EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000039096 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: 40S ribosomal protein S29
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17677 bases
Position: chrNTIC01038834.1:54483101-54500777
Accession: 100896043
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000032023	Ribosomal_S14	PF00253.21	5.3e-15	1	1
ENSCJAP00000063985	Ribosomal_S14	PF00253.21	1.5e-14	1	1
ENSCJAP00000058158	Ribosomal_S14	PF00253.21	3.3e-14	1	1
ENSCJAP00000056428	Ribosomal_S14	PF00253.21	5.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000033847	-	171	-	ENSCJAP00000032023	56 (aa)	XP_003734787	F7D3P5
ENSCJAT00000082983	-	4905	-	ENSCJAP00000058158	102 (aa)	-	A0A2R8ME21
ENSCJAT00000067734	-	162	-	ENSCJAP00000056428	53 (aa)	-	A0A2R8MAJ1
ENSCJAT00000078491	-	204	-	ENSCJAP00000063985	68 (aa)	-	A0A2R8MRL6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000039096	-	100	91.071	ENSCJAG00000031814	-	100	91.071

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000039096	-	100	92.857	ENSACIG00000003518	rps29	73	96.364	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSANAG00000024423	-	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000039096	-	85	78.261	ENSACLG00000000915	rps29	54	78.261	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSBTAG00000052337	RPS29	100	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000039096	-	98	78.182	ENSCAFG00020021989	-	54	77.966	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000039096	-	100	92.857	ENSCAFG00020003021	-	100	92.857	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000039096	-	100	83.929	ENSCAFG00020002956	-	100	83.929	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000039096	-	100	94.643	ENSCHIG00000010682	-	100	94.643	Capra_hircus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSTSYG00000030415	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000039096	-	100	76.786	ENSTSYG00000012410	-	100	76.786	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCPOG00000032637	-	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSCCAG00000032225	-	100	98.214	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSCCAG00000019847	-	100	98.214	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCCAG00000032090	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCCAG00000001210	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSCCAG00000020608	-	100	98.214	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCCAG00000019033	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000039096	-	100	71.429	ENSCATG00000041319	-	100	71.429	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCATG00000017816	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCATG00000011469	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCSAG00000015276	-	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000039096	-	91	76.471	ENSCHOG00000011358	-	93	76.471	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCPBG00000018320	-	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000039096	-	100	91.071	ENSCPBG00000019385	-	100	91.071	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000039096	-	98	76.364	ENSCPBG00000015078	-	71	74.194	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCANG00000019407	-	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCANG00000037526	-	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSCANG00000010019	-	100	98.214	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000039096	-	100	87.500	ENSCGRG00001005461	-	100	87.500	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000039096	-	100	82.143	ENSCGRG00001000990	-	66	82.143	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000039096	-	100	89.286	ENSCGRG00001010167	-	100	89.286	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSCGRG00001001537	-	92	98.214	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSCGRG00001020113	Rps29	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000039096	-	100	82.143	ENSCGRG00000019197	-	66	82.143	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000039096	-	100	89.286	ENSCGRG00000019055	-	100	89.286	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000039096	-	100	73.214	ENSCGRG00000009208	-	100	73.214	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSCGRG00000018591	-	92	98.214	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSCJAG00000039096	-	98	96.364	ENSCSEG00000001818	rps29	60	98.182	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000039096	-	100	96.429	ENSDARG00000041232	rps29	100	96.429	Danio_rerio
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ENSCJAG00000039096	-	100	85.000	ENSDORG00000013874	-	100	85.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000039096	-	100	91.071	ENSDORG00000026532	-	100	91.071	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000039096	-	100	83.929	ENSEBUG00000011966	rps29	66	84.211	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000039096	-	98	96.364	ENSEASG00005007821	-	71	93.548	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000039096	-	98	67.273	ENSEASG00005020582	-	95	67.273	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000039096	-	98	96.364	ENSECAG00000011782	RPS29	71	93.548	Equus_caballus
ENSCJAG00000039096	-	100	80.357	ENSFCAG00000024162	-	100	80.357	Felis_catus
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ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSFALG00000001738	-	92	100.000	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSGACG00000012858	rps29	100	98.214	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000039096	-	84	95.745	ENSGAGG00000025088	-	57	95.745	Gopherus_agassizii
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ENSCJAG00000039096	-	100	96.429	ENSGGOG00000042896	-	100	96.429	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSGGOG00000042996	-	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000039096	-	100	96.429	ENSHBUG00000018115	rps29	100	96.429	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000039096	-	100	98.214	ENSMMUG00000040278	-	100	98.214	Macaca_mulatta
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ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSMMUG00000008939	-	100	100.000	Macaca_mulatta
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ENSCJAG00000039096	-	100	89.286	ENSMAUG00000005362	-	100	89.286	Mesocricetus_auratus
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ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSMICG00000045654	-	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSMOCG00000017681	Rps29	100	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000039096	-	96	100.000	ENSMMOG00000005119	rps29	51	100.000	Mola_mola
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ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSMUSG00000034892	Rps29	100	100.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0029551	-	100	100.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0018641	Rps29	100	100.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000039096	-	100	91.071	MGP_SPRETEiJ_G0019597	-	92	91.071	Mus_spretus
ENSCJAG00000039096	-	100	91.071	ENSMLUG00000029871	-	100	91.071	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSMLUG00000025262	-	100	100.000	Myotis_lucifugus
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ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSNGAG00000013159	Rps29	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000039096	-	100	80.357	ENSNGAG00000011632	-	100	80.357	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000039096	-	100	92.857	ENSNBRG00000021854	rps29	100	65.169	Neolamprologus_brichardi
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ENSCJAG00000039096	-	100	100.000	ENSPTIG00000006207	-	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000039096	-	100	89.286	ENSPANG00000029212	-	100	89.286	Papio_anubis
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