000038205	-	100	95.625	ENSBTAG00000038379	-	100	95.625	Bos_taurus
ENSCJAG00000038205	-	51	91.358	ENSBTAG00000048537	-	84	91.358	Bos_taurus
ENSCJAG00000038205	-	100	97.500	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	97.500	Bos_taurus
ENSCJAG00000038205	-	100	62.733	WBGene00004433	rpl-21	100	62.733	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000038205	-	100	97.531	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	97.531	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	100	95.000	ENSCAFG00000015987	-	100	95.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	76	93.443	ENSCAFG00000015533	-	88	93.443	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	99	68.354	ENSCAFG00000024055	-	99	68.354	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	73	96.581	ENSCAFG00000029659	-	99	96.581	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	96	65.161	ENSCAFG00000018881	-	97	65.161	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	99	89.308	ENSCAFG00000001564	-	99	89.308	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	100	97.500	ENSCAFG00000032537	-	100	97.500	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	100	98.125	ENSCAFG00000008805	-	100	98.125	Canis_familiaris
ENSCJAG00000038205	-	100	97.500	ENSCAFG00000028744	-	100	97.500	Canis_familiaris
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